杂交鲤鱼亲子鉴定微卫星标记的评估及鲤鱼免疫相关芯片探针的筛选和注释
| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-21页 |
| 1. 亲权关系简介 | 第11页 |
| 2. 亲权关系鉴定的方法 | 第11-18页 |
| ·传统鉴定方法 | 第11-13页 |
| ·表型标记 | 第11-12页 |
| ·系谱记录 | 第12页 |
| ·生化标记 | 第12-13页 |
| ·基于 DNA 水平上的鉴定方法 | 第13-18页 |
| ·DNA 指纹 | 第13-14页 |
| ·DNA 序列分析 | 第14页 |
| ·微卫星 DNA 的多态性 | 第14-15页 |
| ·单链构型多态性 | 第15页 |
| ·单核苷酸多态性 | 第15-16页 |
| ·限制性酶切片段长度多态性(RFLP) | 第16页 |
| ·随机扩增 DNA 多态(RAPD) | 第16-17页 |
| ·扩增片段长度多态性(AFLP) | 第17-18页 |
| 3. 微卫星标记在亲权鉴定上的应用 | 第18-21页 |
| ·微卫星研究简史 | 第18页 |
| ·微卫星的分类与分布 | 第18页 |
| ·微卫星的功能 | 第18-19页 |
| ·利用微卫星标记进行亲权关系鉴定的实验步骤 | 第19-21页 |
| ·样品获得及基因组 DNA 提取 | 第19页 |
| ·亲权鉴定微卫星标记的选择及引物的设计 | 第19页 |
| ·结果处理与分析 | 第19-21页 |
| 第二章 评价并筛选杂交鲤亲子鉴定的微卫星标记 | 第21-39页 |
| 1. 前言 | 第21页 |
| 2. 材料和方法 | 第21-26页 |
| ·材料 | 第21-22页 |
| ·主要试剂 | 第22-24页 |
| ·DNA 提取相关试剂 | 第22-23页 |
| ·PCR 扩增相关试剂 | 第23页 |
| ·非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳用试剂 | 第23页 |
| ·银染相关试剂 | 第23-24页 |
| ·主要耗材 | 第24页 |
| ·主要仪器 | 第24页 |
| ·微卫星引物 | 第24-26页 |
| ·引物的来源 | 第24-26页 |
| ·引物的稀释 | 第26页 |
| 3.实验流程 | 第26-29页 |
| ·DNA 的提取 | 第26-27页 |
| ·DNA 的扩增 | 第27页 |
| ·非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第27-28页 |
| ·8%非变性聚丙烯凝胶的配制 | 第27页 |
| ·8%非变性聚丙烯凝胶的灌制 | 第27-28页 |
| ·电泳 | 第28-29页 |
| ·准备电泳 | 第28页 |
| ·预电泳 | 第28页 |
| ·电泳 | 第28-29页 |
| ·银染 | 第29页 |
| 4 数据统计与分析 | 第29-30页 |
| ·数据获得及处理 | 第29页 |
| ·标记的遗传特性及群体遗传多样性分析 | 第29-30页 |
| ·亲子鉴定分析 | 第30页 |
| 5. 结果 | 第30-37页 |
| ·DNA 扩增结果 | 第30-31页 |
| ·标记的遗传特性及群体遗传多样性分析 | 第31-32页 |
| ·亲子鉴定分析 | 第32-36页 |
| ·聚类分析 | 第36-37页 |
| 6. 讨论 | 第37-39页 |
| ·标记的遗传多样性分析 | 第37-38页 |
| ·亲子鉴定分析 | 第38-39页 |
| 第三章 鲤鱼免疫相关芯片探针的筛选和注释 | 第39-52页 |
| 1. 研究背景 | 第39-40页 |
| 2. 芯片设计 | 第40-51页 |
| ·探针选择的原理 | 第40-41页 |
| ·内参基因 | 第41页 |
| ·材料与方法 | 第41-43页 |
| ·数据检索与收集 | 第41-43页 |
| ·数据比对及分析 | 第43页 |
| ·内参基因的筛选 | 第43页 |
| ·分析结果 | 第43-51页 |
| ·数据收集与整理 | 第43-44页 |
| ·数据在 KEGG 通路的注释 | 第44-50页 |
| ·内参基因的筛选 | 第50-51页 |
| 3.讨论 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-58页 |
| 附录一 | 第58-59页 |
| 附录二 | 第59-65页 |
| 附录三 | 第65-72页 |
| 主要试剂和配制 | 第72-74页 |
| 试剂的配制 | 第72-74页 |
| 致谢 | 第74-75页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第75页 |