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门多萨假单胞菌NK-01生物合成褐藻寡糖和PHAMCL及其代谢途径改造

中文摘要第1-12页
Abstract第12-34页
第一章 前言第34-79页
 第一节 褐藻寡糖的微生物合成第34-50页
     ·寡糖产业的发展现状第34-35页
     ·褐藻寡糖概述第35-37页
     ·褐藻多糖和褐藻寡糖的功能第37-38页
     ·褐藻寡糖的生产第38-40页
     ·褐藻多糖及褐藻寡糖的代谢途径第40-42页
     ·褐藻多糖的合成和分泌第42-43页
     ·褐藻寡糖的研究开发前景第43-44页
     ·褐藻多糖裂解酶第44-50页
       ·褐藻多糖裂解酶的来源第44-45页
       ·褐藻多糖裂解酶的底物特异性第45-46页
       ·褐藻多糖裂解酶的作用机制第46-47页
       ·褐藻多糖裂解酶的序列比较第47-50页
 第二节 聚羟基脂肪酸酯的微生物合成第50-73页
     ·PHA 概述第50-51页
     ·PHA 的结构与性质第51-53页
     ·PHA 发现和发展历史第53-56页
     ·PHA 的分类第56-57页
     ·PHA 的生物合成途径第57-61页
     ·PHA 的生物合成及其代谢途径改造第61-68页
       ·短链 PHA 的合成及代谢途径改造第61-64页
       ·中长链 PHA 的合成及代谢途径改造第64-66页
       ·中长链和短链单体共聚 PHA 的合成及代谢途径改造18第66-68页
     ·PHA 合酶的分类第68-70页
     ·PHA 合酶的排布第70-73页
 第三节 本研究的主要内容和意义第73-79页
     ·本研究的主要内容第73-76页
       ·P. mendocina NK-01 合成褐藻寡糖和 PHA_(MCL)的研究第73-74页
       ·P. mendocina NK-01 合成褐藻寡糖的代谢途径改造第74页
       ·P. mendocina NK-01 的 PHA_(MCL)合成酶 PhaC1、PhaC2的底物特异性研究第74-76页
     ·本研究的意义第76-79页
       ·利用 P. mendocina NK-01 合成褐藻寡糖的工业生产意义第76-77页
       ·P. mendocina NK-01 合成褐藻寡糖高产工程菌的构建的意义第77-78页
       ·P. mendocina NK-01 PHA 合成酶 PhaC1 和 PhaC2 底物特异性研究的意义第78-79页
第二章 利用门多萨假单胞菌 NK-01 同时合成褐藻寡糖和 PHA_(MCL)及其产物结构鉴定第79-115页
 第一节 引言第79-80页
 第二节 实验材料和方法第80-92页
     ·实验菌株第80页
     ·培养基与缓冲溶液第80-81页
     ·主要仪器和设备第81-82页
     ·褐藻寡糖和 PHA_(MCL)的发酵生产第82-83页
     ·褐藻寡糖的定量第83-84页
     ·葡萄糖的测定第84-85页
     ·褐藻寡糖单体的结构鉴定第85-87页
       ·褐藻多糖 Na 型标准品的制备第85页
       ·紫外可见分光光度分析第85页
       ·~1H 核磁共振分析第85-86页
       ·~(13)C 固体核磁共振分析第86页
       ·傅立叶红外光谱测定第86页
       ·质谱分析第86页
       ·化学反应鉴定褐藻寡糖第86-87页
     ·褐藻寡糖的分子量测定第87-88页
     ·褐藻寡糖 M/G 比例测定第88-89页
       ·衍生反应第88-89页
       ·HPLC 测定第89页
     ·PHA 结构测定第89-90页
       ·核磁共振分析第89-90页
       ·傅立叶红外光谱分析第90页
       ·气相色谱-质谱联用分析第90页
     ·PHA 物理性质的分析第90-92页
       ·示差扫描量热分析第91页
       ·热失重分析第91页
       ·拉伸力学分析第91-92页
       ·X-射线衍射分析第92页
 第三节 实验结果与讨论第92-107页
     ·酶法测定褐藻寡糖标准曲线的制作第92-94页
     ·褐藻寡糖和 PHA_(MCL)在 200 L 发酵罐中的发酵生产第94-95页
