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桉树EST-SNP的开发及EST图谱构建

致谢第1-4页
摘要第4-5页
Abstract第5-9页
前言第9-10页
文献综述第10-26页
 1 遗传连锁图谱构建第10-18页
   ·常用分子标记技术介绍第10-15页
     ·RFLP(Restrietion fragment length polymorphism)第11页
     ·RAPD(Random amplined polymorphic DNA)第11-12页
     ·AFLP(Amplified fragment length polymorphism)第12页
     ·SSR(Simple sequenece repeats)第12-13页
     ·EST(Expressed sequence tag)第13-14页
       ·CAPS(Cleaved amplified polymorphic sequences)第14页
     ·SNPs(Single nucleotide polymorphisms)第14-15页
   ·分子标记在林木遗传图谱中的应用第15-18页
     ·数量性状基因位点(QTL)定位和分析第15-16页
     ·分子标记辅助选择育种第16-17页
     ·目的基因定位与分离第17页
     ·比较基因组研究第17-18页
   ·作图群体第18页
 2 林木遗传图谱的研究及其现状第18-21页
   ·林木遗传图谱构建进展第18-20页
   ·SNP在林木上研究进展第20页
   ·林木EST序列的开发第20-21页
 3 桉树遗传图谱研究第21-25页
   ·桉树生物学特性及其价值第21-23页
     ·桉树生物学特性第21页
     ·桉树的利用第21-23页
   ·桉树遗传图谱应用及发展趋势第23页
   ·分子标记在桉树遗传学研究中的应用第23-25页
 4 本课题研究的内容第25-26页
   ·研究内容第25页
   ·研究技术路线第25-26页
第一章 桉树EST-SNP的开发第26-39页
 1 材料与方法第26-29页
   ·实验材料第26页
   ·实验方法第26-29页
     ·DNA提取第26-27页
     ·EST引物设计及引物筛选第27页
     ·PCR反应体系及程序第27页
     ·EST-PCR产物纯化第27-29页
     ·SNP分析第29页
 2 结果与分析第29-36页
   ·EST-PCR产物测序反应体系优化第29-32页
     ·不同纯化方法的比较第29-30页
     ·测序结果的比较第30-32页
   ·引物的筛选第32页
   ·SNP的发现及发生频率第32-33页
   ·序列比对第33-34页
   ·SNP位点多样性第34-35页
   ·SNP变异类型第35-36页
 3 结论与讨论第36-39页
   ·EST引物通用性第36页
   ·测序体系优化第36-37页
   ·SNP多样性第37页
   ·SNP发生频率第37-38页
   ·SNP突变类型第38-39页
第二章 EST-CAPS标记开发及构建桉树EST遗传谱图第39-55页
 1 材料与方法第39-40页
   ·实验材料第39页
   ·实验方法第39-40页
     ·PCR反应与引物筛选第39页
     ·CAPS标记筛选第39页
     ·群体检测第39-40页
     ·数据收集第40页
     ·桉树EST遗传图谱的构建第40页
     ·CAPS确证SNP位点第40页
 2 结果与分析第40-52页
   ·酶切位点多态性的筛选第40-41页
   ·作图群体的CAPS实验结果第41-46页
   ·EST-CAPS标记在F1群体中的分离第46页
   ·标记的偏分离分析第46页
   ·桉树EST框架遗传图谱的构建第46-47页
   ·CAPS用于SNP标记的确证和图谱的构建第47-52页
 3 结论与讨论第52-55页
   ·EST-CAPS标记技术第52页
   ·偏分离现象第52-53页
   ·桉树EST框架连锁图谱的构建第53页
   ·SNP标记应用于桉树图谱的构建第53-55页
参考文献第55-64页
附表第64-66页
详细摘要第66-69页

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