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中国羽藓科(Thuidiaceae)系统发育研究--基于形态和rbcL、rps4基因序列数据

前言第1-12页
第一章 羽藓科经典分类第12-40页
 1. 藓类植物经典系统分类第12-16页
   ·羽藓科的建立及经典分类回顾第12-14页
   ·中国羽藓科系统分类现状第14-16页
 2. 本研究分类群形态学特征第16-40页
第二章 分子系统学研究第40-57页
 1. 分子系统学研究概况第40-41页
   ·分子系统学的形成及其发展简史第40-41页
   ·分子系统学常用的研究方法及其应用第41页
 2. 植物分子系统学第41-44页
   ·植物分子系统学的发展简史第41-42页
   ·植物分子系统学的研究特点第42-43页
   ·植物分子系统学主要分子标记第43-44页
     ·随机扩增多态性标记(RAPD)第43页
     ·限制性内切酶片段长度多态性(RFLP)标记第43-44页
     ·微卫星标记(SSR)第44页
     ·扩增限制性片段长度多态性(AFLP 标记)第44页
     ·核酸序列分析第44页
 3. 苔藓植物分子系统学研究进展第44-53页
   ·藓类植物的分子系统学研究方法及其应用现状第46-52页
     ·同功酶电泳技术及其应用第46-47页
     ·DNA 序列在苔藓植物系统学研究中的应用第47-52页
     ·其它分子标记的应用第52页
   ·序列数据的处理与分析第52-53页
 4. 羽藓科分子系统学研究进展第53-54页
 5. 羽藓科系统分类存在的问题第54-56页
 6. 本研究的目的与意义第56-57页
第三章 实验材料及方法第57-64页
 1. 材料采集第57-60页
   ·植物材料采集与处理第57-59页
   ·试剂及来源第59页
   ·主要仪器第59-60页
 2. 实验方法第60-64页
   ·总 DNA 提取与纯化第60页
   ·目标片段 PCR 扩增第60-62页
     ·扩增反应体系第60-61页
     ·rps4 和rbcL 片段的扩增引物第61页
     ·PCR 扩增程序第61-62页
   ·PCR 产物纯化第62页
   ·序列分析及系统树构建第62-64页
第四章 结果与分析第64-77页
 1. 不同方法提取的 DNA 含量第64页
 2. PCR 扩增体系的筛选及扩增结果第64-77页
   ·不同酶浓度对片段扩增的影响第64-65页
   ·扩增结果第65页
   ·rbcL 和rps4 片段长度和变异第65-72页
   ·系统发育树的构建与分析比较第72-77页
     ·基于rbcL 基因序列的的系统树第72页
     ·基于rps4 的系统树第72-77页
第五章 讨论第77-87页
 1. 实验方法第77-78页
   ·藓类植物的 DNA 提取方法比较第77页
   ·特异片段的扩增第77-78页
 2. 数据分析方法第78-80页
   ·不同系统树构建方法对结果的影响第78-79页
   ·DNA 测序的应用及其局限性第79-80页
 3. rbcL 及rps4 在羽藓科系统研究中的价值第80-81页
 4. 羽藓科系统发育关系的探讨第81-86页
   ·羽藓科形态学特征第81-82页
   ·基于形态及rbcL & rps4 基因序列数据羽藓科系统分析第82-84页
     ·牛舌藓科建立的自然性第82-83页
     ·沼羽藓亚科的系统位置第83-84页
     ·山羽藓的系统位置第84页
     ·羽藓科与邻近科的系统关系第84页
   ·羽藓科的范畴第84-86页
 5. 进一步研究的几个问题第86-87页
第六章 结论第87-89页
 1. 本论文的重要结论第87-88页
 2. 本论文的创新点第88-89页
参考文献第89-98页
附录1第98-100页
附录2第100-116页
附录3第116-124页
附录4第124-130页
详细摘要第130-138页

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