     ·褐藻寡糖的结构鉴定第95-101页
       ·紫外-可见分光光度法第95页
       ·~1H 核磁共振分析第95页
       ·~(13)C 核磁共振分析第95-97页
       ·傅立叶红外光谱分析第97页
       ·褐藻寡糖单体质谱鉴定第97-100页
       ·褐藻寡糖化学反应鉴定结果第100-101页
     ·褐藻寡糖的分子量测定第101页
     ·褐藻寡糖 M G 比例的测定第101-102页
     ·门多萨假单胞菌 NK-01 生产的 PHA_(MCL)的结构鉴定第102-106页
       ·PHA_(MCL)的1H 核磁共振结果第102页
       ·PHA1MCL的~(13)C 核磁共振结果第102-104页
       ·PHA_(MCL)的 FT-IR 结果第104页
       ·PHA_(MCL)的气相色谱-质联用结果第104-106页
     ·门多萨假单胞菌 NK-01 生产的 PHA_(MCL)的物性表征第106-107页
 第四节 本章小结与讨论第107-115页
     ·本章小结第107-108页
     ·讨论第108-115页
第三章 门多萨假单胞菌 NK-01 合成褐藻寡糖的代谢途径改造第115-150页
 第一节 引言第115页
 第二节 实验材料和方法第115-130页
     ·实验菌株和质粒第115-116页
     ·实验引物第116-117页
     ·培养基与缓冲溶液第117页
     ·主要仪器和设备第117-118页
     ·工具酶和分子量 Marker第118页
     ·P. mendocina NK-01 PHA_(MCL)合成操纵子基因敲除打靶载体的构建第118-125页
       ·P. mendocina NK-01 基因组的提取第118-119页
       ·P. mendocina NK-01 PHA_(MCL)合成操纵子基因的克隆第119-120页
       ·PCR 产物的纯化回收第120页
       ·TA 克隆第120-121页
       ·E. coli JM109、E. coli S17-1 感受态制备和质粒转化第121页
       ·重组质粒的提取第121页
       ·用 T4 DNA 连接酶进行载体构建连接第121-122页
       ·重组质粒的酶切鉴定第122-123页
       ·打靶载体 pEX18TcC1ZC2-Amp 的构建第123-125页
     ·P. mendocina NK-01 PHA_(MCL)合成操纵子敲除突变体的构建第125页
     ·P. mendocina NK-01 基因敲除突变体的验证第125-127页
       ·PCR 验证第125页
       ·抗性验证第125-127页
     ·P. mendocina NK-01 基因敲除突变体与野生菌的发酵对比实验第127-129页
       ·摇瓶发酵第127页
       ·30 L 发酵罐发酵实验第127-128页
       ·褐藻寡糖和 PHA_(MCL)的提取第128页
       ·褐藻寡糖的定量第128-129页
     ·P. mendocina C7 生产褐藻寡糖酶解产物的质谱分析第129页
     ·P. mendocina C7 生产褐藻寡糖分子量测定第129-130页
       ·色谱条件第129-130页
       ·分子量测定第130页
 第三节 实验结果第130-144页
     ·门多萨假单胞菌 NK-01 PHA_(MCL)合酶基因操纵子的克隆第130-131页
     ·门多萨假单胞菌 NK-01 PHA_(MCL)合酶基因操纵子敲除打靶载体的构建第131-132页
     ·P. mendocina NK-01 PHA_(MCL)合成酶操纵子的敲除第132-136页
       ·PCR 验证结果第132-135页
       ·抗性验证结果第135-136页
     ·门多萨假单胞菌基因敲除突变体的发酵实验第136-138页
       ·褐藻寡糖定量标准曲线的制作第136-137页
       ·褐藻寡糖和 PHA_(MCL)的发酵实验结果第137-138页
     ·P. mendocina C7 合成褐藻寡糖的结构鉴定第138-141页
     ·P. mendocina C7 合成褐藻寡糖的分子量测定第141-143页
