| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 缩略词表 | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-23页 |
| 1 金丝猴分类及特征 | 第11-12页 |
| 2 神农架金丝猴概述 | 第12-17页 |
| ·神农架金丝猴的简介 | 第12页 |
| ·神农架金丝猴社会结构和发育阶段 | 第12-14页 |
| ·神农架金丝猴等级地位 | 第14页 |
| ·神农架金丝猴食物和栖息地 | 第14-15页 |
| ·神农架金丝猴生长繁殖 | 第15-16页 |
| ·神农架金丝猴致危因素 | 第16页 |
| ·神农架金丝猴保护措施 | 第16页 |
| ·金丝猴相关研究 | 第16-17页 |
| 3 肠道菌群概述 | 第17-22页 |
| ·肠道菌群生物学功能 | 第17-18页 |
| ·抵抗病原微生物的定植 | 第17-18页 |
| ·维持肠道正常结构和生理功能机理 | 第18页 |
| ·调节免疫功能 | 第18页 |
| ·肠道菌群失调导致的疾病 | 第18-20页 |
| ·腹泻 | 第18-19页 |
| ·便秘 | 第19页 |
| ·肝脏疾病 | 第19页 |
| ·变应性疾病 | 第19-20页 |
| ·肠道微生物随年龄的变化 | 第20页 |
| ·肠道微生物研究方法 | 第20-21页 |
| ·传统培养方法 | 第20-21页 |
| ·分子生物学研究方法 | 第21页 |
| ·测序技术和分析 | 第21页 |
| ·肠道微生物研究现状 | 第21-22页 |
| ·人体肠道微生物研究现状 | 第21-22页 |
| ·金丝猴肠道微生物研究现状 | 第22页 |
| 4 本研究的目的与意义 | 第22-23页 |
| 第二章PCR-DGGE方法研究不同年龄段金丝猴肠道菌群的组成 | 第23-36页 |
| 1 研究目的和意义 | 第23页 |
| 2 实验材料 | 第23-25页 |
| ·采样前的准备与样品收集 | 第23-24页 |
| ·主要仪器设备 | 第24页 |
| ·主要试剂及溶液的配制 | 第24-25页 |
| 3 变性梯度凝胶电泳 | 第25-29页 |
| ·基因组的提取 | 第25-26页 |
| ·基因组 16S rDNA V3 区片段的扩增 | 第26-27页 |
| ·PCR-DGGE指纹图谱 | 第27-29页 |
| ·平行胶制备 | 第27-28页 |
| ·银染法染色 | 第28页 |
| ·PCR-DGGE指纹图谱中优势条带的回收与测序 | 第28-29页 |
| ·样品的多样性指数计算方法 | 第29页 |
| 4 结果与分析 | 第29-35页 |
| ·DNA提取结果 | 第29-30页 |
| ·细菌 16S rDNA V3 区的PCR扩增结果 | 第30页 |
| ·PCR-DGGE指纹图谱结果及回收条带选择 | 第30-31页 |
| ·回收条带分类地位和比例 | 第31-33页 |
| ·样品的多样性指数计算结果 | 第33-35页 |
| 5 讨论 | 第35页 |
| 6 小结 | 第35-36页 |
| 第三章 高通量测序方法研究不同年龄段金丝猴肠道菌群的组成及差异 | 第36-51页 |
| 1 研究目的和意义 | 第36页 |
| 2 实验材料 | 第36-37页 |
| ·采样前期工作 | 第36-37页 |
| ·粪便的收集 | 第37页 |
| ·样品分组 | 第37页 |
| 3 实验方法 | 第37-40页 |
| ·基因组的提取和 16S rDNA V4 区片段的扩增 | 第38页 |
| ·基本信息描述 | 第38页 |
| ·测序数据处理 | 第38页 |
| ·OTU分析 | 第38-39页 |
| ·物种注释 | 第39页 |
| ·物种丰度聚类 | 第39页 |
| ·稀释曲线 | 第39-40页 |
| ·丰度分布曲线 | 第40页 |
| ·聚类分析 | 第40页 |
| 4 结果与分析 | 第40-46页 |
| ·高通量测序后序列筛选 | 第40页 |
| ·OTUs柱状图和韦恩图 | 第40-41页 |
| ·物种注释结果 | 第41-42页 |
| ·优势物种组成 | 第42-43页 |
| ·物种丰度聚类 | 第43-44页 |
| ·丰度分布曲线 | 第44-45页 |
| ·聚类分析 | 第45页 |
| ·稀释曲线 | 第45-46页 |
| 5 讨论 | 第46-49页 |
| 6 研究展望 | 第49-50页 |
| 7 小结 | 第50-51页 |
| 结论 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-59页 |
| 附录 | 第59-92页 |
| 附表1物种在门水平上的分类 | 第59-61页 |
| 附表2物种的分类地位 | 第61-83页 |
| 附录 3 PCR-DGGE回收得到的36条序列 | 第83-92页 |
| 致谢 | 第92页 |
