从松树EST序列开发马尾松SSR引物
| 致谢 | 第1-4页 |
| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 前言 | 第8-9页 |
| 1. 文献综述 | 第9-17页 |
| ·表达序列标签（EST）简介 | 第9-10页 |
| ·EST 的含义 | 第9页 |
| ·EST 技术简介 | 第9-10页 |
| ·EST 技术在植物中的应用 | 第10页 |
| ·微卫星（SSR）简介 | 第10-12页 |
| ·SSR 的含义和特点 | 第10-11页 |
| ·SSR 引物开发 | 第11-12页 |
| ·开发 SSR 引物的传统方法 | 第11页 |
| ·EST-SSR 方法简介 | 第11-12页 |
| ·引物设计简介 | 第12-15页 |
| ·引物在 PCR 中的作用 | 第12-13页 |
| ·引物设计原则 | 第13-15页 |
| ·引物的检验方法 | 第15页 |
| ·EST-SSR 引物开发进展 | 第15-16页 |
| ·马尾松 SSR 引物开发方法 | 第16-17页 |
| 2. EST 序列的SSR 信息分析 | 第17-26页 |
| ·搜索 EST 序列 | 第17-18页 |
| ·优化处理 | 第18-19页 |
| ·EST-trimmer 处理 | 第18页 |
| ·Cross-match 处理 | 第18页 |
| ·聚类拼接 | 第18-19页 |
| ·搜索 SSR 位点 | 第19-21页 |
| ·实验结果 | 第21-26页 |
| ·未聚类进行MISA 筛选的结果 | 第21-24页 |
| ·聚类后进行MISA 筛选的结果 | 第24-26页 |
| 3. 引物开发 | 第26-39页 |
| ·EST 序列的选取 | 第26-27页 |
| ·引物设计 | 第27-29页 |
| ·引物合成 | 第29页 |
| ·引物性能检测 | 第29-39页 |
| ·材料 | 第29页 |
| ·试剂 | 第29页 |
| ·DNA 提取 | 第29-30页 |
| ·DNA 纯化 | 第30页 |
| ·PCR 扩增 | 第30-31页 |
| ·聚丙烯酰胺凝胶电泳检测 | 第31-39页 |
| 4. 引物序列酶切位点分析 | 第39-40页 |
| 5. 讨论 | 第40-50页 |
| ·SSR 信息分析 | 第40-46页 |
| ·聚类的意义 | 第40-43页 |
| ·EST-SSR 的碱基偏倚性 | 第43页 |
| ·SSR 特征和参数设置的影响 | 第43-45页 |
| ·关于预处理步骤的补充 | 第45页 |
| ·软、硬件配置对优化操作的影响 | 第45-46页 |
| ·SSR 引物开发 | 第46-50页 |
| ·样品处理 | 第46-47页 |
| ·样品选择与保存 | 第46页 |
| ·DNA 提纯 | 第46-47页 |
| ·Touchdown PCR | 第47页 |
| ·EST-SSR 的可用性 | 第47-48页 |
| ·不同 SSR 类型的影响 | 第48页 |
| ·EST-SSR 引物的通用性 | 第48-50页 |
| 6. 结论与展望 | 第50-53页 |
| ·主要结论 | 第50-51页 |
| ·展望 | 第51-53页 |
| ·SAM 法简介 | 第51-52页 |
| ·构建 SSR 引物开发体系 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-58页 |
| 详细摘要 | 第58-61页 |
