| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 目录 | 第10-12页 |
| 第1章 前言 | 第12-17页 |
| ·研究蛋白质-多肽相互作用与识别的背景和意义 | 第12-13页 |
| ·计算机辅助药物设计 | 第13页 |
| ·分子对接 | 第13-14页 |
| ·绿豆胰蛋白酶抑制剂与 FURIN | 第14-15页 |
| ·主要研究内容 | 第15-17页 |
| 第2章 分子对接的原理和发展方向 | 第17-23页 |
| ·引言 | 第17页 |
| ·分子对接算法的基本原理 | 第17-19页 |
| ·分子对接的发展方向 | 第19-23页 |
| ·柔性对接 | 第19页 |
| ·溶剂化效应 | 第19-20页 |
| ·并行计算 | 第20-21页 |
| ·反向对接 | 第21-22页 |
| ·多体对接 | 第22-23页 |
| 第3章 分子对接程序及应用 | 第23-33页 |
| ·DOCK | 第23-24页 |
| ·AUTODOCK | 第24-26页 |
| ·ZDOCK | 第26-27页 |
| ·CHEMSCORE | 第27-28页 |
| ·TPSODOCK | 第28页 |
| ·由小分子对接到蛋白质与多肽对接上有待解决的问题 | 第28-29页 |
| ·对接算法的选择 | 第29-33页 |
| 第4章 蛋白质-多肽-蛋白质三体体系对接研究 | 第33-56页 |
| ·概述 | 第33-35页 |
| ·研究蛋白质多体体系的意义 | 第33-34页 |
| ·蛋白质三体体系的定义 | 第34页 |
| ·蛋白质三体体系中有待解决的问题 | 第34-35页 |
| ·蛋白质-多肽-蛋白质三体体系中的对接策略 | 第35-36页 |
| ·三体体系对接策略和原则 | 第35-36页 |
| ·三体体系对接计算流程 | 第36页 |
| ·研究体系 | 第36-40页 |
| ·蛋白酶抑制剂概述 | 第38页 |
| ·Bowman-Birk类蛋白酶抑制剂 | 第38-39页 |
| ·Kunitz类蛋白酶抑制剂 | 第39页 |
| ·Bowman-Birk类绿豆胰蛋白酶抑制剂及其双头结构 | 第39-40页 |
| ·结果与讨论 | 第40-43页 |
| ·基于 MBTI双活性位点的对接策略 | 第43-51页 |
| ·屏蔽策略 | 第44-47页 |
| ·分割策略 | 第47-51页 |
| ·三体体系对接策略的测试 | 第51-56页 |
| 第5章 将绿豆胰蛋白酶抑制剂改造为 FURIN抑制剂研究 | 第56-74页 |
| ·前体加工酶 FURIN | 第56-60页 |
| ·furin的结构 | 第57-58页 |
| ·前体加工酶furin与疾病和病原体感染 | 第58-59页 |
| ·前体加工酶抑制剂 | 第59-60页 |
| ·FURIN短肽类抑制剂设计与对接 | 第60-69页 |
| ·furin短肽类抑制剂的设计 | 第60-62页 |
| ·对接计算与结果 | 第62-69页 |
| ·FURIN蛋白质类抑制剂的设计 | 第69-74页 |
| ·MBTI-furin-MBTI间的三体对接 | 第70-74页 |
| 第6章 本文总结与工作展望 | 第74-75页 |
| ·本文总结 | 第74页 |
| ·对未来工作的展望 | 第74-75页 |
| 致谢 | 第75-76页 |
| 参考文献 | 第76-82页 |
| 个人简历 在读期间发表的学术论文与研究成果 | 第82页 |