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大肠杆菌无细胞体系高通量合成蛋白质的探索性研究

致谢第1-6页
摘要第6-8页
ABSTRACT第8-15页
第一章 文献综述第15-41页
   ·引言第15页
   ·无细胞蛋白合成体系第15-22页
     ·无细胞体外合成蛋白质的研究历史第15-16页
     ·无细胞体外合成蛋白质的基本原理及优势第16-18页
     ·影响无细胞体系蛋白质合成效率的关键因素第18-21页
     ·无细胞蛋白合成体系的高通量潜力第21-22页
   ·无细胞蛋白合成体系的高通量反应技术第22-31页
     ·基于单分PCR反应的体外高通量表达与筛选第22-24页
     ·孔板与载波片上的无细胞蛋白合成第24-26页
     ·微型反应器中的无细胞蛋白合成第26-28页
     ·微囊体系中的无细胞蛋白合成第28-31页
   ·DNA凝胶的研究进展及其应用第31-35页
     ·DNA凝胶简介第31-32页
     ·DNA凝胶的类型以及物理/化学性质第32-34页
     ·DNA凝胶的应用第34-35页
   ·喷墨打印技术的研究进展及其应用第35-38页
     ·喷墨打印技术简介第35-36页
     ·喷墨打印技术在生物工程/技术领域的应用第36-38页
   ·本工作的基本研究思路与拟研究内容第38-41页
第二章 实验材料与方法第41-51页
   ·实验材料第41页
     ·质粒第41页
     ·实验菌株第41页
     ·重要试剂、工具酶及试剂盒第41页
     ·培养基第41页
   ·实验仪器第41-42页
   ·实验及分析方法第42-51页
     ·分子克隆实验第43页
     ·DNA分子摩尔浓度测定第43页
     ·SDS-PAGE电泳第43页
     ·Western-blot分析第43页
     ·EGFP荧光强度测定第43页
     ·油/水乳液粒度大小分布测定第43-44页
     ·木糖测定第44页
     ·S12细胞抽提物的制备第44-45页
     ·标准无细胞反应液的配置第45-46页
     ·商业化无细胞反应液的配置第46页
     ·无细胞补充液的配置第46页
     ·pIVEX2.4c-eGFP重组质粒的构建第46-48页
     ·pET21α-DsRed2重组质粒的构建第48-51页
第三章 体外高效合成目标蛋白的无细胞体系构建及优化第51-69页
   ·引言第51-52页
   ·材料和方法第52-60页
     ·菌株和载体第52页
     ·培养基和培养条件第52-53页
     ·工具酶及主要试剂第53页
     ·基本的分子生物学操作第53页
     ·菌株的活化与分子伴侣质粒的转化第53页
     ·菌体浓度的测定第53页
     ·重组分子伴侣菌株的表达第53-54页
     ·大肠杆菌抽提物的制备第54页
     ·含不同信号肽序列的重组质粒的构建第54-55页
     ·其它重组质粒模板的构建第55-57页
     ·大肠杆菌无细胞体系的构建第57-59页
     ·木聚糖酶以及其它几种酶的活性测定第59-60页
     ·SDS-PAGE分析第60页
     ·Western-blot分析第60页
   ·结果与讨论第60-67页
     ·信号肽序列对木聚糖酶体外表达的影响第60-62页
     ·含有分子伴侣质粒的重组菌的表达第62-63页
     ·富含分子伴侣的无细胞体系对木聚糖酶可溶表达的影响第63-65页
     ·表面活性剂对体外表达的木聚糖酶活性的影响第65-66页
     ·组合表达策略对其它酶体外功能性表达的促进第66-67页
   ·小结第67-69页
第四章 DNA凝胶固定线性模板高效合成木聚糖酶的研究第69-85页
   ·引言第69-71页
   ·材料和方法第71-77页
     ·实验材料第71页
     ·X-DNA的合成第71-72页
     ·目标质粒的构建第72页
     ·线烂目标基因模板的准备第72-73页
