第一部分 综述部分 | 第1-21页 |
·前言 | 第9页 |
·结核分支杆菌的分泌性蛋白 | 第9-11页 |
·MTB的分泌蛋白在疫苗研究中的应用 | 第9-10页 |
·亚单位疫苗 | 第9-10页 |
·DNA疫苗 | 第10页 |
·MTB的分泌蛋白在临床诊断中的潜在价值 | 第10-11页 |
·原核细胞蛋白质分泌的机理 | 第11-14页 |
·信号肽的结构特点 | 第11-12页 |
·参与原核细胞蛋白质转运的胞质成分和内膜成分 | 第12-14页 |
·转运过程中的能量需求 | 第14页 |
·分泌性蛋白的研究方法 | 第14-21页 |
·试验生物学方法 | 第14-17页 |
·二维凝胶电泳法 | 第14-15页 |
·基因融合法 | 第15-17页 |
·生物信息学方法 | 第17-21页 |
·Chou-Fasman方法 | 第18-19页 |
·GOR方法 | 第19页 |
·最近邻居方法 | 第19页 |
·神经网络方法 | 第19-20页 |
·隐马尔科夫模型 | 第20-21页 |
第二部分 研究内容 | 第21-44页 |
·结核杆菌分泌蛋白预测体系的建立 | 第21-29页 |
·设备和方法 | 第21-25页 |
·仪器设备与数据来源 | 第21页 |
·设计方法 | 第21-25页 |
(1) 搜集结核杆菌H37Rv基因组和蛋白组信息 | 第22页 |
(2) 数据分析 | 第22页 |
(3) 建立数据库 | 第22-24页 |
① 需求分析 | 第23页 |
② 建立数据库 | 第23-24页 |
③ 生成应用程序安装盘 | 第24页 |
(4) 获得分泌性蛋白和膜蛋白 | 第24页 |
(5) BLASTp分析,获得结核杆菌H37Rv特有的分泌性蛋白 | 第24-25页 |
·结果 | 第25-29页 |
(1) H37Rv基因组和蛋白组信息搜集结果 | 第25页 |
(2) H37Rv蛋白组信号肽和跨膜区分析结果 | 第25-26页 |
(3) 数据库系统功能 | 第26-27页 |
(4) 获得分泌性蛋白和膜蛋白 | 第27-28页 |
(5) BLASTp分析结果 | 第28-29页 |
·预测结果的验证 | 第29-44页 |
·材料和方法 | 第29-37页 |
·实验材料 | 第29-32页 |
(1) 菌种和载体 | 第29-31页 |
(2) H37Rv基因组 | 第31页 |
(3) PCR引物 | 第31页 |
(4) 常用分子生物学试剂 | 第31页 |
(5) 主要仪器 | 第31页 |
(6) 常用缓冲液系统 | 第31-32页 |
·实验方法 | 第32-37页 |
(1) Rv3491基因扩增 | 第32-33页 |
(2) Ta克隆 | 第33-35页 |
(3) 测序 | 第35页 |
(4) 测序结果的序列比对 | 第35页 |
(5) 表达体系的构建 | 第35-36页 |
(6) Rv3491蛋白的诱导表达 | 第36页 |
(7) Rv3491蛋白的可溶性分析 | 第36页 |
(8) Rv3491蛋白的分泌性验证 | 第36-37页 |
·结果 | 第37-44页 |
·Rv3491 PCR扩增结果 | 第37页 |
·Ta克隆转化后JM109菌落的生长情况 | 第37-38页 |
·酶切及PCR鉴定结果 | 第38页 |
·T-Rv3491质粒插入序列正向测序结果 | 第38-39页 |
·T-Rv3491质粒插入序列与Rv3491基因序列比对结果 | 第39-40页 |
·T-Rv3491质粒、pET32a表达载体的酶切图谱 | 第40页 |
·pET32a-Rv3491 PCR及酶切鉴定结果 | 第40-41页 |
·IPTG诱导表达 | 第41页 |
·可溶性分析 | 第41-42页 |
·Rv3491蛋白的细胞定位 | 第42-44页 |
第三部分 讨论 | 第44-48页 |
小结 | 第48-49页 |
参考文献 | 第49-52页 |
致谢 | 第52页 |