| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-32页 |
| ·细菌群体感应及其调节机制 | 第14-22页 |
| ·革兰氏阴性菌中AHL信号介导的QS系统 | 第14-17页 |
| ·革兰氏阴性菌中非AHL信号介导的OS系统 | 第17-19页 |
| ·革兰氏阳性菌中寡肽信号介导的OS系统 | 第19-21页 |
| ·革兰氏阳性菌中非寡肽信号介导的QS系统 | 第21页 |
| ·AI-2信号介导的种间QS机制 | 第21-22页 |
| ·Xcc中的群体感应和毒性调控机制 | 第22-25页 |
| ·Xcc使用一种新型的OS信号 | 第23页 |
| ·RpfC/RpfG双组分系统感应信号 | 第23页 |
| ·第二信使c-di-GMP进一步传递信号 | 第23-24页 |
| ·全局转录调节子Clp在OS中的调控作用 | 第24页 |
| ·Xcc中复杂的信号调控网络 | 第24-25页 |
| ·c-di-GMP在细菌致病性中的作用 | 第25-30页 |
| ·c-di-GMP的合成和降解 | 第26-27页 |
| ·调控c-di-GMP合成和降解的机制 | 第27-28页 |
| ·c-di-GMP对致病性的调控机制 | 第28-30页 |
| ·本研究的目的意义和技术路线 | 第30-32页 |
| ·研究目的和意义 | 第30-31页 |
| ·技术路线 | 第31-32页 |
| 第二章 Xoo在水稻植株内群体感应现象鉴定 | 第32-46页 |
| ·实验材料 | 第33页 |
| ·菌株 | 第33页 |
| ·生化试剂 | 第33页 |
| ·培养基和菌株培养条件 | 第33页 |
| ·实验方法 | 第33-36页 |
| ·水稻接种 | 第33页 |
| ·Xoo和Xooc基因组DNA的制备 | 第33-34页 |
| ·水稻叶片基因组DNA的制备 | 第34页 |
| ·引物设计和筛选 | 第34-35页 |
| ·常规PCR验证引物特异性 | 第35页 |
| ·real-time PCR扩增反应体系 | 第35-36页 |
| ·标准曲线的制作 | 第36页 |
| ·病原菌的回收分离和计数 | 第36页 |
| ·结果与分析 | 第36-45页 |
| ·特异性引物筛选 | 第36-38页 |
| ·Xoo Real-time PCR标准曲线的制作 | 第38-39页 |
| ·Xoo接种水稻植株后的实时PCR定量分析 | 第39-41页 |
| ·Xoo种群量变化及其与水稻显症之间的关系 | 第41-42页 |
| ·Xooc real-time PCR标准曲线的制作 | 第42页 |
| ·Xooc接种水稻植株后的实时PCR定量分析 | 第42-44页 |
| ·Xooc种群量变化及其与水稻显症之间的关系 | 第44-45页 |
| ·讨论 | 第45-46页 |
| 第三章 DSF系统中rpfFxoo、rpfCxoo和rpfGxoo基因功能分析 | 第46-84页 |
| ·实验材料 | 第47-49页 |
| ·菌株和质粒 | 第47页 |
| ·生化试剂 | 第47页 |
| ·培养基和菌株培养条件 | 第47-49页 |
| ·实验方法 | 第49-58页 |
| ·目的基因的扩增 | 第49页 |
| ·目的基因片段纯化 | 第49-50页 |
| ·目的基因片段的连接与转化 | 第50页 |
| ·质粒DNA的提取 | 第50-51页 |
| ·自杀载体的构建 | 第51页 |
| ·用标记置换法构建突变体 | 第51-52页 |
| ·构建突变体的互补菌株 | 第52-53页 |
| ·ΔrpfFCxoo和ΔrpfFGxoo双基因突变菌株构建 | 第53页 |
| ·基因序列的生物信息学分析 | 第53页 |
| ·生长曲线测定 | 第53页 |
| ·突变体运动性检测 | 第53页 |
| ·突变体胞外酶活性的检测 | 第53-54页 |
| ·胞外多糖分泌检测和菌落形态观察 | 第54页 |
| ·DSF信号检测 | 第54页 |
| ·生物被膜检测 | 第54-55页 |
| ·突变体致病性和致敏性测定 | 第55页 |
| ·Xoo总RNA提取 | 第55-56页 |
| ·Xoo总RNA反转录 | 第56页 |
