| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-15页 |
| 第一章 绪论 | 第15-37页 |
| ·奇异变形杆菌的特性与检测 | 第15-18页 |
| ·P. mirabilis 的特性 | 第15-16页 |
| ·P. mirabilis 的检测 | 第16-18页 |
| ·脉冲场凝胶电泳(PULSED-FIELD GEL ELECTROPHORESIS, PFGE) | 第18-22页 |
| ·分型技术的研究进展 | 第18-19页 |
| ·PFGE 方法原理 | 第19-20页 |
| ·PFGE 结果的解释 | 第20页 |
| ·PFGE 在分子生物学中的应用 | 第20-21页 |
| ·PFGE 方法的局限和不足 | 第21页 |
| ·PulseNet | 第21-22页 |
| ·细菌药物敏感性试验 | 第22-23页 |
| ·药敏试验方法 | 第22-23页 |
| ·药敏实验的选药原则 | 第23页 |
| ·细菌耐药的分子机制 | 第23-26页 |
| ·细菌耐药的生物化学机制 | 第23-25页 |
| ·细菌耐药的遗传学机制 | 第25-26页 |
| ·细菌编码抗性的可移动遗传元件 | 第26-30页 |
| ·质粒 | 第26页 |
| ·转座子 | 第26-27页 |
| ·整合子系统 | 第27-30页 |
| ·基因组岛 | 第30页 |
| ·沙门氏一类基因组岛(SALMONELLA GENOMIC ISLAND 1, SGI1) | 第30-33页 |
| ·SGI1 的结构 | 第30-32页 |
| ·SGI1 的变异体与耐药性 | 第32页 |
| ·SGI1 的移动性 | 第32-33页 |
| ·细菌耐药性由动物向人类的传播 | 第33-35页 |
| ·动物源性耐药菌对食品和环境的污染 | 第33-34页 |
| ·动物源性细菌耐药性向人类的传播 | 第34-35页 |
| ·本课题的研究意义及主要内容 | 第35-37页 |
| 第二章 奇异变形杆菌的分离鉴定 | 第37-55页 |
| ·引言 | 第37页 |
| ·实验材料 | 第37-41页 |
| ·主要仪器设备 | 第37-38页 |
| ·培养基与试剂 | 第38-39页 |
| ·培养基和常用溶液配制 | 第39-41页 |
| ·实验菌株 | 第41页 |
| ·样品来源 | 第41页 |
| ·实验流程 | 第41页 |
| ·实验方法 | 第41-49页 |
| ·样品处理 | 第41页 |
| ·增菌培养 | 第41页 |
| ·分离平板 | 第41-42页 |
| ·PCR 检测变形杆菌 | 第42-45页 |
| ·生化鉴定 | 第45-49页 |
| ·菌株保存 | 第49页 |
| ·实验结果 | 第49-51页 |
| ·PCR 引物 | 第49-50页 |
| ·食品中可疑菌株的PCR 检测 | 第50页 |
| ·P. mirabilis 临床分离株的PCR 鉴定 | 第50页 |
| ·食品中可疑菌株的生化试验 | 第50页 |
| ·P. mirabilis 临床分离株的生化鉴定 | 第50-51页 |
| ·本章小结 | 第51-55页 |
| 第三章 奇异变形杆菌的耐药表型分析 | 第55-74页 |
| ·引言 | 第55页 |
| ·实验材料 | 第55-57页 |
| ·主要仪器设备 | 第55-56页 |
| ·培养基与试剂 | 第56页 |
| ·实验菌株 | 第56页 |
| ·培养基和常用溶液配制 | 第56-57页 |
| ·实验流程 | 第57-58页 |
| ·实验方法 | 第58-62页 |
| ·麦氏比浊管的制备 | 第58页 |
| ·接种菌液的准备 | 第58-59页 |
| ·药敏试验 | 第59页 |
| ·结果判读 | 第59-60页 |
| ·影响结果的因素 | 第60-62页 |
| ·抗菌药物敏感试验的质量控制 | 第62页 |
| ·实验结果与讨论 | 第62-72页 |
| ·抗生素的选用 | 第62-64页 |
| ·质控菌株的药敏实验 | 第64页 |
| ·药敏实验结果 | 第64页 |
| ·耐多药结果分析 | 第64-69页 |
| ·P. mirabilis 分离株耐药模式分析 | 第69-72页 |
| ·本章小结 | 第72-74页 |
| 第四章 奇异变形杆菌整合子系统基因检测及序列分析 | 第74-100页 |
| ·引言 | 第74页 |
| ·实验材料 | 第74-79页 |
| ·主要仪器设备 | 第74-75页 |
| ·培养基与试剂 | 第75-76页 |
| ·实验菌株 | 第76页 |
| ·培养基和常用溶液配制 | 第76-79页 |
| ·实验流程 | 第79页 |
| ·实验方法 | 第79-90页 |
| ·DNA 模板的制备(CTAB 法) | 第79-81页 |
| ·Ⅰ类整合酶基因intI1 的扩增 | 第81-83页 |
| ·Ⅰ类整合酶基因intI1 扩增产物的电泳鉴定 | 第83页 |
| ·Ⅰ类整合子携带耐药基因盒的扩增 | 第83-84页 |
| ·Ⅰ类整合子携带耐药基因盒扩增产物的凝胶电泳 | 第84页 |
| ·Ⅰ类整合子携带耐药基因盒扩增产物序列分析 | 第84-87页 |
| ·PCR 产物的纯化 | 第84-85页 |
| ·TA 克隆 | 第85页 |
| ·大肠埃希氏菌DH5α感受态细胞的制备 | 第85-86页 |
| ·大肠杆菌的转化实验 | 第86页 |
| ·DNA 测序及序列解析 | 第86-87页 |
