| 致谢 | 第3-4页 |
| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 第一章 前言 | 第8-17页 |
| 1.1 伸展蛋白概述 | 第8-12页 |
| 1.1.1 伸展蛋白的结构 | 第8-10页 |
| 1.1.2 伸展蛋白的功能 | 第10-12页 |
| 1.1.3 伸展蛋白研究情况简介 | 第12页 |
| 1.2 基于SNP的连锁不平衡分析 | 第12-15页 |
| 1.2.1 SNP | 第12-13页 |
| 1.2.2 连锁不平衡 | 第13-14页 |
| 1.2.3 单倍型 | 第14-15页 |
| 1.3 “Universal Tailed”法测序 | 第15-16页 |
| 1.4 本研究的目的意义 | 第16-17页 |
| 第二章 美洲黑杨伸展蛋白基因家族高通量测序 | 第17-36页 |
| 2.1 材料与试剂 | 第17页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第17页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第17页 |
| 2.1.3 主要仪器 | 第17页 |
| 2.2 实验引物 | 第17-19页 |
| 2.2.1 伸展蛋白基因引物 | 第17-18页 |
| 2.2.2 基于“Universal Tailed”扩增方法的两轮PCR引物 | 第18-19页 |
| 2.3 实验方法 | 第19-31页 |
| 2.3.1 DNA的提取 | 第19页 |
| 2.3.2 基因组DNA质量检测 | 第19页 |
| 2.3.3 PCR扩增 | 第19-22页 |
| 2.3.4 PCR产物纯化和文库建立 | 第22-23页 |
| 2.3.5 TBS 380荧光定量 | 第23页 |
| 2.3.6 Agilent 2100 Bioanalyzer文库质量检测 | 第23页 |
| 2.3.7 emPCR-SV确定最佳上样量 | 第23-27页 |
| 2.3.8 测序emPCR-MV | 第27-29页 |
| 2.3.9 测序 | 第29-31页 |
| 2.3.10 测序数据处理和分析 | 第31页 |
| 2.4 结果 | 第31-35页 |
| 2.4.1 DNA质量检测 | 第31页 |
| 2.4.2 PCR扩增 | 第31-32页 |
| 2.4.3 TBS380荧光定量 | 第32-33页 |
| 2.4.4 测序文库质量检测 | 第33-34页 |
| 2.4.5 测序结果 | 第34-35页 |
| 2.5 讨论 | 第35-36页 |
| 第三章 美洲黑杨伸展蛋白基因家族SNP及InDel序列特征分析 | 第36-48页 |
| 3.1 SNP和InDel的查找 | 第36页 |
| 3.2 PdEXT基因家族SNP和InDel统计结果与分析 | 第36-43页 |
| 3.2.1 PdEXT6基因SNP和InDel统计结果与分析 | 第36-37页 |
| 3.2.2 PdEXT18基因SNP和InDel统计结果与分析 | 第37页 |
| 3.2.3 PdEXT22基因SNP和InDel统计结果与分析 | 第37-38页 |
| 3.2.4 PdEXT25基因SNP和InDel统计结果与分析 | 第38-39页 |
| 3.2.5 PdEXT29基因SNP和InDel统计结果与分析 | 第39-40页 |
| 3.2.6 PdEXT32基因SNP和InDel统计结果与分析 | 第40-41页 |
| 3.2.7 PdEXT34基因SNP和InDel统计结果与分析 | 第41-42页 |
| 3.2.8 PdEXT40基因SNP和InDel统计结果与分析 | 第42页 |
| 3.2.9 PdEXT41基因SNP和InDel统计结果与分析 | 第42-43页 |
| 3.3 PdEXT基因LD与单倍型分析 | 第43-45页 |
| 3.4 讨论 | 第45-48页 |
| 3.4.1 PdEXT基因序列SNP多态性分析与讨论 | 第45-46页 |
| 3.4.2 PdEXT基因序列InDel多态性分析与讨论 | 第46-47页 |
| 3.4.3 部分PdEXT基因LD分析与讨论 | 第47-48页 |
| 第四章 主要研究成果及展望 | 第48-50页 |
| 4.1 主要研究成果 | 第48-49页 |
| 4.2 展望 | 第49-50页 |
| 附件 | 第50-56页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-61页 |
