摘要 | 第1-6页 |
Abstract | 第6-11页 |
第一章 前言对虾白斑综合征病毒(WSSV)致病相关基因及基因组可变区位点研究进展 | 第11-27页 |
1 白斑综合征病毒致病相关基因研究进展 | 第11-17页 |
·囊膜蛋白基因 | 第11-14页 |
·核衣壳蛋白基因 | 第14页 |
·病毒复制关键酶基因 | 第14-15页 |
·其它基因 | 第15-16页 |
·讨论 | 第16-17页 |
2 白斑综合征病毒基因组可变区位点研究进展 | 第17-22页 |
·ORF23/24 | 第18页 |
·ORF14/15 | 第18-19页 |
·可能的转座酶基因(transposase) | 第19页 |
·同源重复区(homologous regions ,hrs) | 第19-20页 |
·VNTR | 第20-21页 |
·单核苷酸突变 | 第21页 |
·讨论 | 第21-22页 |
参考文献 | 第22-27页 |
第二章 白斑综合征病毒(WSSV) PCR检测中使用含dUTP的dNTP混合物扩增的极限长度 | 第27-35页 |
1 材料和方法 | 第27-29页 |
·材料 | 第27页 |
·PCR引物及程序 | 第27-28页 |
·使用dUTP扩增极限长度的确定 | 第28-29页 |
·随扩增长度变化最适Mg~(2+)浓度变化趋势的确定 | 第29页 |
2 结果 | 第29-32页 |
·使用dUTP扩增极限长度 | 第29-31页 |
·随扩增长度变化最适Mg~(2+)浓度变化趋势 | 第31页 |
·Platinum taq 扩增结果 | 第31-32页 |
3 讨论 | 第32-33页 |
参考文献 | 第33-35页 |
第三章 中国境内白斑综合征病毒(WSSV)分离株基因组可变区位点的序列差异分析 | 第35-68页 |
1 材料与方法 | 第35-42页 |
·分离株的采集 | 第35-36页 |
·各分离株DNA 的提取 | 第36-37页 |
·WSSV的检测 | 第37页 |
·各可变区特异性引物的设计 | 第37-39页 |
·PCR反应体系及反应程序 | 第39页 |
·PCR产物的纯化 | 第39-40页 |
·产物克隆及测序 | 第40-42页 |
·各可变区序列差异分析 | 第42页 |
·基于每个可变区序列构建中国境内分离株的进化关系图谱 | 第42页 |
2 结果 | 第42-64页 |
·各分离株WSSV检测结果 | 第42-43页 |
·transposes | 第43页 |
·ORF23/24 | 第43-50页 |
·ORF75 | 第50-54页 |
·ORF94 | 第54-55页 |
·ORF125 | 第55-56页 |
·ORF14/15 | 第56-61页 |
·胸腺嘧啶合成酶基因(TS) | 第61-62页 |
·基于各可变区序列构建中国境内分离株的进化关系图谱 | 第62-64页 |
3 讨论 | 第64-67页 |
·各可变区位点PCR反应条件的摸索 | 第64页 |
·ORF23/24 中大片段缺失原因的探讨 | 第64-65页 |
·不同宿主中WSSV分离株可变区的差异 | 第65页 |
·中国各地WSSV的来源与传播途径 | 第65-67页 |
参考文献 | 第67-68页 |
第四章 中国境内白斑综合征病毒(WSSV)分离株致病相关基因的序列差异 | 第68-102页 |
1 材料与方法 | 第68-70页 |
·实验材料与试剂 | 第68页 |
·待测致病相关基因的选择与引物的设计 | 第68页 |
·PCR扩增体系及反应程序 | 第68页 |
·产物纯化 | 第68-70页 |
·产物克隆及测序 | 第70页 |
·测序结果分析 | 第70页 |
2 结果 | 第70-98页 |
·vp281(vp37) | 第70-75页 |
·vp28 | 第75-79页 |
·vp24 | 第79-82页 |
·wsv366 | 第82-84页 |
·ORF390 | 第84-90页 |
·wsv191 | 第90-95页 |
·vp35 | 第95页 |
·vp19 | 第95-96页 |
·基于每个致病相关基因序列构建的中国境内WSSV分离株的进化关系 | 第96-98页 |
3 讨论 | 第98-100页 |
参考文献 | 第100-102页 |
附录 | 第102-104页 |
致谢 | 第104-105页 |
个人简历 | 第105-106页 |
发表的学术论文 | 第106页 |