| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 1 文献综述 | 第12-20页 |
| 1.1 竹类植物在不同层面的研究简述 | 第12-16页 |
| 1.1.1 竹类植物在形态学方面的研究 | 第12页 |
| 1.1.2 竹类植物在生理生化方面的研究 | 第12-13页 |
| 1.1.3 竹类植物在分子生物学方面的研究 | 第13页 |
| 1.1.4 竹类植物在组学层面的研究 | 第13-16页 |
| 1.1.4.1 竹类植物在EST测序方面的研究 | 第13-14页 |
| 1.1.4.2 竹类植物在转录组方面的研究 | 第14页 |
| 1.1.4.3 竹类植物在small RNA组方面的研究 | 第14-15页 |
| 1.1.4.4 竹类植物在细胞器组方面的研究 | 第15页 |
| 1.1.4.5 竹类植物在基因组方面的研究 | 第15-16页 |
| 1.1.4.6 竹类植物在蛋白组方面的研究 | 第16页 |
| 1.2 高等植物成花诱导途径研究进展 | 第16-19页 |
| 1.2.1 光周期影响开花现象 | 第16-17页 |
| 1.2.2 温度影响开花现象 | 第17页 |
| 1.2.3 自主途径影响开花现象 | 第17-18页 |
| 1.2.4 植物激素影响开花现象 | 第18-19页 |
| 1.3 竹类成花研究的理论意义 | 第19-20页 |
| 2 RNA-SEQ测序分析 | 第20-47页 |
| 2.1 材料与方法 | 第20-23页 |
| 2.1.1 样本前期准备与采取 | 第20页 |
| 2.1.2 测序与拼接 | 第20页 |
| 2.1.3 基因功能注释 | 第20-21页 |
| 2.1.4 差异基因的功能分析 | 第21页 |
| 2.1.5 与成花相关的通路及花粉基因的分析 | 第21页 |
| 2.1.6 实时定量PCR | 第21-23页 |
| 2.1.6.1 RNA提取准备工作 | 第21-22页 |
| 2.1.6.2 RNA的提取与检测 | 第22页 |
| 2.1.6.3 RNA的反转录 | 第22-23页 |
| 2.1.6.4 实时定量 | 第23页 |
| 2.2 结果与分析 | 第23-45页 |
| 2.2.1 样本形态学特征 | 第23-24页 |
| 2.2.2 测序与拼接 | 第24-25页 |
| 2.2.3 基因功能注释 | 第25-27页 |
| 2.2.3.1 基因注释统计 | 第25页 |
| 2.2.3.2 所有基因的GO功能分类 | 第25-26页 |
| 2.2.3.3 所有基因的KOG功能分类 | 第26-27页 |
| 2.2.3.4 所有基因的KEGG分类 | 第27页 |
| 2.2.4 差异基因的筛选与功能分析 | 第27-39页 |
| 2.2.4.1 TF_2 vs. TF_1 功能富集分析 | 第27-28页 |
| 2.2.4.2 TF_3 vs. TF_1 功能富集分析 | 第28-29页 |
| 2.2.4.3 TF_3 vs. TF_2 功能富集分析 | 第29页 |
| 2.2.4.4 TF_23 vs. TF_1 功能富集分析 | 第29-30页 |
| 2.2.4.5 TF_13 vs. TF_2 功能富集分析 | 第30-31页 |
| 2.2.4.6 TF_12 vs. TF_3 功能富集分析 | 第31页 |
| 2.2.4.7 TV_2 vs. TV_1 功能富集分析 | 第31-32页 |
| 2.2.4.8 TV_3 vs. TV_1 功能富集分析 | 第32-33页 |
| 2.2.4.9 TV_3 vs. TV_2 功能富集分析 | 第33页 |
| 2.2.4.10 TV_23 vs. TV_1 功能富集分析 | 第33-34页 |
| 2.2.4.11 TV13 vs. TV_2 功能富集分析 | 第34-35页 |
| 2.2.4.12 TV_12 vs. TV_3 功能富集分析 | 第35-36页 |
| 2.2.4.13 TF_1 vs. TV_1 功能富集分析 | 第36-37页 |
| 2.2.4.14 F_2 vs. V_2 功能富集分析 | 第37页 |
| 2.2.4.15 TF_3 vs. TV_3 功能富集分析 | 第37-38页 |
| 2.2.4.16 TF vs. TV功能富集分析 | 第38-39页 |
| 2.2.5 与成花相关的通路分析 | 第39-44页 |
| 2.2.5.1 植物激素信号转导途径分析 | 第39-42页 |
| 2.2.5.2 昼夜节律途径分析 | 第42-44页 |
| 2.2.5.3 花粉基因分布分析 | 第44页 |
| 2.2.6 实时定量PCR的验证 | 第44-45页 |
| 2.3 小结 | 第45-47页 |
| 3 SMALL RNA-SEQ测序分析 | 第47-59页 |
| 3.1 材料与方法 | 第47-48页 |
| 3.1.1 测序材料 | 第47页 |
| 3.1.2 Small RNA注释 | 第47页 |
| 3.1.3 差异miRNA及其靶基因功能富集分析 | 第47-48页 |
| 3.1.4 差异miRNA及其差异靶基因的分析 | 第48页 |
| 3.2 结果与分析 | 第48-58页 |
| 3.2.1 Small RNA注释 | 第48-49页 |
| 3.2.2 差异miRNA的靶基因功能富集分析 | 第49-51页 |
| 3.2.3 差异miRNA及其差异靶基因的关联分析 | 第51-58页 |
| 3.2.3.1 在6个时期中显著负相关的差异miRNA及其差异靶基因 | 第51-53页 |
| 3.2.3.2 在花芽发育时期中显著负相关的差异miRNA及其差异靶基因 | 第53-54页 |
| 3.2.3.3 在叶芽发育时期中显著负相关的差异miRNA及其差异靶基因 | 第54页 |
| 3.2.3.4 在F_1 vs. V_1 中起作用的差异miRNA及其差异靶基因 | 第54-56页 |
| 3.2.3.5 在F_2 vs. F_1 中作用的差异miRNA及其差异靶基因 | 第56页 |
| 3.2.3.6 在F_3 vs. F_2 中作用的差异miRNA及其差异靶基因 | 第56-58页 |
| 3.3 小结 | 第58-59页 |
| 4 初步构建雷竹成花调控网络 | 第59-66页 |
| 4.1 材料与方法 | 第59页 |
| 4.2 结果与分析 | 第59-65页 |
| 4.3 小结 | 第65-66页 |
| 5 总结与展望 | 第66-68页 |
| 5.1 研究总结 | 第66-67页 |
| 5.2 研究展望 | 第67-68页 |
| 参考文献 | 第68-79页 |
| 附表 | 第79-93页 |
| 附表1 定量PCR引物序列 | 第79-80页 |
| 附表2 所有差异MIRNA/MRNA及在水稻中的注释 | 第80-89页 |
| 附表3 网络MODEL水稻开花基因和转录组中基因对应关系 | 第89-93页 |
| 附图 | 第93-100页 |
| 致谢 | 第100页 |