     ·P. mendocina NK-01 褐藻多糖裂解酶的序列比对第143-144页
 第四节 本章小结与讨论第144-150页
     ·本章小结第144-145页
     ·讨论第145-150页
第四章 门多萨假单胞菌 NK-01 PHA_(MCL)合成酶 PhaC1 和 PhaC2 底物特异性研究第150-176页
 第一节 引言第150-152页
 第二节 实验材料和方法第152-161页
     ·实验菌株第152-153页
     ·引物第153页
     ·培养基与缓冲溶液第153-155页
     ·主要仪器和设备第155页
     ·工具酶和分子量 Marker第155页
     ·phaC1、phaC2 表达载体的构建第155-157页
       ·P. mendocina NK-01 基因组的提取第155页
       ·phaC1、phaC2 的克隆第155-156页
       ·PCR 产物的纯化回收第156页
       ·TA 克隆第156页
       ·E. coli JM109、E. coli S17-1 感受态制备和质粒转化第156页
       ·重组质粒的提取第156页
       ·用 T4 DNA 连接酶进行载体构建连接第156页
       ·重组质粒的酶切鉴定第156-157页
       ·表达载体 pBBR1MCS-C1、pBBR1MCS-C2 的构建第157页
     ·表达载体 pBBR1MCS-C1 、 pBBR1MCS-C2 转化 P. mendocina C7第157-158页
     ·P. mendocina C7C1 和 P. mendocina C7C2 的摇瓶发酵生产PHA_(MCL)第158-159页
     ·SDS-PAGE 电泳检测 phaC1 和 phaC2 基因的表达第159-160页
       ·待测样品制备第159页
       ·制胶、加样及电泳第159-160页
     ·傅立叶红外光谱分析第160页
     ·气相色谱-质谱联用分析第160页
     ·PHA_(MCL)的分子量测定第160-161页
       ·色谱条件第160-161页
       ·分子量测定第161页
     ·PHA_(MCL)的物理性质分析第161页
 第三节 实验结果第161-169页
     ·表达载体 pBBR1MCS-C1 和 pBBR1MCS-C2 的构建第161-162页
     ·SDS-PAGE 电泳结果第162页
     ·三种 PHA_(MCL)的红外光谱比较分析第162-163页
     ·PHA_(MCL)在 P. mendocina C7C1、P. mendocina C7C2 中的积累第163-165页
     ·PHA_(MCL)合酶的活性控制 PHA_(MCL)的分子量第165-166页
     ·三株菌合成 PHA_(MCL)的物性表征第166-169页
       ·示差扫描量热分析(DSC)第166页
       ·热重分析(TGA)第166-167页
       ·X 射线衍射分析(XRD)第167-169页
 第四节 本章小结与讨论第169-176页
     ·本章小结第169-171页
     ·讨论第171-176页
第五章 结论与展望第176-184页
 第一节 本论文结论第176-181页
     ·利用 P. mendocina NK-01 同时合成褐藻寡糖和 PHA_(MCL)第176-178页
     ·P. mendocina NK-01 合成褐藻寡糖的代谢途径改造第178-179页
     ·PhaC1 和 PhaC2 的底物特异性研究第179-181页
 第二节 展望第181-184页
     ·P. mendocina NK-01 合成褐藻寡糖的产量需要进一步提高102第181页
     ·P. mendocina NK-01 合成褐藻寡糖的机制需要进一步阐明第181-182页
     ·PhaC1 和 PhC2 具有相同底物特异性的原因需要阐明第182-184页
参考文献第184-224页
致谢第224-227页
附录 Ⅰ 论文缩略词一览表第227-229页
附录 Ⅱ 重要基因的核苷酸序列和编码酶的氨基酸序列第229-234页
附录 Ⅲ DNA 和蛋白质分子量标准第234-235页
个人简历及在学期间发表的论文第235-238页

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