| ·Ⅱ类整合酶基因intI2 的扩增 | 第87页 |
| ·Ⅱ类整合酶基因intI2 扩增产物的电泳鉴定 | 第87-88页 |
| ·Ⅱ类整合子携带耐药基因盒的扩增 | 第88-89页 |
| ·Ⅱ类整合子携带耐药基因盒扩增产物的凝胶电泳 | 第89页 |
| ·Ⅱ类整合子携带耐药基因盒扩增产物序列分析 | 第89页 |
| ·Ⅲ类整合酶基因intI3 的扩增 | 第89-90页 |
| ·Ⅲ类整合酶基因intI3 扩增产物的电泳鉴定 | 第90页 |
| ·实验结果与讨论 | 第90-98页 |
| ·整合子的结构和分类 | 第90-91页 |
| ·Ⅰ类整合酶基因intI1 的扩增 | 第91-93页 |
| ·Ⅰ类整合子携带耐药基因盒扩增 | 第93页 |
| ·Ⅰ类整合子携带耐药基因盒序列解析 | 第93-96页 |
| ·Ⅱ类整合酶基因intI2 的扩增 | 第96-97页 |
| ·Ⅱ类整合子携带耐药基因盒扩增及序列解析 | 第97-98页 |
| ·Ⅲ类整合酶基因intI3 的扩增 | 第98页 |
| ·本章小结 | 第98-100页 |
| 第五章 奇异变形杆菌的基因指纹图谱分析 | 第100-119页 |
| ·引言 | 第100-101页 |
| ·实验材料 | 第101-105页 |
| ·主要仪器设备 | 第101-102页 |
| ·培养基与试剂 | 第102页 |
| ·培养基和常用溶液配制 | 第102-104页 |
| ·菌株 | 第104-105页 |
| ·实验流程 | 第105页 |
| ·实验方法 | 第105-109页 |
| ·胶块的制备 | 第106-107页 |
| ·细胞的裂解 | 第107页 |
| ·洗胶块 | 第107页 |
| ·胶块内DNA 的酶切 | 第107-108页 |
| ·制备大胶、上样 | 第108页 |
| ·电泳 | 第108-109页 |
| ·染色、凝胶成像 | 第109页 |
| ·结果分析 | 第109页 |
| ·实验结果与讨论 | 第109-116页 |
| ·P. mirabilis 分离株的同源性分析 | 第109-110页 |
| ·Ⅰ类整合子阳性P. mirabilis 分离株的PFGE 分析 | 第110页 |
| ·Ⅱ类整合子阳性P. mirabilis 分离株的PFGE 分析 | 第110-113页 |
| ·携带aadA2 和blaP1 基因盒的P. mirabilis 分离株同源性分析 | 第113-114页 |
| ·携带dfrA5 基因盒的P. mirabilis 分离株同源性分析 | 第114-116页 |
| ·携带dfrA17 和aadA5 基因盒的P. mirabilis 分离株同源性分析 | 第116页 |
| ·本章小结 | 第116-119页 |
| 第六章 奇异变形杆菌耐药基因岛SGI1 分析 | 第119-165页 |
| ·引言 | 第119页 |
| ·实验材料 | 第119-124页 |
| ·主要仪器设备 | 第119-120页 |
| ·培养基与试剂 | 第120-121页 |
| ·实验菌株 | 第121页 |
| ·培养基和常用溶液配制 | 第121-124页 |
| ·实验流程 | 第124页 |
| ·实验方法 | 第124-141页 |
| ·DNA 模板的制备(CTAB 法) | 第124-126页 |
| ·P. mirabilis 菌株染色体中SGI1 的检测 | 第126-129页 |
| ·P. mirabilis 菌株SGI1 的MDR 区结构序列分析 | 第129-132页 |
| ·P. mirabilis 菌株SGI1-B 的MDR 区结构序列分析 | 第132-134页 |
| ·P. mirabilis 菌株SGI1-O 的MDR 区结构序列分析 | 第134-136页 |
| ·P. mirabilis 菌株SGI1-U 的MDR 区结构序列分析 | 第136-137页 |
| ·P. mirabilis 菌株SGI1-U 右侧结构解析 | 第137-139页 |
| ·SGI1 阴性、Ⅰ类整合子阳性P. mirabilis 的MDR 结构序列分析 | 第139-141页 |
| ·结果与讨论 | 第141-163页 |
| ·P. mirabilis 菌株SGI1 检测 | 第141-143页 |
| ·P. mirabilis 菌株SGI1 类型的初步分析 | 第143页 |
| ·P. mirabilis 菌株SGI1 的MDR 区结构序列分析 | 第143-150页 |
| ·P. mirabilis 菌株中SGI1-B 的MDR 结构序列分析 | 第150-154页 |
| ·P. mirabilis 菌株SGI1-O 的MDR 结构序列分析 | 第154-156页 |
| ·P. mirabilis 菌株SGI1-U 的MDR 结构序列分析 | 第156-159页 |
| ·P. mirabilis 菌株SGI1-U 右侧结构解析 | 第159-161页 |
| ·携带SGI1-U 的P. mirabilis 菌株hipB 和hipA 基因缺失分析 | 第161页 |
| ·SGI1 阴性、Ⅰ类整合子阳性P. mirabilis 的MDR 结构序列分析 | 第161-163页 |
| ·GenBank 序列号 | 第163页 |
| ·本章小结 | 第163-165页 |
| 结论与展望 | 第165-168页 |
| 参考文献 | 第168-184页 |
| 附录 | 第184-201页 |
| 攻读博士学位期间取得的研究成果 | 第201-203页 |
| 致谢 | 第203页 |
