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鸭瘟病毒UL16基因的原核表达及其功能研究

本论文的创新性工作第1-4页
中文摘要第4-6页
ABSTRACT第6-9页
缩略词表第9-17页
第一部分 文献综述及选题目的和意义第17-22页
 第一章 疱疹病毒UL16基因及其编码蛋白的研究进展第17-22页
  1. 疱疹病毒UL16基因及其编码蛋白的研究进展第17-21页
   ·疱疹病毒UL16基因序列的特点第17页
   ·疱疹病毒UL16基因编码蛋白氨基酸序列的特点第17-18页
   ·疱疹病毒UL16基因编码蛋白的定位第18页
   ·疱疹病毒UL16基因编码蛋白质的功能第18-20页
     ·UL16蛋白与衣壳的相互作用第18-19页
     ·UL16蛋白参与病毒粒子的成熟与出芽第19-20页
     ·UL16蛋白与其他蛋白的相互作用第20页
   ·展望第20-21页
  2. 选题的目的和意义第21-22页
第二部分 试验研究第22-88页
 第二章 鸭瘟病毒UL16基因特性预测与分析第22-38页
  1. 材料与方法第22-23页
   ·材料第22页
     ·基因序列第22页
     ·生物信息学分析工具第22页
   ·方法第22-23页
     ·DPV UL16基因核酸序列预测分析第22-23页
     ·DPV UL16蛋白质氨基酸序列分析第23页
     ·DPV UL16基因密码子偏嗜性分析第23页
  2. 结果第23-35页
   ·DPV UL16基因核酸预测分析第23-24页
   ·DPV UL16蛋白质氨基酸序列分析第24-30页
     ·蛋白质氨基酸序列分析第24页
     ·蛋白质保守结构域分析第24-25页
     ·蛋白质相性搜索及进化树的构建第25-27页
     ·DPV UL16蛋白质结构预测分析第27-28页
     ·蛋白质功能位点预测第28-30页
     ·蛋白质亚细胞定位第30页
     ·蛋白质抗原表位预测第30页
   ·DPV UL16基因遗传密码子的偏嗜性分析第30-35页
  3. 讨论第35-38页
   ·生物信息学第35-36页
   ·DPV UL16基因及编码蛋白质特征第36-37页
   ·DPV UL16基因遗传密码子的偏嗜性分析第37-38页
 第三章 鸭瘟病毒UL16基因克隆、原核表达及多克隆抗体的制备第38-61页
  1. 实验材料第38-41页
   ·菌株、毒株及载体第38页
   ·实验动物第38页
   ·主要试剂第38-39页
   ·主要溶液的配制第39-41页
     ·DEFs培养液的配制第39页
     ·琼脂糖凝胶电泳液的配制第39页
     ·SDS-PAGE电泳液的配制第39-40页
     ·细菌培养液的配制第40页
     ·Ni~(2+)柱亲和层析纯化带His标签的重组蛋白包涵体溶液第40-41页
     ·弗氏佐剂的配制第41页
     ·Western-blot溶液的配制第41页
   ·主要实验仪器第41页
  2. 实验方法第41-50页
   ·DPV基因组DNA的提取第41-43页
     ·DEFs的培养第41-42页
     ·DPV接种DEFs第42页
     ·DPV基因组DNA的提取第42-43页
   ·DPV UL16基因的扩增第43页
     ·PCR引物设计第43页
     ·DPV UL16基因的PCR扩增第43页
     ·DPV UL16基因PCR产物电泳第43页
   ·DPVUL16基因T克隆与鉴定第43-44页
     ·UL16基因T克隆第43页
     ·T克隆pMD18-T-UL16质粒的鉴定第43-44页
       ·pMD18-T-UL16质粒的提取第43-44页
       ·pMD18-T-UL16质粒的鉴定第44页
   ·构建DPV UL16基因重组表达载体第44-46页
     ·pMD18-T-UL16和pET-32b(+)质粒的提取和双酶切第44页
     ·凝胶回收酶切目的片段第44页
     ·UL16基因重组表达质粒的构建第44-45页
     ·DH5α和Rossetta(DE3)感受态细胞的制备第45页
     ·重组pET32b(+)-UL16表达质粒转化至DH5α感受态细胞第45页
     ·阳性菌落的筛选和鉴定第45页
     ·构建重组蛋白表达菌株第45-46页
   ·重组DPV UL16蛋白的诱导表达及条件优化第46页
     ·重组UL16蛋白的诱导表达第46页
     ·重组DPV UL16蛋白表达条件的优化第46页
       ·IPTG诱导浓度的优化第46页
       ·诱导时间的优化第46页
       ·诱导温度的优化第46页
   ·DPV UL16重组蛋白的纯化第46-47页
     ·UL16重组蛋白包涵体的洗涤第46-47页
     ·UL16重组蛋白的Ni~(2+)柱亲和层析纯化第47页
     ·UL16重组蛋白的复性第47页
   ·DPV UL16重组蛋白免疫原性和反应原性检测第47-48页
   ·兔抗DPV UL16重组蛋白多克隆抗体的制备第48-49页
     ·免疫疫苗的制备第48页
     ·免疫程序第48-49页
     ·琼脂糖凝胶扩散试验测定制备的抗体的效价第49页
     ·多克隆抗体特异性检测第49页
   ·兔抗DPV UL16 IgG的纯化第49-50页
     ·兔抗DPV UL16 IgG粗提纯第49页
     ·High-Q阴离子交换层析纯化粗提的兔抗DPV UL16 IgG第49-50页
