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猪性成熟前后睾丸组织差异表达miRNA鉴定及功能分析

摘要第1-11页
Abstract第11-13页
第一章 文献综述第13-23页
 1 前言第13页
 2 miRNAs的发现及命名第13-14页
   ·miRNAs的发现第13-14页
   ·miRNAs的命名第14页
 3 miRNAs的特点第14-15页
   ·miRNAs的结构特点第14页
   ·miRNAs的生物学特性第14-15页
 4 miRNAs的形成及调控机制第15-17页
   ·miRNAs的形成第15页
   ·miRNAs的调控机制第15-17页
 5 miRNAs的研究方法与检测技术第17-19页
   ·正向遗传学筛选第17页
   ·定向克隆第17-19页
     ·组织特异性克隆第17-18页
     ·miRNAs芯片第18页
     ·Solexa测序第18-19页
   ·生物信息学方法第19页
 6 miRNAs在动物繁殖方面的研究现状第19-21页
 7 猪miRNAs的研究现状第21页
 8 目的与意义第21-23页
第二章 材料与方法第23-34页
 1 实验材料第23-26页
   ·实验样品第23页
     ·组织样品第23页
     ·载体、菌株和细胞系第23页
   ·主要仪器和设备第23-24页
   ·主要试剂及试剂盒第24页
   ·常用试剂及其配制第24-25页
   ·主要生物信息学网站和分析软件第25-26页
 2 试验方法第26-34页
   ·miRNAs芯片合成第26页
   ·总RNA的提取及反转录获得cDNA第一链第26-27页
     ·猪睾丸组织总RNA的提取第26页
     ·猪睾丸组织总RNA浓度的测定和质量检测第26-27页
     ·cDNA的制备第27页
     ·cDNA的检测第27页
   ·差异表达miRNA的验证第27-30页
     ·cDNA的制备第27-28页
     ·miRNA成熟序列扩增引物设计第28页
     ·miRNA成熟序列的扩增第28页
     ·miRNA成熟序列的克隆鉴定第28页
     ·实时定量PCR验证miRNAs芯片中的差异表达miRNA第28-29页
     ·数据分析第29-30页
   ·miRNA靶基因搜索第30-31页
     ·靶基因实时定量PCR引物设计与合成第30-31页
     ·靶基因的PCR扩增第31页
     ·利用实时定量PCR对靶基因进行表达谱分析第31页
     ·数据分析第31页
   ·miRNA表达载体和双荧光素酶报告载体的构建第31-33页
     ·插入片段的扩增第31-32页
     ·载体的连接、测序及序列分析第32页
     ·质粒的抽提及酶切鉴定第32-33页
   ·细胞的培养第33页
   ·miRNA表达载体转染猪睾丸细胞及转染后miRNA表达水平的检测第33页
   ·双荧光素酶报告载体与miRNA表达载体共转染猪睾丸细胞第33页
   ·双荧光素酶相对活性测定与分析第33-34页
第三章 结果与分析第34-48页
 1 猪睾丸组织总RNA的提取与质量检测及cDNA检测结果第34-35页
   ·总RNA浓度测定第34页
   ·总RNA质量检测结果第34页
   ·cDNA检测结果第34-35页
 2 猪睾丸组织总RNA加尾处理及加尾后cDNA检测结果第35-36页
   ·加尾处理后RNA的质量检测结果第35页
   ·加尾处理后cDNA检测结果第35-36页
 3 miRNAs芯片筛选性成熟前后差异表达的miRNA第36-37页
 4 差异表达miRNA的实时定量PCR验证第37-40页
   ·PCR扩增结果第37页
   ·实时定量PCR第37-40页
 5 靶基因预测及其在睾丸组织不同发育时期的表达分析第40-45页
   ·靶基因预测第40-43页
   ·靶基因PCR扩增结果第43页
   ·靶基因的实时定量PCR第43-45页
 6 miRNA表达载体和双荧光素酶报告载体的构建与鉴定第45-48页
   ·插入片段的PCR扩增第45页
   ·重组质粒的酶切鉴定第45-46页
   ·实时定量PCR检测转染后miRNA表达水平第46页
   ·双荧光素酶活性检测第46-48页
第四章 讨论第48-55页
 1 关于差异表达miRNA第48-49页
   ·关于miRNAs基因的预测方法第48页
   ·关于差异表达miRNA的获得第48-49页
 2 关于靶基因的预测第49页
 3 关于本实验靶基因的验证第49-52页
   ·关于AQN-1基因第50页
   ·关于DAZL基因第50-51页
   ·关于HAS3基因第51页
   ·关于RNF4基因第51页
   ·关于SMCP基因第51页
   ·关于SPAG1基因第51-52页
   ·关于SPAM-1基因第52页
 4 关于实时定量PCR第52-53页
 5 关于载体的构建第53页
 6 关于miRNAs与靶基因相互作用关系的鉴定第53-54页
 7 不足之处和下一步工作计划第54-55页
小结第55-56页
参考文献第56-63页
致谢第63-64页
附录第64-82页

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