本论文的创新性工作 | 第1-4页 |
中文摘要 | 第4-6页 |
ABSTRACT | 第6-9页 |
缩略词表 | 第9-17页 |
第一部分 文献综述及选题目的和意义 | 第17-22页 |
第一章 疱疹病毒UL16基因及其编码蛋白的研究进展 | 第17-22页 |
1. 疱疹病毒UL16基因及其编码蛋白的研究进展 | 第17-21页 |
·疱疹病毒UL16基因序列的特点 | 第17页 |
·疱疹病毒UL16基因编码蛋白氨基酸序列的特点 | 第17-18页 |
·疱疹病毒UL16基因编码蛋白的定位 | 第18页 |
·疱疹病毒UL16基因编码蛋白质的功能 | 第18-20页 |
·UL16蛋白与衣壳的相互作用 | 第18-19页 |
·UL16蛋白参与病毒粒子的成熟与出芽 | 第19-20页 |
·UL16蛋白与其他蛋白的相互作用 | 第20页 |
·展望 | 第20-21页 |
2. 选题的目的和意义 | 第21-22页 |
第二部分 试验研究 | 第22-88页 |
第二章 鸭瘟病毒UL16基因特性预测与分析 | 第22-38页 |
1. 材料与方法 | 第22-23页 |
·材料 | 第22页 |
·基因序列 | 第22页 |
·生物信息学分析工具 | 第22页 |
·方法 | 第22-23页 |
·DPV UL16基因核酸序列预测分析 | 第22-23页 |
·DPV UL16蛋白质氨基酸序列分析 | 第23页 |
·DPV UL16基因密码子偏嗜性分析 | 第23页 |
2. 结果 | 第23-35页 |
·DPV UL16基因核酸预测分析 | 第23-24页 |
·DPV UL16蛋白质氨基酸序列分析 | 第24-30页 |
·蛋白质氨基酸序列分析 | 第24页 |
·蛋白质保守结构域分析 | 第24-25页 |
·蛋白质相性搜索及进化树的构建 | 第25-27页 |
·DPV UL16蛋白质结构预测分析 | 第27-28页 |
·蛋白质功能位点预测 | 第28-30页 |
·蛋白质亚细胞定位 | 第30页 |
·蛋白质抗原表位预测 | 第30页 |
·DPV UL16基因遗传密码子的偏嗜性分析 | 第30-35页 |
3. 讨论 | 第35-38页 |
·生物信息学 | 第35-36页 |
·DPV UL16基因及编码蛋白质特征 | 第36-37页 |
·DPV UL16基因遗传密码子的偏嗜性分析 | 第37-38页 |
第三章 鸭瘟病毒UL16基因克隆、原核表达及多克隆抗体的制备 | 第38-61页 |
1. 实验材料 | 第38-41页 |
·菌株、毒株及载体 | 第38页 |
·实验动物 | 第38页 |
·主要试剂 | 第38-39页 |
·主要溶液的配制 | 第39-41页 |
·DEFs培养液的配制 | 第39页 |
·琼脂糖凝胶电泳液的配制 | 第39页 |
·SDS-PAGE电泳液的配制 | 第39-40页 |
·细菌培养液的配制 | 第40页 |
·Ni~(2+)柱亲和层析纯化带His标签的重组蛋白包涵体溶液 | 第40-41页 |
·弗氏佐剂的配制 | 第41页 |
·Western-blot溶液的配制 | 第41页 |
·主要实验仪器 | 第41页 |
2. 实验方法 | 第41-50页 |
·DPV基因组DNA的提取 | 第41-43页 |
·DEFs的培养 | 第41-42页 |
·DPV接种DEFs | 第42页 |
·DPV基因组DNA的提取 | 第42-43页 |
·DPV UL16基因的扩增 | 第43页 |
·PCR引物设计 | 第43页 |
·DPV UL16基因的PCR扩增 | 第43页 |
·DPV UL16基因PCR产物电泳 | 第43页 |
·DPVUL16基因T克隆与鉴定 | 第43-44页 |
·UL16基因T克隆 | 第43页 |
·T克隆pMD18-T-UL16质粒的鉴定 | 第43-44页 |
·pMD18-T-UL16质粒的提取 | 第43-44页 |
