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家蚕正反交F1代SAGE文库的构建与分析及差异基因的时空表达谱研究

中文摘要第1-7页
Abstract第7-14页
第一章 文献综述第14-24页
 1.正反交遗传第14-15页
   ·伴性遗传第14页
   ·家蚕伴性遗传第14-15页
   ·细胞质遗传第15页
 2.基因差异表达研究技术第15-24页
   ·mRNA 差异显示及其应用第15-17页
     ·mRNA 差异显示简介第15-16页
     ·mRNA 差异显示技术在昆虫学研究中的应用第16-17页
   ·消减杂交技术及研究进展第17-20页
     ·消减杂交技术的应用第18-19页
     ·消减杂交技术在药物研发中的应用第19页
     ·SSH 技术在性别发育及肌肉品质研究中的应用第19-20页
     ·SSH 技术在环境胁迫及生物修复研究中的应用第20页
   ·基因表达系列分析(SAGE)技术第20-24页
     ·基因表达系列分析(SAGE)概念及原理第20页
     ·SAGE 技术的发展第20-21页
     ·SAGE 技术的数据分析第21-22页
     ·SAGE 在家蚕研究中的应用第22-24页
第二章 研究方案第24-26页
 1 研究目的与意义第24页
 2 研究内容第24-25页
 3 技术路线第25-26页
第三章 基本实验方法第26-32页
 1 常用材料与试剂第26-28页
   ·蚕品种与菌种第26页
   ·主要试剂第26页
   ·培养基第26-27页
   ·缓冲液和常用溶液第27页
   ·核酸电泳相关试剂第27-28页
   ·生物信息学资源及分析软件第28页
 2 主要仪器设备第28-29页
 3 基本实验方法第29-32页
   ·总 RNA 的抽提第29页
   ·RNA 反转录第29页
   ·PCR 扩增反应程序及扩增体系第29页
   ·PCR 产物的回收与连接第29-30页
   ·感受态细胞制备第30页
   ·连接产物的转化第30页
   ·重组质粒的筛选第30页
   ·碱裂解法少量制备质粒 DNA第30-31页
   ·酶切反应第31-32页
第四章 家蚕正反交 F1 代 SAGE 文库的构建与分析第32-45页
 1 材料与方法第32-36页
   ·生物材料与仪器第32页
   ·RNA 的抽提及 mRNA 的分离第32页
   ·SAGE 文库的构建第32-34页
   ·标签分析和注释第34页
   ·差异基因的鉴定和功能分析第34-35页
   ·差异基因的功能分析第35-36页
 2 结果与分析第36-42页
   ·家蚕正反交 F1 代的 SAGE 文库基本信息第36-38页
   ·家蚕正反交 F1代差异基因分析第38页
   ·家蚕正反交 F1代显著性差异基因的功能分析第38-40页
   ·家蚕正反交 F1代显著性差异基因的 Pathway 分析第40-42页
 3 讨论第42-45页
第五章 差异基因的时空表达研究第45-62页
 1 材料和方法第46页
   ·试验取材第46页
   ·所用引物第46页
 2 结果与分析第46-60页
   ·高温条件下线粒体硫氧还蛋白 2(BGIBMGA012029)的时空表达第46-48页
   ·高温条件下谷胱甘肽过氧化物酶(GPx)(BGIBMGA011438)的时空表达第48-50页
   ·高温条件下家蚕素 E-1 前体(BGIBMGA000667)时空表达第50-51页
   ·高温条件下抗菌肽(BGIBMGA000023)时空表达第51-53页
   ·高温条件下假设蛋白(BGIBMGA003920)时空表达第53-54页
   ·三个组织中 5 个基因在高温和常温下的表达分析第54-60页
     ·高温和常温下 5 个基因在脂肪体中的表达分析第54-56页
     ·高温和常温下 5 个基因在中肠中的表达分析第56-58页
     ·丝腺中 5 个基因高温和常温下的表达分析第58-60页
 3 讨论第60-62页
第六章 家蚕正反交 SAGE 文库中部分标签延长第62-73页
 1 材料与方法第62-65页
   ·材料第62页
     ·生物材料第62页
     ·标签延伸第62页
   ·方法第62-65页
     ·双链 DNA 的合成原理第62-63页
     ·双链 DNA 的合成过程第63-64页
     ·标签(CATG 识别位点)酶切第64页
     ·磁珠吸附第64-65页
     ·加 Adapter A 接头第65页
     ·PCR 扩增第65页
     ·DNA 克隆、鉴定及测序第65页
     ·序列分析第65页
 2 结果与分析第65-71页
   ·RNA 的提取及质量测定第65-66页
   ·双链 cDNA 合成及酶切第66-67页
   ·GLGI 扩增结果第67页
   ·序列分析第67-71页
 3 结论与讨论第71-73页
第七章 综合结论第73-75页
 1 基于 SAGE 文库的正反交差异表达基因的比较及筛选第73页
 2 反交子代大多数基因的上调与其对环境适应能力较高有关第73页
 3 正反交差异基因的时空表达谱第73-74页
 4 无注释信息的差异性 tag 标签 GLGI 扩增延长第74-75页
参考文献第75-82页
研究生期间发表的文章、专利第82-83页
致谢第83-84页

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