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中棉所36花发育均一化cDNA文库构建及EST分析

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-11页
英文缩略表第11-12页
第一章 文献综述第12-29页
 1.植物花发育相关基因的研究进展第12-17页
   ·植物成花机理第12-16页
     ·成花诱导过程(Induction process)第12-13页
     ·花序分生组织的形成第13-14页
     ·花分生组织的形成第14-15页
     ·花器官原基的形成第15-16页
   ·棉花花发育相关基因研究第16-17页
 2.基因文库第17-22页
   ·基因组文库和cDNA文库第17-18页
   ·构建cDNA文库的方法第18-21页
     ·cDNA文库的构建第18页
     ·均一化cDNA文库的构建第18-19页
     ·复性式均一化技术第19-20页
       ·Carninci法第20页
       ·DSN法第20页
     ·与基因组饱和杂交的方法第20-21页
   ·棉花cDNA文库的构建和应用第21-22页
   ·cDNA文库的缺点第22页
 3 EST技术及其应用第22-27页
   ·EST及其研究概况第22-23页
   ·EST技术的原理和方法第23-24页
   ·EST的应用第24-27页
     ·构建遗传学图谱第24-25页
     ·分离与鉴定新基因第25页
     ·基因差异表达的研究第25-26页
     ·比较基因组学研究第26页
     ·用于制备DNA芯片第26-27页
   ·棉花EST第27页
 4.本研究的目的意义第27-29页
第二章 中棉所36花发育期均一化CDNA文库的构建第29-56页
 1 实验材料与试剂第29-30页
   ·实验材料第29-30页
   ·化学试剂、酶及试剂盒第30页
 2 实验方法第30-45页
   ·总RNA的提取第30-31页
   ·mRNA的分离纯化第31-32页
   ·cDNA的合成第32-33页
     ·合成cDNA第一链第32-33页
     ·cDNA扩增(Long-distancePCR,LD-PCR)第33页
   ·cDNA的均一化第33-37页
     ·特异降解双链DNA酶(DSN)的稀释第33页
     ·DSN活性检测第33-34页
     ·准备用于均一化的双链cDNA第34页
     ·杂交第34-35页
     ·DSN处理第35-36页
     ·对DSN处理的样品进行第1次PCR扩增第36-37页
     ·对DSN处理的样品进行第2次PCR扩增第37页
   ·蛋白酶处理第37-38页
   ·sfi Ⅰ酶处理第38页
   ·用Chroma SPIN—400将cDNA按分子大小分级分部第38-39页
   ·处理后dscDNA与载体pDNR-LIB连接第39-40页
   ·连接产物转化(以下操作均在无菌环境下进行)第40页
   ·均一化文库滴度检测第40-41页
   ·均一化文库插入片断长度检测第41页
   ·cDNA均一化效果分析第41-45页
     ·虚拟Northern blot(Virtual Northern blot)第41-45页
 3 实验结果与分析第45-52页
   ·总RNA的提取第45-46页
   ·mRNA的分离第46-47页
   ·mRNA反转录成全长cDNA第47页
   ·均一化第47-49页
     ·全长cDNA的均一化第47-48页
     ·均一化cDNA的第二次扩增第48-49页
   ·用Chroma SPIN—400将cDNA按分子大小分级分部第49页
   ·克隆数目和重组率的鉴定第49-50页
   ·插入片断长度的检测第50-51页
   ·均一化cDNA文库的均一化效果分析第51-52页
 4 讨论第52-56页
   ·取样第52页
   ·棉花总RNA的提取第52-53页
   ·mRNA的纯化及反转录第53页
   ·均一化全长cDNA文库第53-54页
   ·DSN法与其它均一化方法的比较第54-56页
第三章 中棉所36花发育期表达序列标签(EST)分析第56-63页
 1 分析材料第56页
 2 生物信息学分析第56-57页
   ·序列拼接第56页
   ·基因注释及功能分类第56-57页
 3 结果与分析第57-62页
   ·有效EST序列的获得第57-58页
   ·EST序列拼接分析第58-59页
   ·基因表达频率与均一化分析第59页
   ·基因注释及功能分类第59-62页
 4 讨论第62-63页
   ·Blastn与Blastx比对结果的差异第62页
   ·ESTs与数据库同源性比较第62-63页
第四章 展望第63-64页
参考文献第64-71页
附录第71-72页
致谢第72页

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