·pMD18-T-UL16质粒的鉴定 | 第44页 |
·构建DPV UL16基因重组表达载体 | 第44-46页 |
·pMD18-T-UL16和pET-32b(+)质粒的提取和双酶切 | 第44页 |
·凝胶回收酶切目的片段 | 第44页 |
·UL16基因重组表达质粒的构建 | 第44-45页 |
·DH5α和Rossetta(DE3)感受态细胞的制备 | 第45页 |
·重组pET32b(+)-UL16表达质粒转化至DH5α感受态细胞 | 第45页 |
·阳性菌落的筛选和鉴定 | 第45页 |
·构建重组蛋白表达菌株 | 第45-46页 |
·重组DPV UL16蛋白的诱导表达及条件优化 | 第46页 |
·重组UL16蛋白的诱导表达 | 第46页 |
·重组DPV UL16蛋白表达条件的优化 | 第46页 |
·IPTG诱导浓度的优化 | 第46页 |
·诱导时间的优化 | 第46页 |
·诱导温度的优化 | 第46页 |
·DPV UL16重组蛋白的纯化 | 第46-47页 |
·UL16重组蛋白包涵体的洗涤 | 第46-47页 |
·UL16重组蛋白的Ni~(2+)柱亲和层析纯化 | 第47页 |
·UL16重组蛋白的复性 | 第47页 |
·DPV UL16重组蛋白免疫原性和反应原性检测 | 第47-48页 |
·兔抗DPV UL16重组蛋白多克隆抗体的制备 | 第48-49页 |
·免疫疫苗的制备 | 第48页 |
·免疫程序 | 第48-49页 |
·琼脂糖凝胶扩散试验测定制备的抗体的效价 | 第49页 |
·多克隆抗体特异性检测 | 第49页 |
·兔抗DPV UL16 IgG的纯化 | 第49-50页 |
·兔抗DPV UL16 IgG粗提纯 | 第49页 |
·High-Q阴离子交换层析纯化粗提的兔抗DPV UL16 IgG | 第49-50页 |
3. 结果 | 第50-58页 |
·DPV UL16基因PCR扩增和T-克隆鉴定 | 第50-51页 |
·重组表达质粒pET-32b(+)-UL16的构建和鉴定 | 第51页 |
·DPV UL16重组蛋白的表达及条件优化 | 第51-56页 |
·重组UL16蛋白的诱导表达 | 第51-52页 |
·IPTG浓度的优化 | 第52-53页 |
·诱导时间的优化 | 第53-54页 |
·诱导温度的优化 | 第54-55页 |
·重组UL16蛋白的纯化 | 第55-56页 |
·DPV UL16重组蛋白免疫原性和反应原性检测 | 第56-57页 |
·兔抗UL16多克隆抗体效价的测定 | 第57页 |
·兔抗DPV UL16多克隆抗体的Western-blot特异性检测 | 第57页 |
·兔抗DPV UL16 IgG的纯化及鉴定 | 第57-58页 |
4. 讨论 | 第58-61页 |
·UL16基因的原核表达 | 第58-59页 |
·多克隆抗体的制备及纯化 | 第59-61页 |
第四章 鸭瘟病毒体外感染宿主细胞UL16基因转录 #45及表达时相分析 | 第61-73页 |
1. 材料 | 第61-62页 |
·毒株/细胞 | 第61页 |
·主要试剂 | 第61页 |
·主要实验设备 | 第61-62页 |
·实验器材处理 | 第62页 |
2. 实验方法 | 第62-65页 |
·FQ-PCR检测DPV体外感染DEFs UL16基因的转录实相 | 第62-64页 |
·DEFs的培养及DPV接种 | 第62页 |
·总RNA的抽提 | 第62页 |
·RNA反转录成cDNA | 第62-63页 |
·FQ-PCR引物的设计与合成 | 第63页 |
·标准样品的制备 | 第63页 |
·FQ-PCR引物的特异性检测 | 第63页 |
·FQ-PCR标准曲线的制作 | 第63页 |
·样品的定量检测 | 第63-64页 |
·FQ-PCR结果数据分析 | 第64页 |
·鸭瘟病毒体外感染DEFs UL16基因的表达实相分析 | 第64-65页 |
·DEFs的培养及DPV接种 | 第64页 |
