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中国境内白斑综合征病毒(WSSV)分离株的序列差异分析

摘要第1-6页
Abstract第6-11页
第一章 前言对虾白斑综合征病毒(WSSV)致病相关基因及基因组可变区位点研究进展第11-27页
 1 白斑综合征病毒致病相关基因研究进展第11-17页
   ·囊膜蛋白基因第11-14页
   ·核衣壳蛋白基因第14页
   ·病毒复制关键酶基因第14-15页
   ·其它基因第15-16页
   ·讨论第16-17页
 2 白斑综合征病毒基因组可变区位点研究进展第17-22页
   ·ORF23/24第18页
   ·ORF14/15第18-19页
   ·可能的转座酶基因(transposase)第19页
   ·同源重复区(homologous regions ,hrs)第19-20页
   ·VNTR第20-21页
   ·单核苷酸突变第21页
   ·讨论第21-22页
 参考文献第22-27页
第二章 白斑综合征病毒(WSSV) PCR检测中使用含dUTP的dNTP混合物扩增的极限长度第27-35页
 1 材料和方法第27-29页
   ·材料第27页
   ·PCR引物及程序第27-28页
   ·使用dUTP扩增极限长度的确定第28-29页
   ·随扩增长度变化最适Mg~(2+)浓度变化趋势的确定第29页
 2 结果第29-32页
   ·使用dUTP扩增极限长度第29-31页
   ·随扩增长度变化最适Mg~(2+)浓度变化趋势第31页
   ·Platinum taq 扩增结果第31-32页
 3 讨论第32-33页
 参考文献第33-35页
第三章 中国境内白斑综合征病毒(WSSV)分离株基因组可变区位点的序列差异分析第35-68页
 1 材料与方法第35-42页
   ·分离株的采集第35-36页
   ·各分离株DNA 的提取第36-37页
   ·WSSV的检测第37页
   ·各可变区特异性引物的设计第37-39页
   ·PCR反应体系及反应程序第39页
   ·PCR产物的纯化第39-40页
   ·产物克隆及测序第40-42页
   ·各可变区序列差异分析第42页
   ·基于每个可变区序列构建中国境内分离株的进化关系图谱第42页
 2 结果第42-64页
   ·各分离株WSSV检测结果第42-43页
   ·transposes第43页
   ·ORF23/24第43-50页
   ·ORF75第50-54页
   ·ORF94第54-55页
   ·ORF125第55-56页
   ·ORF14/15第56-61页
   ·胸腺嘧啶合成酶基因(TS)第61-62页
   ·基于各可变区序列构建中国境内分离株的进化关系图谱第62-64页
 3 讨论第64-67页
   ·各可变区位点PCR反应条件的摸索第64页
   ·ORF23/24 中大片段缺失原因的探讨第64-65页
   ·不同宿主中WSSV分离株可变区的差异第65页
   ·中国各地WSSV的来源与传播途径第65-67页
 参考文献第67-68页
第四章 中国境内白斑综合征病毒(WSSV)分离株致病相关基因的序列差异第68-102页
 1 材料与方法第68-70页
   ·实验材料与试剂第68页
   ·待测致病相关基因的选择与引物的设计第68页
   ·PCR扩增体系及反应程序第68页
   ·产物纯化第68-70页
   ·产物克隆及测序第70页
   ·测序结果分析第70页
 2 结果第70-98页
   ·vp281(vp37)第70-75页
   ·vp28第75-79页
   ·vp24第79-82页
   ·wsv366第82-84页
   ·ORF390第84-90页
   ·wsv191第90-95页
   ·vp35第95页
   ·vp19第95-96页
   ·基于每个致病相关基因序列构建的中国境内WSSV分离株的进化关系第96-98页
 3 讨论第98-100页
 参考文献第100-102页
附录第102-104页
致谢第104-105页
个人简历第105-106页
发表的学术论文第106页

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