| 致谢 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-9页 |
| Abstract | 第9-12页 |
| 目录 | 第12-16页 |
| 第一章 绪论 | 第16-34页 |
| ·引言 | 第16-17页 |
| ·分子标记的发展 | 第17-25页 |
| ·单核甘酸多态性 SNP | 第18-25页 |
| ·SNPs 检测方法 | 第19-23页 |
| ·SNPs 在遗传育种中应用 | 第23-25页 |
| ·虾类免疫系统概述 | 第25-33页 |
| ·物理屏障 | 第25页 |
| ·细胞介导的免疫防御 | 第25-26页 |
| ·体液免疫 | 第26-30页 |
| ·酚氧化酶原 (proPO)系统 | 第26-27页 |
| ·凝结系统 | 第27页 |
| ·其他体液免疫因子 | 第27-30页 |
| ·免疫调节通路 | 第30-33页 |
| ·本研究的目的与意义 | 第33-34页 |
| 第二章 凡纳滨对虾免疫相关基因 SNPs 的验证与筛选 | 第34-41页 |
| ·实验材料 | 第34-37页 |
| ·对虾基因组 DNA | 第34页 |
| ·实验用引物 | 第34-37页 |
| ·实验方法 | 第37页 |
| ·SNPs 验证及高质量 SNPs 筛选 | 第37页 |
| ·数据分析 | 第37页 |
| ·实验结果 | 第37-40页 |
| ·高质量 SNPs 参数确定 | 第37-40页 |
| ·讨论 | 第40-41页 |
| 第三章 凡纳滨对虾 ALFs 基因的克隆、结构及功能研究 | 第41-57页 |
| ·材料和方法 | 第41-45页 |
| ·实验材料 | 第41-42页 |
| ·实验引物 | 第42页 |
| ·实验仪器 | 第42-43页 |
| ·实验方法 | 第43-45页 |
| ·总 RNA 提取和第一链 cDNA 合成 | 第43-44页 |
| ·六种新型 ALFs 基因 cDNA 序列的获得 | 第44页 |
| ·nLvALFs 的 cDNA 生物信息学分析 | 第44-45页 |
| ·nLvALFs 基因的表达分析 | 第45页 |
| ·实验结果 | 第45-55页 |
| ·nLvALFs 的 cDNA 序列和特征分析 | 第45-53页 |
| ·nLvALFs 的组织分布和 WSSV 刺激后基因的转录表达 | 第53-55页 |
| ·讨论 | 第55-57页 |
| 第四章 凡纳滨对虾 ALFs 基因组 SNPs 与 WSSV 抗性的关联分析 | 第57-81页 |
| 第一节 凡纳滨对虾 WSSV 抗性/易感材料制备 | 第57-60页 |
| ·实验材料和方法 | 第57-58页 |
| ·实验材料 | 第57页 |
| ·基因组 DNA 提取 | 第57-58页 |
| ·易感组/抗性组材料病毒载量检测 | 第58页 |
| ·实验结果 | 第58-60页 |
| 第二节 ALFs 基因组多态性与 WSSV 抗性关联分析 | 第60-78页 |
| ·实验材料和方法 | 第60-62页 |
| ·实验材料 | 第60页 |
| ·实验引物 | 第60-61页 |
| ·六种新型 ALFs 基因组序列的获得及序列分析 | 第61页 |
| ·nLvALFs 基因组 SNPs 分析及其在抗性和易感组中的分布差异 | 第61-62页 |
| ·实验结果 | 第62-78页 |
| ·凡纳滨对虾 nLvALFs 的基因组序列分析 | 第62-63页 |
| ·nLvALF1 基因组 SNPs 与抗 WSSV 关联分析 | 第63-67页 |
| ·nLvALF2 基因组 SNPs 与抗 WSSV 关联分析 | 第67-72页 |
| ·nLvALF4 基因组 SNPs 与抗 WSSV 关联分析 | 第72-74页 |
| ·nLvALF6 基因组 SNPs 与抗 WSSV 关联分析 | 第74-76页 |
| ·nLvALF7 基因组 SNPs 与抗 WSSV 关联分析 | 第76-78页 |
| 第三节 讨论 | 第78-81页 |
| 第五章 凡纳滨对虾免疫通路基因及效应因子基因的SNPs与WSSV抗性的关联分析 | 第81-91页 |
| ·实验材料与方法 | 第81-84页 |
| ·对虾基因组 DNA | 第81页 |
| ·免疫通路基因和效应因子的 SNPs 选择 | 第81-83页 |
| ·分型实验 | 第83页 |
| ·数据分析 | 第83-84页 |
| ·实验结果 | 第84-88页 |
| ·免疫通路单位点的关联分析 | 第84-86页 |
| ·效应因子单位点的关联分析 | 第86-88页 |
| ·讨论 | 第88-91页 |
| 结论 | 第91-93页 |
| 参考文献 | 第93-105页 |
| 附录 A 凡纳滨对虾 ALFs 基因组序列图 | 第105-109页 |
| 作者简历 | 第109-110页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文与研究成果 | 第110页 |