·细胞总蛋白的提取 | 第64页 |
·Western-blot分析UL16蛋白表达实相 | 第64-65页 |
·DNA合成抑制试验分析UL16基因类型 | 第65页 |
·DEFs的培养及RNA制备 | 第65页 |
·PCR检测UL16基因的转录 | 第65页 |
3. 结果 | 第65-70页 |
·提取RNA的完整性和纯度测定 | 第65页 |
·引物特异性检测 | 第65-66页 |
·FQ-PCR标准曲线的制作 | 第66-68页 |
·UL16基因FQ-PCR标准曲线的制作 | 第66-67页 |
·β-actin基因FQ-PCR标准曲线的制作 | 第67-68页 |
·DPV体外感染DEFs后UL16基因转录实相分析 | 第68-69页 |
·DPV体外感染DEFs UL16基因表达实相分析 | 第69页 |
·DNA合成抑制剂对DPV UL16基因转录影响分析 | 第69-70页 |
4. 讨论 | 第70-73页 |
·DPV感染DEFs后UL16基因转录和表达实相分析 | 第70-71页 |
·DNA合成抑制试验分析UL16基因的类型 | 第71-73页 |
第五章 鸭瘟病毒体外感染DEFs UL16基因产物的亚细胞定位 | 第73-79页 |
1. 材料 | 第73页 |
·病毒及细胞 | 第73页 |
·主要试剂 | 第73页 |
·主要仪器设备 | 第73页 |
2. 实验方法 | 第73-74页 |
·IFA法检测DPV UL16蛋白亚细胞定位方法的建立 | 第73-74页 |
·IFA法检测DPV UL16蛋白亚细胞定位方法的优化 | 第74页 |
·结果判断 | 第74页 |
·DPV UL16蛋白在DEFs中亚细胞定位的动态监测 | 第74页 |
3. 结果 | 第74-77页 |
·IFA法检测DPV UL16蛋白亚细胞定位方法的建立及条件优化 | 第74-75页 |
·DPV UL16蛋白在DEFs中亚细胞定位的动态监测 | 第75-77页 |
4. 讨论 | 第77-79页 |
第六章 基于重组DPV UL16蛋白的间接ELISA法检测鸭瘟病毒抗体 | 第79-88页 |
1. 实验材料 | 第79-80页 |
·UL16蛋白及血清 | 第79页 |
·主要仪器、试剂及其配制 | 第79-80页 |
2. 实验方法 | 第80-81页 |
·DPV UL16-ELISA法检测DPV抗体方法的建立 | 第80-81页 |
·抗原最佳包被浓度和血清稀释度的确定 | 第80页 |
·酶标二抗最佳稀释度的确定 | 第80页 |
·UL16-ELISA阴阳性临界值的确定 | 第80页 |
·UL16-ELISA敏感性实验 | 第80-81页 |
·UL16-ELISA重复性实验 | 第81页 |
·UL16-ELISA特异性实验 | 第81页 |
·UL16-ELISA阻断实验 | 第81页 |
·UL16-ELISA与SNT之间符合率实验 | 第81页 |
3. 结果 | 第81-85页 |
·DPV UL16-ELISA法检测DPV抗体方法的建立 | 第81-85页 |
·最佳抗原包被浓度和血清稀释度的优化 | 第81-82页 |
·酶标二抗最佳稀释度的确定 | 第82-83页 |
·UL16-ELISA阴阳性临界值的确定 | 第83页 |
·UL16-ELISA敏感性实验 | 第83页 |
·UL16-ELISA重复性实验 | 第83-84页 |
·UL16-ELISA特异性实验 | 第84页 |
·UL16-ELISA阻断实验 | 第84-85页 |
·UL16-ELISA与SNT之间符合率试验 | 第85页 |
4. 讨论 | 第85-88页 |
第三部分 结论 | 第88-89页 |
参考文献 | 第89-94页 |
致谢 | 第94-95页 |
作者简介以及攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第95页 |