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奶山羊泌乳期乳腺组织microRNA表达谱分析及miR-143调控IGFBP5对细胞作用研究

中文摘要第1-11页
ABSTRACT第11-14页
1 引言第14-48页
   ·奶山羊泌乳规律及候选基因研究第14-18页
     ·奶山羊泌乳规律研究第14-15页
     ·奶山羊泌乳性状候选基因研究第15-18页
   ·microRNA 及其在动物中研究进展第18-38页
     ·miRNA 的发现与命名第19-20页
     ·miRNA 的生物合成与功能第20-22页
     ·miRNA 基本特征与分布第22-25页
     ·miRNA 的作用机制与意义第25-29页
     ·miRNA 的鉴定方法第29-32页
     ·miRNA 靶基因的预测与鉴定第32-37页
     ·miRNA 在动物中研究进展第37-38页
   ·miRNA 在乳腺发育及泌乳中研究第38-46页
     ·乳腺发育与泌乳及激素调节第38-45页
     ·microRNA 与乳腺发育及泌乳第45-46页
   ·本研究的目的意义第46-48页
2 材料与方法第48-70页
   ·试验材料第48-49页
     ·试验动物及样品采集第48页
     ·菌株和载体第48页
     ·主要数据库及生物分析软件第48-49页
   ·试验方法第49-69页
     ·cDNA 文库构建第49页
     ·Illumina/Solexa 测序数据分析第49-51页
     ·miRNA 表达谱 qRT-PCR 验证第51-54页
     ·miR-143 及 IGFBP5 乳腺组织表达分析第54-56页
     ·奶山羊乳腺上皮细胞分离、纯化及培养第56-58页
     ·miR-143 真核表达载体及 IGFBP5 报告基因载体构建第58-66页
     ·细胞转染第66页
     ·miR143 与 IGFBP5 靶向关系荧光素酶报告基因活性检测第66-67页
     ·MTT 法检测 miR-143 对细胞增殖影响第67页
     ·荧光 Hoechst33342/PI 双染检测 miR-143 对细胞凋亡影响第67-68页
     ·FCM 检测 miR-143 对细胞凋亡影响第68页
     ·miR-143 过表达后凋亡相关标志基因检测第68-69页
   ·数据统计与分析第69-70页
3 结果与分析第70-107页
   ·崂山奶山羊乳腺组织小 RNA 文库构建及 Solexa 测序第70-76页
     ·RNA 质量检测及测序文库构建第70-71页
     ·测序数据质量及序列长度分布特征第71-72页
     ·文库间公共与特有序列及基因组定位分析第72-75页
     ·小 RNA 序列的分类注释第75-76页
   ·乳腺组织中已知 miRNAs 的鉴定及功能分析第76-86页
     ·已知 miRNA 在不同泌乳时期的分布第76页
     ·已知 miRNA 碱基特性分析第76-77页
     ·已知 miRNA 差异表达分析第77-81页
     ·差异表达 miRNA 靶基因预测第81页
     ·差异表达 miRNA 靶基因的 GO 注释第81-82页
     ·差异表达 miRNA 靶基因的 KEGG 分析第82-83页
     ·差异表达 miRNA 聚类模式第83-85页
     ·已知 miRNA 表达 qRT-PCR 验证结果第85-86页
   ·乳腺组织中新 miRNA 鉴定及功能分析第86-91页
     ·新 miRNA 的鉴定及特征第86-88页
     ·新 miRNA 的碱基分布第88-89页
     ·新 miRNA 靶基因预测及功能分析第89-91页
     ·新 miRNA 的 qRT-PCR 验证第91页
   ·miR-143 与 IGFBP5 靶向关系分析第91-102页
     ·miR-143 靶基因预测及功能注释第91-92页
     ·miR-143 与 IGFBP5 在不同泌乳时期乳腺组织的表达第92-93页
     ·miR-143 表达载体及 IGFBP5 报告基因载体构建第93-98页
     ·奶山羊乳腺上皮细胞纯化及培养第98-100页
     ·miR-143 与 IGFBP5 靶向关系荧光报告基因分析第100-102页
   ·miR-143 对乳腺上皮细胞的作用分析第102-107页
     ·MTT 法检测细胞增殖活力第102-103页
     ·荧光 Hoechst33342/PI 双染检测 miR-143 对细胞凋亡效应第103页
     ·FCM 检测 miR-143 对细胞凋亡影响第103-104页
     ·FCM 检测 miR-143 对细胞周期影响第104-106页
     ·凋亡相关基因表达分析第106-107页
4 讨论第107-112页
   ·Solexa 测序数据质量的可靠性第107-108页
   ·miRNA 与其靶基因之间的关系研究第108-110页
   ·miR-143 与 IGFBP5 调控机理第110-112页
5 结论第112-113页
参考文献第113-128页
附录第128-134页
致谢第134-135页
攻读学位期间发表论文情况第135页

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