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放线菌DNA-DNA微孔板杂交法优化及菌株HA11090和HA11110的鉴定

摘要第1-6页
Abstract第6-11页
1 引言第11-21页
   ·放线菌分类学的发展和研究意义第11-13页
     ·放线菌分类学的发展第11-12页
     ·放线菌分类学的研究意义第12-13页
   ·放线菌的分类技术第13-18页
     ·经典分类第13-14页
     ·化学分类第14-15页
     ·分子指征分析第15-18页
       ·16S rRNA基因序列分析第15-16页
       ·DNA(G+C)mol%测定第16-17页
       ·DNA同源性分析第17-18页
   ·DNA-DNA杂交技术第18-20页
     ·液相复性速率法第18-19页
     ·S_1核酸酶保护法第19页
     ·羟磷灰石法第19页
     ·微孔板杂交法第19页
     ·尼龙膜杂交法第19-20页
   ·本论文的研究目的及意义第20-21页
2 材料和方法第21-40页
   ·实验材料第21-27页
     ·主要仪器第21-22页
     ·主要试剂第22-23页
     ·主要试剂配方第23-24页
       ·杂交试剂第23页
       ·DNA提取试剂第23-24页
     ·培养基第24-25页
     ·实验菌株第25-27页
   ·DNA-DNA杂交示意图第27页
   ·实验方法第27-40页
     ·DNA-DNA杂交步骤及优化第27-32页
       ·放线菌基因组DNA的提取第27-30页
       ·DNA的固定第30页
       ·DNA的标记第30-31页
       ·DNA的剪切第31页
       ·预杂交第31页
       ·杂交第31页
       ·显色与检测第31-32页
       ·杂交结果计算第32页
     ·7 株放线菌DNA同源性检测第32-33页
       ·DNA(G+C)mol%的测定第32-33页
       ·杂交温度的计算第33页
       ·DNA-DNA杂交第33页
     ·菌株HA11090和HA11110的鉴定第33-40页
       ·形态特征第33页
       ·生理生化特征第33-35页
       ·化学组分特征第35-38页
       ·分子特征第38-40页
3 结果第40-59页
   ·DNA-DNA杂交条件优化第40-43页
     ·基因组DNA的提取第40-41页
     ·超声波剪切DNA第41-42页
     ·固定DNA的干燥条件第42-43页
     ·标记物浓度的确定第43页
   ·待测菌株DNA同源性分析第43-49页
     ·基因组DNA的检测第43-45页
     ·杂交温度的计算第45-47页
       ·DNA的(G+C)mol%含量第45-46页
       ·杂交温度第46-47页
     ·标记DNA的剪切第47-48页
     ·DNA-DNA微孔板杂交结果第48-49页
   ·菌株HA11090和HA11110的鉴定第49-59页
     ·形态和培养特征第49-50页
     ·生理生化特征第50-52页
     ·化学组分分析第52-54页
       ·脂肪酸分析结果第52-53页
       ·磷酸类脂分析结果第53-54页
     ·分子鉴定结果第54-57页
       ·16S rRNA基因序列测定及系统发育分析第54-56页
       ·(G+C)mol%含量第56页
       ·DNA同源性第56-57页
     ·菌株HA11090的鉴定结果第57页
     ·菌株HA11110的鉴定结果第57-59页
4 讨论第59-62页
   ·影响DNA-DNA杂交的因素第59-61页
     ·DNA的纯度第59页
     ·杂交温度第59-60页
     ·预杂交第60页
     ·杂交时间第60页
     ·洗脱强度第60-61页
   ·多相分类研究需注意的细节第61-62页
5 结论第62-64页
   ·DNA杂交条件优化第62页
   ·7 株放线菌与其模式菌的DNA同源性第62页
   ·菌株HA11090的鉴定结果第62-63页
   ·菌株HA11110的鉴定结果第63-64页
参考文献第64-71页
附录:7株待测菌株的(G+C)mol% HPLC图谱第71-75页
致谢第75页

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