| 摘要 | 第8-12页 |
| ABSTRACT | 第12-15页 |
| 缩略语中英文对照 | 第16-17页 |
| 第一章 文献综述 | 第17-35页 |
| 1 川陕哲罗鲑研究概况 | 第17-21页 |
| 1.1 川陕哲罗鲑简介 | 第17页 |
| 1.2 川陕哲罗鲑研究概况 | 第17-21页 |
| 2 种群遗传学 | 第21-28页 |
| 2.1 种群遗传学的定义及其研究方法 | 第21-22页 |
| 2.2 种群遗传学研究手段——分子标记概述 | 第22-26页 |
| 2.3 种群遗传学主要研究内容——遗传多样性研究概述 | 第26-28页 |
| 3 亲子鉴定原理及其应用 | 第28-29页 |
| 3.1 亲子鉴定技术原理及其操作流程 | 第28-29页 |
| 3.2 亲子鉴定技术在濒危野生动物保护中的应用 | 第29页 |
| 4 分子系统发育研究概述 | 第29-32页 |
| 4.1 分子系统发育的定义 | 第29-30页 |
| 4.2 分子系统发育的理论及其研究方法 | 第30-31页 |
| 4.3 川陕哲罗鲑分子系统发育研究进展 | 第31-32页 |
| 5 本研究的目的意义及技术路线 | 第32-35页 |
| 第二章 川陕哲罗鲑微卫星标记的开发 | 第35-49页 |
| 1 前言 | 第35-36页 |
| 2 材料与方法 | 第36-40页 |
| 2.1 实验材料与仪器 | 第36-37页 |
| 2.2 基因组DNA的提取 | 第37页 |
| 2.3 微卫星引物的设计与合成 | 第37-38页 |
| 2.4 多态微卫星引物的筛选 | 第38-40页 |
| 2.5 数据分析 | 第40页 |
| 3 结果 | 第40-46页 |
| 3.1 川陕哲罗鲑基因组DNA的提取 | 第40-41页 |
| 3.2 多态微卫星引物的筛选及微卫星标记特征 | 第41-46页 |
| 4 讨论 | 第46-47页 |
| 4.1 微卫星引物的设计 | 第46页 |
| 4.2 微卫星位点的多态性 | 第46-47页 |
| 5 小结 | 第47-49页 |
| 第三章 川陕哲罗鲑太白河野生种群遗传多样性的研究 | 第49-65页 |
| 1 前言 | 第49-50页 |
| 2 材料与方法 | 第50-53页 |
| 2.1 实验材料与仪器 | 第50页 |
| 2.2 基因组DNA的提取与PCR扩增 | 第50-52页 |
| 2.3 PCR产物检测与数据分析 | 第52-53页 |
| 3 结果 | 第53-60页 |
| 3.1 种群遗传变异分析 | 第53-55页 |
| 3.2 种群遗传结构分析 | 第55-59页 |
| 3.3 种群历史动态评估 | 第59-60页 |
| 4 讨论 | 第60-63页 |
| 4.1 川陕哲罗鲑种群遗传多样性分析 | 第60-61页 |
| 4.2 川陕哲罗鲑种群遗传分化与遗传结构分析 | 第61-62页 |
| 4.3 哈迪-温伯格平衡与种群瓶颈效应 | 第62-63页 |
| 5 小结 | 第63-65页 |
| 第四章 川陕哲罗鲑养殖群体3个家系遗传多样性及亲子鉴定技术的建立 | 第65-83页 |
| 1 前言 | 第65-66页 |
| 2 材料与方法 | 第66-70页 |
| 2.1 实验材料与仪器 | 第66-67页 |
| 2.2 微卫星标记的选取与荧光标记的合成 | 第67-68页 |
| 2.3 基因组DNA的提取 | 第68-69页 |
| 2.4 PCR扩增与产物检测 | 第69页 |
| 2.5 数据分析 | 第69-70页 |
| 3 结果 | 第70-77页 |
| 3.1 川陕哲罗鲑微卫星标记基因型测序结果 | 第70-72页 |
| 3.2 川陕哲罗鲑子一代遗传多样性分析 | 第72-74页 |
| 3.3 川陕哲罗鲑子一代与亲本群体遗传多样性参数对比 | 第74页 |
| 3.4 川陕哲罗鲑亲子鉴定结果 | 第74-77页 |
| 4 讨论 | 第77-81页 |
| 4.1 所选微卫星标记的多态性 | 第77页 |
| 4.2 微卫星标记等位基因的分型 | 第77-78页 |
| 4.3 川陕哲罗鲑人工繁殖子一代的遗传多样性 | 第78-79页 |
| 4.4 亲子鉴定的可靠性 | 第79页 |
| 4.5 对川陕哲罗鲑遗传多样性保护的建议 | 第79-81页 |
| 5 小结 | 第81-83页 |
| 第五章 秦岭地区两种鲑科鱼类——川陕哲罗鲑与秦岭细鳞鲑种群线粒体基因渐渗的研究 | 第83-91页 |
| 1 前言 | 第83-85页 |
| 2 材料与方法 | 第85-86页 |
| 2.1 实验材料与仪器 | 第85页 |
| 2.2 样本基因组的提取 | 第85页 |
| 2.3 PCR扩增与产物检测 | 第85-86页 |
| 2.4 数据分析 | 第86页 |
| 3 结果 | 第86-88页 |
| 3.1 基于线粒体DNA分子标记的两个种群遗传多样性分析 | 第86-87页 |
| 3.2 川陕哲罗鲑与秦岭细鳞鲑种群系统进化分析 | 第87-88页 |
| 4 讨论 | 第88-89页 |
| 4.1 线粒体基因渗入 | 第88-89页 |
| 4.2 川陕哲罗鲑不同种群个体差异原因推测 | 第89页 |
| 5 小结 | 第89-91页 |
| 第六章 川陕哲罗鲑分子系统发育研究 | 第91-105页 |
| 1 前言 | 第91-93页 |
| 2 材料与方法 | 第93-95页 |
| 2.1 实验材料 | 第93-94页 |
| 2.2 分析方法 | 第94-95页 |
| 3 结果 | 第95-102页 |
| 3.1 基于线粒体DNA序列全长和13个蛋白质编码基因的哲罗鲑属分子系统发育位置 | 第95-97页 |
| 3.2 基于线粒体DNA序列全长和13个蛋白质编码基因的哲罗鲑属分化年代推断 | 第97-102页 |
| 4 讨论 | 第102-104页 |
| 4.1 基于线粒体DNA的川陕哲罗鲑系统发育位置 | 第102页 |
| 4.2 基于线粒体DNA的哲罗鲑属分化年代推断 | 第102-104页 |
| 5 小结 | 第104-105页 |
| 全文结论 | 第105-107页 |
| 全文创新点 | 第107-109页 |
| 参考文献 | 第109-121页 |
| 致谢 | 第121-123页 |
| 攻读博士学位期间发表的学术论文 | 第123页 |
| 攻读博士学位期间获得的荣誉 | 第123页 |