  3. 结果第50-58页
   ·DPV UL16基因PCR扩增和T-克隆鉴定第50-51页
   ·重组表达质粒pET-32b(+)-UL16的构建和鉴定第51页
   ·DPV UL16重组蛋白的表达及条件优化第51-56页
     ·重组UL16蛋白的诱导表达第51-52页
     ·IPTG浓度的优化第52-53页
     ·诱导时间的优化第53-54页
     ·诱导温度的优化第54-55页
     ·重组UL16蛋白的纯化第55-56页
   ·DPV UL16重组蛋白免疫原性和反应原性检测第56-57页
   ·兔抗UL16多克隆抗体效价的测定第57页
   ·兔抗DPV UL16多克隆抗体的Western-blot特异性检测第57页
   ·兔抗DPV UL16 IgG的纯化及鉴定第57-58页
  4. 讨论第58-61页
   ·UL16基因的原核表达第58-59页
   ·多克隆抗体的制备及纯化第59-61页
 第四章 鸭瘟病毒体外感染宿主细胞UL16基因转录 #45及表达时相分析第61-73页
  1. 材料第61-62页
   ·毒株/细胞第61页
   ·主要试剂第61页
   ·主要实验设备第61-62页
   ·实验器材处理第62页
  2. 实验方法第62-65页
   ·FQ-PCR检测DPV体外感染DEFs UL16基因的转录实相第62-64页
     ·DEFs的培养及DPV接种第62页
     ·总RNA的抽提第62页
     ·RNA反转录成cDNA第62-63页
     ·FQ-PCR引物的设计与合成第63页
     ·标准样品的制备第63页
     ·FQ-PCR引物的特异性检测第63页
     ·FQ-PCR标准曲线的制作第63页
     ·样品的定量检测第63-64页
     ·FQ-PCR结果数据分析第64页
   ·鸭瘟病毒体外感染DEFs UL16基因的表达实相分析第64-65页
     ·DEFs的培养及DPV接种第64页
     ·细胞总蛋白的提取第64页
     ·Western-blot分析UL16蛋白表达实相第64-65页
   ·DNA合成抑制试验分析UL16基因类型第65页
     ·DEFs的培养及RNA制备第65页
     ·PCR检测UL16基因的转录第65页
  3. 结果第65-70页
   ·提取RNA的完整性和纯度测定第65页
   ·引物特异性检测第65-66页
   ·FQ-PCR标准曲线的制作第66-68页
     ·UL16基因FQ-PCR标准曲线的制作第66-67页
     ·β-actin基因FQ-PCR标准曲线的制作第67-68页
   ·DPV体外感染DEFs后UL16基因转录实相分析第68-69页
   ·DPV体外感染DEFs UL16基因表达实相分析第69页
   ·DNA合成抑制剂对DPV UL16基因转录影响分析第69-70页
  4. 讨论第70-73页
   ·DPV感染DEFs后UL16基因转录和表达实相分析第70-71页
   ·DNA合成抑制试验分析UL16基因的类型第71-73页
 第五章 鸭瘟病毒体外感染DEFs UL16基因产物的亚细胞定位第73-79页
  1. 材料第73页
   ·病毒及细胞第73页
   ·主要试剂第73页
   ·主要仪器设备第73页
  2. 实验方法第73-74页
   ·IFA法检测DPV UL16蛋白亚细胞定位方法的建立第73-74页
   ·IFA法检测DPV UL16蛋白亚细胞定位方法的优化第74页
   ·结果判断第74页
   ·DPV UL16蛋白在DEFs中亚细胞定位的动态监测第74页
  3. 结果第74-77页
   ·IFA法检测DPV UL16蛋白亚细胞定位方法的建立及条件优化第74-75页
   ·DPV UL16蛋白在DEFs中亚细胞定位的动态监测第75-77页
  4. 讨论第77-79页
 第六章 基于重组DPV UL16蛋白的间接ELISA法检测鸭瘟病毒抗体第79-88页
  1. 实验材料第79-80页
   ·UL16蛋白及血清第79页
   ·主要仪器、试剂及其配制第79-80页
  2. 实验方法第80-81页
   ·DPV UL16-ELISA法检测DPV抗体方法的建立第80-81页
     ·抗原最佳包被浓度和血清稀释度的确定第80页
     ·酶标二抗最佳稀释度的确定第80页
     ·UL16-ELISA阴阳性临界值的确定第80页
     ·UL16-ELISA敏感性实验第80-81页
     ·UL16-ELISA重复性实验第81页
     ·UL16-ELISA特异性实验第81页
     ·UL16-ELISA阻断实验第81页
   ·UL16-ELISA与SNT之间符合率实验第81页
  3. 结果第81-85页
   ·DPV UL16-ELISA法检测DPV抗体方法的建立第81-85页
     ·最佳抗原包被浓度和血清稀释度的优化第81-82页
     ·酶标二抗最佳稀释度的确定第82-83页
     ·UL16-ELISA阴阳性临界值的确定第83页
     ·UL16-ELISA敏感性实验第83页
     ·UL16-ELISA重复性实验第83-84页
     ·UL16-ELISA特异性实验第84页
     ·UL16-ELISA阻断实验第84-85页
   ·UL16-ELISA与SNT之间符合率试验第85页
  4. 讨论第85-88页
第三部分 结论第88-89页
参考文献第89-94页
致谢第94-95页
作者简介以及攻读硕士学位期间发表的学术论文第95页

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