     ·能够自身环化的PCR模板的准备第73页
     ·富含GroEL/S系列分子伴侣的无细胞反应液的配制第73页
     ·商业化无细胞反应液的配制第73-74页
     ·EP管中DNA凝胶的合成第74页
     ·凝胶体系中X-DNA与目标基因模板浓度的优化第74页
     ·目标蛋白分子的橙测第74页
     ·滤纸片中DNA凝胶的制备第74-75页
     ·基于磁力搅拌方式的DNA凝胶微粒的高通量制备第75页
     ·DNA凝胶微粒的收集与纯化第75-76页
     ·DNA凝胶的染色与检测第76页
     ·采用不同xylA模板对无细胞反应效率的影响第76-77页
   ·结果和讨论第77-82页
     ·X-DNA的合成第77页
     ·不同X-DNA粘性末端对合成DNA凝胶的影响第77-78页
     ·X-DNA与目标基因模板浓度的优化第78-79页
     ·滤纸片中DNA凝胶的制备第79-80页
     ·基于磁力搅拌方式制备的DNA凝胶微粒的大小分布第80-81页
     ·不同方法制备的DNA凝胶对无细胞合成木聚糖酶效率的促进第81-82页
   ·小结第82-85页
第五章 基于DNA凝胶的无细胞反应器微型化及高通量反应研究第85-99页
   ·引言第85-86页
   ·材料与方法第86-90页
     ·实验材料第86页
     ·X-DNA的合成以及目标模板gfp的准备第86页
     ·商业化无细胞反应液以及无细胞补充液的配制第86页
     ·DNA凝胶反应混合液的配制第86-87页
     ·基于冲击混合与膜过滤方式高通量制备DNA凝胶微粒第87-88页
     ·不同方式合成DNA凝胶对GFP体外表达的影响第88页
     ·不同体积DNA凝胶结合核酸染料标准曲线的绘制第88-89页
     ·含有卵磷脂分子以及含有表面活性剂成分的矿物油的准备第89页
     ·油相基质中微型生物反应器的高通量制备第89页
     ·标准与微型反应模下GFP表达效率的比较第89-90页
     ·水相基质中微型生物反应器的高通量制备第90页
   ·结果与讨论第90-96页
     ·基于冲击混合与膜过滤方式高通量制备DNA凝胶微粒第90-91页
     ·不同方式合成的DNA凝胶对GFP表达效率的影响第91-92页
     ·不同的物理混合方式对合成DNA凝胶效率的影响第92-93页
     ·基于油相体系的无细胞微型生物反应器第93-94页
     ·基于水相体系的人工细胞模型的构建第94-96页
   ·小结第96-99页
第六章 基于喷墨打印技术的体外高通量合成蛋白质的研究第99-115页
   ·引言第99页
   ·材料与方法第99-104页
     ·喷墨打印机的改装第99-100页
     ·打印样品的准备第100页
     ·打印基质的准备第100页
     ·抗生素实验菌液悬液的制备第100页
     ·琼脂玻璃双碟的准备第100-101页
     ·特定菌落图案的打印第101页
     ·高密度细胞阵列的打印第101页
     ·基于喷墨打印技术的抗生素效价测定第101-102页
     ·基于喷墨打印技术的抗生素最低抑菌浓度测定第102-103页
     ·无细胞蛋白合成体系的打印第103-104页
   ·结果与讨论第104-113页
     ·热喷墨打印后大肠杆菌存活率分析第104-105页
     ·细胞菌落形态第105页
     ·高密度细胞阵列第105-106页
     ·抗生素效价测定第106-107页
     ·基于喷墨打印技术的梯度抑菌模型第107-109页
     ·无细胞反应液打印条件优化第109-110页
     ·无细胞蛋白合成体系的打印第110-113页
   ·小结第113-115页
第七章 结论与展望第115-119页
   ·结论第115-117页
   ·展望第117-119页
参考文献第119-131页
作者简历第131页
攻读博士学位期间主要科研成第131页

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