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新城疫病毒V4株全基因组测序及全长cDNA克隆的构建

中文摘要第1-12页
英文摘要第12-14页
1. 引言第14-33页
   ·反向操作概况第14-22页
     ·反向遗传技术原理第14页
     ·反向遗传技术研究进展第14-20页
       ·正链RNA 病毒研究进展第14-15页
       ·负链RNA 病毒研究进展第15-20页
     ·反向遗传常见表达系统第20-22页
       ·RNA聚合酶II(RNA pol II)表达系统第20-21页
       ·RNA 聚合酶I(RNA pol I)表达系统第21页
       ·T7聚合酶系统第21-22页
   ·新城疫概况第22-30页
     ·新城疫病毒分子生物学第22-24页
       ·基因组特点第23页
       ·结构蛋白第23-24页
       ·新城疫病毒复制过程第24页
     ·新城疫反向遗传技术进展第24-29页
       ·NDV感染性分子克隆的构建第25-26页
       ·应用反遗传操作技术对NDV结构和功能研究的进展第26-27页
       ·应用反遗传操作技术构建重组NDV疫苗载体第27-29页
     ·新城疫V4 疫苗株概况第29-30页
   ·传染性法氏囊病毒VP2 研究进展第30-31页
   ·本课题拟解决的问题第31-33页
2. 材料与方法第33-49页
   ·病毒纯化第33-35页
     ·病毒活化第33页
     ·蚀斑纯化第33-34页
       ·鸡胚成纤维细胞培养第33页
       ·接种病毒第33页
       ·覆盖琼脂第33页
       ·蚀斑克隆化第33-34页
     ·耐热实验及冻融实验第34页
     ·PCR 测序第34-35页
       ·引物设计第34页
       ·RNA 的提取第34页
       ·RT-PCR 反应第34页
       ·PCR 产物纯化第34-35页
     ·鸡胚半数感染量(EID_(50))的测定及MDT 测定第35页
       ·EID50的测定第35页
       ·鸡胚平均致死时间(MDT)测定第35页
   ·V4 株全长基因组测序及序列分析第35-38页
     ·菌种与质粒第35页
     ·主要工具酶及试剂第35页
     ·主要仪器第35页
     ·方法第35-38页
       ·病毒的增殖第35-36页
       ·病毒RNA 的提取第36页
       ·反转录反应第36页
       ·引物设计及PCR 反应第36-38页
   ·全长基因组cDNA 克隆的构建第38-40页
   ·全长cDNA克隆序列修改第40-43页
     ·基因组6912nt 处缺失碱基的回复突变第40-42页
     ·pF3T1 与pV4A 质粒的连接第42页
     ·pF3T1+与原全长cDNA 质粒pBRT7-V4 的替换第42页
     ·11764nt 处缺失碱基的回复突变第42-43页
     ·合成序列与pBRT7-V4~Ф的替换连接第43页
     ·II 型启动子全长cDNA 克隆的构建第43页
   ·全长cDNA 中PmeI 酶切位点的引入及IBDV VP2 基因插入第43-44页
   ·微型基因组的构建第44-48页
     ·PCR 扩增及质粒构建第44-46页
       ·Leader 区的扩增第44页
       ·Trailer 区的扩增第44-45页
       ·Leader 区和Trailer 区的连接第45页
       ·融合PCR 产物与低拷贝载体pBR322 的连接第45页
       ·EGFP 扩增及微型基因组构建第45-46页
     ·微基因组表达验证实验及转染效率比较第46页
     ·辅助病毒包装实验第46页
     ·BSR 细胞功能鉴定第46-48页
   ·病毒的拯救第48-49页
3 结果第49-91页
   ·病毒纯化第49-53页
     ·蚀斑纯化实验第49页
     ·耐热实验及抗冻融实验第49-52页
     ·针对F 基因编码区47-435bp 的特异扩增第52-53页
     ·鸡胚半数感染量(EID_(50))及平均致死时间(MDT)的测定第53页
   ·V4 株全长基因组序列测定及序列分析第53-60页
     ·PCR 结果及重组质粒鉴定结果第53-54页
     ·序列比较分析第54-58页
       ·NP 基因序列分析第55-56页
       ·P 基因序列分析第56-57页
       ·M 基因序列分析第57-58页
       ·F 基因序列分析第58页
       ·HN 基因序列分析第58页
       ·L 基因序列分析第58页
     ·耐热性相关基因分析第58-60页
   ·全长cDNA克隆的构建第60-76页
     ·各片段cDNA 合成PCR 结果第60-61页
     ·中间部分cDNA 片段的连接第61-72页
       ·pF456 质粒的构建第61-65页
       ·pF23 质粒的构建第65-66页
       ·pF26 质粒的构建第66-69页
       ·pF789 质粒的构建第69-71页
       ·pF29 质粒的构建第71-72页
     ·两末端cDNA 片段的连接第72-74页
       ·pF1 质粒的构建第72页
       ·pF10 质粒的构建第72-73页
       ·pT7-F110 和pPolII-F110第73-74页
     ·全长cDNA 质粒pBRT7-V4 和pBRPolII-V4 的构建第74-76页
   ·全长cDNA 克隆序列修正第76-81页
     ·基因组6912nt 处缺失碱基的回复突变第76页
     ·pF3T1 与V4A 质粒的连接第76-77页
     ·质粒pF3T1+与pBRT7-V4 的替换第77页
     ·11764nt 处缺失碱基的回复突变第77页
     ·合成序列与pBRT7-V4~Ф的替换连接第77-81页
     ·II 型启动子全长cDNA 克隆的构建第81页
   ·全长cDNA 中PmeI 酶切位点的引入及IBDV VP2 基因插入第81-84页
   ·微型基因组的构建第84-90页
     ·Leader、Trailer 区的扩增及连接第84-85页
     ·EGFP 扩增及微型基因组构建第85页
     ·融合PCR 产物与低拷贝载体pBR322 的连接第85-87页
     ·微基因组表达验证实验及转染效率比较第87-88页
     ·微基因组包装实验第88-90页
     ·BSR 细胞功能鉴定第90页
   ·病毒的拯救第90-91页
4 讨论第91-95页
   ·病毒的纯化第91页
   ·全长cDNA 克隆的获得第91-92页
   ·NDV 做为疫苗载体的可行性第92-94页
   ·微基因组表达成功及病毒拯救失败带来的启示第94页
   ·II 型启动子在NDV 拯救中的应用第94-95页
5 结论第95-96页
致谢第96-97页
参考文献第97-104页
附表第104-112页
攻读学位期间发表的学术论文第112页

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