| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 第一章 绪论 | 第8-15页 |
| 1.1 囊泡病毒 | 第8-12页 |
| 1.1.1 囊泡病毒分类学 | 第8页 |
| 1.1.2 囊泡病毒基因组研究 | 第8-12页 |
| 1.2 核酸序列分析 | 第12-13页 |
| 1.2.1 DNA测序技术 | 第12页 |
| 1.2.2 基因组装算法 | 第12页 |
| 1.2.3 病毒基因组序列特征分析 | 第12-13页 |
| 1.3 研究目的和意义 | 第13-14页 |
| 1.3.1 研究目的 | 第13页 |
| 1.3.2 研究意义 | 第13-14页 |
| 1.4 研究内容 | 第14-15页 |
| 1.4.1 构建病毒的全基因组文库 | 第14页 |
| 1.4.2 病毒全基因组组装及分析 | 第14-15页 |
| 第二章 材料与方法 | 第15-20页 |
| 2.1 实验材料 | 第15页 |
| 2.1.1 病毒样本 | 第15页 |
| 2.1.2 主要设备 | 第15页 |
| 2.2 实验方法 | 第15-20页 |
| 2.2.1 全基因组的组装 | 第15-16页 |
| 2.2.2 密码子用法分析 | 第16-20页 |
| 第三章 结果与分析 | 第20-43页 |
| 3.1 HvAV-3f基因组核苷酸序列分析 | 第20-37页 |
| 3.1.1 HvAV-3f基因组基本组成 | 第20-22页 |
| 3.1.2 HvAV-3f与其他囊泡病毒的比较 | 第22页 |
| 3.1.3 基因对排列等图分析 | 第22-33页 |
| 3.1.4 系统进化分析 | 第33页 |
| 3.1.5 HvAV-3f特有基因 | 第33-34页 |
| 3.1.6 Bro基因 | 第34-35页 |
| 3.1.7 Apoptosis-related基因 | 第35页 |
| 3.1.8 同源重复区 | 第35-36页 |
| 3.1.9 在鳞翅目昆虫中呈现同源性的基因 | 第36-37页 |
| 3.2 密码子用法特性 | 第37-43页 |
| 3.2.1 HvAV-3f基因组核酸组成分析 | 第37-38页 |
| 3.2.2 相对同义密码子使用度分析 | 第38-40页 |
| 3.2.3 密码子使用偏性 | 第40页 |
| 3.2.4 双联碱基相对丰度分析 | 第40-43页 |
| 第四章 结论与讨论 | 第43-45页 |
| 4.1 全文小结 | 第43页 |
| 4.1.1 烟芽夜蛾囊泡病毒HvAV-3f毒株的基因组组装 | 第43页 |
| 4.1.2 烟芽夜蛾囊泡病毒HvAV-3f毒株的基因组注释 | 第43页 |
| 4.2 讨论 | 第43-44页 |
| 4.3 展望 | 第44-45页 |
| 参考文献 | 第45-54页 |
| 致谢 | 第54-55页 |
| 作者简历 | 第55页 |