| ·ΔrpfFxoo、ΔrpfCxoo、ΔrpfGxoo中部分基因的表达分析 | 第56-58页 |
| ·结果与分析 | 第58-79页 |
| ·rpf基因簇部分结构同源性分析 | 第58-59页 |
| ·目的基因克隆 | 第59页 |
| ·rpfFxoo、rpfCxoo和rpfGxoo基因的生物信息学分析 | 第59-65页 |
| ·构建ΔrpfFxoo、ΔrpfCxoo、ΔrpfGxoo突变体菌株 | 第65-67页 |
| ·ΔrpfFxoo、ΔrpfCxoo、ΔrpfGxoo互补分析 | 第67-68页 |
| ·ΔrpfFCxoo和ΔrpfFGxoo双基因突变体构建 | 第68-69页 |
| ·突变体生长曲线测定 | 第69-70页 |
| ·突变体运动性分析 | 第70页 |
| ·突变体胞外酶活性分析 | 第70页 |
| ·突变体胞外多糖测定和菌落形态观察 | 第70-71页 |
| ·突变体DSF信号的测定 | 第71-72页 |
| ·突变体生物被膜的测定 | 第72-73页 |
| ·突变体致病性和致敏性鉴定 | 第73-77页 |
| ·ΔrpfFxoo、ΔrpfCxoo、ΔrpfGxoo中部分基因的表达分析 | 第77-79页 |
| ·讨论 | 第79-84页 |
| 第四章 与c-di-GMP代谢相关的rsvRxoo和rsmRxoo基因的功能分析 | 第84-118页 |
| ·实验材料 | 第85页 |
| ·菌株和质粒 | 第85页 |
| ·生化试剂 | 第85页 |
| ·培养基和菌株培养条件 | 第85页 |
| ·实验方法 | 第85-88页 |
| ·基因序列的生物信息学分析 | 第85页 |
| ·rsvRxoo和rsmRxoo基因突变体构建 | 第85-86页 |
| ·ΔrsvRxoo和ΔrsmRxoo互补菌株的构建 | 第86页 |
| ·生长曲线测定 | 第86页 |
| ·鞭毛运动性检测 | 第86页 |
| ·突变体胞外酶活性的检测 | 第86-87页 |
| ·胞外多糖分泌检测和形态观察 | 第87页 |
| ·DSF信号检测 | 第87页 |
| ·生物被膜的定性检测 | 第87页 |
| ·突变体致病性测试和过敏性反应(HR)分析 | 第87页 |
| ·real-time PCR定量分析部分基因表达变化 | 第87页 |
| ·rsvRxoo结构域缺失互补分析 | 第87-88页 |
| ·不同基因对突变体的互补作用 | 第88页 |
| ·结果与分析 | 第88-113页 |
| ·PX099~A基因组中与c-di-GMP代谢相关基因的结构域分析 | 第88-93页 |
| ·rsvRxoo和rsmRxoo生物信息学分析 | 第93-99页 |
| ·构建ΔrsvRxoo和ΔrsmRxoo突变体菌株 | 第99-100页 |
| ·ΔrsvRxoo和ΔrsmRxoo的互补分析 | 第100-101页 |
| ·ΔrsvRxoo和ΔrsmRxoo生长曲线测定 | 第101页 |
| ·ΔrsvRxoo和ΔrsmRxoo运动性分析 | 第101-102页 |
| ·ΔrsvRxoo和ΔrsmRxoo胞外酶活性分析 | 第102页 |
| ·ΔrsvRxoo和ΔrsmRxoo突变体胞外多糖的测定 | 第102-103页 |
| ·ΔrsvRxoo和ΔrsmRxoo致病性和HR诱导能力测试 | 第103-107页 |
| ·ΔrsvRxoo和ΔrsmRxoo DSF的测定 | 第107页 |
| ·ΔrsvRxoo和ΔrsmRxoo生物被膜的测定 | 第107-108页 |
| ·rsvRxoo结构域缺失互补质粒构建 | 第108页 |
| ·rsvRxoo结构域缺失互补菌株胞外多糖分泌和形态观察 | 第108-109页 |
| ·rsvRxoo结构域缺失互补菌株DSF信号检测 | 第109页 |
| ·ΔrsvRxoo中部分基因表达分析 | 第109-110页 |
| ·不同基因间的反式互补作用 | 第110-111页 |
| ·RsvRxoo可能与RsvSxoo组成双组分系统 | 第111-113页 |
| ·讨论 | 第113-118页 |
| 第五章 全文结论 | 第118-119页 |
| 参考文献 | 第119-137页 |
| 致谢 | 第137-138页 |
| 作者简历 | 第138页 |
