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Importinβ蛋白负调节拟南芥microRNA活性机理研究

摘要第1-4页
Abstract第4-9页
第一章 研究背景及意义第9-26页
   ·研究背景第9-25页
     ·miRNA的产生第10-14页
       ·植物MIR基因的起源与进化第10-11页
       ·植物miRNA的定义标准第11-12页
       ·植物miRNA的产生以及稳定第12-14页
     ·RISC复合体的形成第14-18页
       ·Argonaute蛋白结构特点第14-15页
       ·sRNA的分拣机制第15-17页
       ·RISC复合体的形成第17-18页
     ·植物miRNA的功能第18-23页
       ·植物miRNA调节基因的表达第18-22页
       ·植物miRNA切割非编码RNA产生次级siRNA第22-23页
     ·植物miRNA功能的调节第23-25页
   ·本研究的意义第25-26页
第二章 实验材料与实验方法第26-52页
   ·实验材料第26页
     ·植物材料第26页
     ·酶与生化试剂第26页
   ·实验方法第26-52页
     ·植物培养第26-27页
       ·培养土中拟南芥的培养第26-27页
       ·1/2MS培养基中拟南芥的培养第27页
       ·ABA处理拟南芥幼苗第27页
     ·突变体的筛选第27-28页
       ·amiR-triOX转基因系的获得第27-28页
       ·EMS诱变第28页
     ·荧光半定量PCR检测miRNA靶基因的表达第28-31页
       ·植物总RNA的提取第28-29页
       ·DNA酶消化总RNA中的DNA第29页
       ·RNA反转录合成cDNA的第一链第29-30页
       ·荧光半定量PCR第30-31页
     ·Northern blot检测miRNA的表达第31-34页
       ·植物小RNA的提取第31页
       ·小RNA的垂直板电泳第31-32页
       ·转膜第32-33页
       ·探针标记和杂交第33页
       ·洗膜和显影第33-34页
     ·图位克隆第34页
       ·FTA(Whatman)卡提取植物基因组DNA第34页
     ·载体构建第34-38页
       ·PCR扩增目标片段第34-35页
       ·PCR产物的琼脂糖凝胶纯化第35-36页
       ·酶切第36页
       ·连接第36页
       ·大肠杆菌热激转化第36-37页
       ·碱裂解法小量提取大肠杆菌质粒第37页
       ·LR重组反应第37-38页
     ·DNA甲基化检测第38-41页
       ·植物基因组DNA的提取第38-39页
       ·硫酸氢钠修饰基因组DNA第39-40页
       ·PCR反应和测序第40-41页
     ·拟南芥原生质体瞬时表达第41-44页
       ·质粒粗提物的提取第41-42页
       ·氯化铯密度梯度离心与质粒纯化第42页
       ·原生质体制备和转化第42-44页
     ·拟南芥AGO1抗体的纯化和免疫共沉淀第44-48页
       ·拟南芥AGO1抗体的制备第44-48页
     ·拟南芥AGO1蛋白和sRNA结合活性与切割活性检测第48-50页
       ·MiRNA靶基因的转录纯化第48-49页
       ·拟南芥AGO1蛋白切割活性检测第49-50页
       ·IP-northern第50页
     ·AGO1与EMA1免疫共沉淀第50-51页
     ·分离拟南芥细胞的细胞核和细胞质第51-52页
第三章 实验结果与讨论第52-73页
   ·实验结果第52-69页
     ·遗传筛选体系的建立以及突变体的筛选第52-60页
       ·amiR-triOX转基因系的建立第52页
       ·突变体的挑选第52-54页
       ·ema1-1突变体的鉴定以及图位克隆第54-59页
       ·小结第59-60页
     ·EMA1编码一个Importin β蛋白第60-64页
       ·emal-1对ABA的敏感性分析第60-61页
       ·T-DNA突变体sad2-5对miRNA通路的影响第61-63页
       ·超表达EMA1对miRNA通路的影响第63页
       ·小结第63-64页
     ·EMA1与miRNA通路成员的遗传关系第64-66页
       ·emal突变部分挽救hyl1-2突变体的表型第64-65页
       ·emal突变不能挽救agol-25突变体的表型第65页
       ·小结第65-66页
     ·SAD2/EMA1在miRNA通路中的功能研究第66-69页
       ·emal-1突变体中AGO1和miRNAs的积累水平不变第66-67页
       ·emal-1突变体中AGO1和miRNAs在核质中的分布不变第67页
       ·emal突变增强了AGO1结合miRNAs和ta-siRNAs的能力和RISC的切割活性第67-69页
       ·小结第69页
   ·讨论第69-73页
参考文献第73-89页
附录第89-99页
作者简介第99-101页
致谢第101-103页

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