| 英文缩略表 | 第1-6页 |
| 目录 | 第6-10页 |
| 中文摘要 | 第10-12页 |
| Abstract | 第12-15页 |
| 前言 | 第15-33页 |
| ·乳腺发育 | 第15-17页 |
| ·泌乳启动 | 第17页 |
| ·乳腺发育和泌乳启动的调节因子 | 第17-27页 |
| ·雌激素（Estrogen） | 第18-19页 |
| ·孕酮（Progesterone） | 第19-20页 |
| ·催乳素（Prolactin） | 第20-22页 |
| ·生长激素（Growth Hormone） | 第22-23页 |
| ·糖皮质激素（Glucocorticoids） | 第23-24页 |
| ·胰岛素（Insulin） | 第24-25页 |
| ·胎盘催乳素（Placental lactogen） | 第25页 |
| ·转化生长因子β1（Transforming growth factor-β1） | 第25-26页 |
| ·信号转导和转录激活因子 | 第26-27页 |
| ·基因表达研究技术 | 第27-30页 |
| ·实时荧光定量 PCR（Quantitative real time PCR, qPCR） | 第27-28页 |
| ·基因芯片 | 第28-29页 |
| ·测序技术 | 第29-30页 |
| ·蛋白质组学研究 | 第30-32页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第32-33页 |
| 材料与方法 | 第33-48页 |
| ·试验动物 | 第33页 |
| ·主要试剂 | 第33-34页 |
| ·主要仪器设备 | 第34页 |
| ·主要试剂的配制 | 第34-35页 |
| ·试验方法 | 第35-48页 |
| ·数字基因表达谱（DGE） | 第35-38页 |
| ·荧光定量 PCR | 第38-40页 |
| ·Western-Blot 操作步骤 | 第40-43页 |
| ·同位素标记相对和绝对定量操作步骤 | 第43-47页 |
| ·蛋白组和转录组的关联分析 | 第47-48页 |
| 结果与分析 | 第48-77页 |
| ·数字基因表达谱结果与分析 | 第48-63页 |
| ·标签库特征分析 | 第48页 |
| ·测序饱和度分析 | 第48-49页 |
| ·标签注释分析 | 第49-50页 |
| ·差异表达基因的筛选 | 第50-52页 |
| ·差异表达基因的 GO 功能显著性富集分析 | 第52-54页 |
| ·差异表达基因的途径显著性富集分析 | 第54-56页 |
| ·乳蛋白基因和脂类代谢基因的结果分析 | 第56-58页 |
| ·泌乳启动两个阶段差异表达基因分析 | 第58-63页 |
| ·荧光定量 PCR 结果分析 | 第63-65页 |
| ·Western blot 试验结果 | 第65-66页 |
| ·iTRAQ 试验结果分析 | 第66-73页 |
| ·肽段匹配的误差分布 | 第66-67页 |
| ·蛋白质鉴定结果分析 | 第67-68页 |
| ·蛋白质质量分布图 | 第68页 |
| ·肽段序列覆盖度 | 第68页 |
| ·Unique 肽段数量分布 | 第68-69页 |
| ·COG 注释 | 第69页 |
| ·泌乳启动过程差异表达的蛋白 | 第69-70页 |
| ·差异蛋白的 GO 富集分析 | 第70-71页 |
| ·差异表达蛋白的途径富集分析 | 第71-72页 |
| ·葡萄糖代谢相关酶的蛋白表达 | 第72页 |
| ·乳蛋白和免疫球蛋白的蛋白表达 | 第72-73页 |
| ·蛋白组和转录组的关联分析 | 第73-77页 |
| ·关联系数的计算 | 第73-74页 |
| ·GO 功能富集分析和途径富集分析 | 第74-77页 |
| 讨论 | 第77-85页 |
| ·数字基因表达谱 | 第77-81页 |
| ·泌乳启动过程乳腺基因的转录情况 | 第77-78页 |
| ·泌乳启动过程乳腺上皮细胞和细胞外基质的变化 | 第78-79页 |
| ·泌乳启动过程乳腺免疫功能的变化 | 第79页 |
| ·泌乳启动过程乳蛋白基因的表达和调控 | 第79-80页 |
| ·泌乳启动过程脂类代谢及调控 | 第80页 |
| ·信号转导和转录活化因子 5（STAT5）对乳腺发育和泌乳的作用 | 第80-81页 |
| ·iTRAQ | 第81-84页 |
| ·蛋白组与转录组的关联分析 | 第84-85页 |
| 总体结论 | 第85-86页 |
| 研究创新点和研究展望 | 第86-87页 |
| 参考文献 | 第87-109页 |
| 致谢 | 第109-110页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第110页 |
