| 摘要 | 第6-7页 |
| abstract | 第7-8页 |
| Abbreviations | 第15-16页 |
| Chapter 1 Introduction | 第16-36页 |
| 1.1 Infectious bursal disease(IBD) | 第16-17页 |
| 1.1.1 Overview of IBD | 第16页 |
| 1.1.2 Epidemiology of IBD | 第16-17页 |
| 1.2 Infectious bursal disease virus(IBDV) | 第17-22页 |
| 1.2.1 Classification and morphological structure | 第17页 |
| 1.2.2 Genomic structure | 第17-18页 |
| 1.2.3 Evolution of IBDV | 第18-19页 |
| 1.2.4 Coding Proteins | 第19-22页 |
| 1.2.4.1 VP1 | 第19-20页 |
| 1.2.4.2 VP2 | 第20-21页 |
| 1.2.4.3 VP3 | 第21页 |
| 1.2.4.4 VP4 | 第21-22页 |
| 1.2.4.5 VP5 | 第22页 |
| 1.3 Reassortment of IBDV | 第22-25页 |
| 1.3.1 vv-A/ Att-B | 第22-23页 |
| 1.3.2 Att-A/ vv-B | 第23-24页 |
| 1.3.3 vv-A/ c-B | 第24页 |
| 1.3.4 vv-A/ var-B | 第24页 |
| 1.3.5 vv-A/ II-B: | 第24页 |
| 1.3.6 vv-A/ Uniq-B | 第24-25页 |
| 1.4 Diagnosis of IBD | 第25-27页 |
| 1.4.1 Clinical diagnosis | 第25页 |
| 1.4.2 Laboratory diagnosis | 第25-27页 |
| 1.4.2.1 RT-PCR | 第25-26页 |
| 1.4.2.2 qRT-PCR | 第26页 |
| 1.4.2.3 LAMP | 第26页 |
| 1.4.2.4 RFLP | 第26页 |
| 1.4.2.5 AGPT | 第26-27页 |
| 1.4.2.6 ELISA | 第27页 |
| 1.4.2.7 Histopathology assay | 第27页 |
| 1.5 Vaccine of IBD | 第27-30页 |
| 1.5.1 Inactivated vaccines: | 第27-28页 |
| 1.5.2 Attenuated live vaccines | 第28页 |
| 1.5.3 Immune complex vaccines | 第28页 |
| 1.5.4 Live vector vaccines | 第28-29页 |
| 1.5.5 DNA vaccine | 第29页 |
| 1.5.6 Subunit vaccine | 第29-30页 |
| 1.6 Poultry industry and avain disease in Pakistan | 第30-32页 |
| 1.6.1 Poultry industry in Pakistan | 第30-31页 |
| 1.6.2 Avian disease threat in Pakistan | 第31-32页 |
| 1.6.3 National policy for healthy breeding | 第32页 |
| 1.7 IBD in Pakistan | 第32-35页 |
| 1.7.1 Threat of IBD in Pakistan | 第32-33页 |
| 1.7.2 Epidemiology of IBD in Pakistan | 第33-34页 |
| 1.7.3 Control of IBD in Pakistan | 第34-35页 |
| 1.7.4 Problems in IBD control in Pakistan | 第35页 |
| 1.8 Research purpose and significance | 第35-36页 |
| Chapter 2 Detection and genetic evolution analysis of IBDV in Pakistan | 第36-52页 |
| 2.1 Materials and methods | 第36-40页 |
| 2.1.1 Key reagents and instruments | 第36页 |
| 2.1.2 Primers | 第36页 |
| 2.1.3 Clinical samples | 第36-37页 |
| 2.1.4 RT-PCR detection | 第37-38页 |
| 2.1.5 Amplification and sequencing of VP | 第38页 |
| 2.1.6 Amplification and sequencing of VP | 第38页 |
| 2.1.7 Sequencing | 第38页 |
| 2.1.8 Sequence analyses | 第38-40页 |
| 2.2 Results | 第40-49页 |
| 2.2.1 IBDV detection | 第40-42页 |
| 2.2.2 Molecular characterization of VP2 of Pakistan strains | 第42页 |
| 2.2.3 Molecular characterization of VP1 of Pakistan isolates | 第42页 |
| 2.2.4 Phylogeny analysis | 第42-49页 |
| 2.3 Discussion | 第49-52页 |
| 2.3.1 IBD infections are widespread in Pakistan | 第49页 |
| 2.3.2 The reassortant IBDVs(vv-A/Uniq-B)with regional characters are the predominant strains in Pakistan | 第49-52页 |
| Chapter 3 Virus isolation and biological character identification of Pakistan IBDVs | 第52-71页 |
| 3.1 Materials and methods | 第52-56页 |
| 3.1.1 Key reagents and instruments | 第52页 |
| 3.1.2 Primers | 第52-53页 |
| 3.1.3 SPF embryonated eggs and chickens | 第53页 |
| 3.1.4 Virus isolation | 第53页 |
| 3.1.5 Virus purity detection | 第53页 |
| 3.1.6 Virus titration | 第53页 |
| 3.1.7 Viral genome clone | 第53-54页 |
| 3.1.7.1 Segment A clone | 第54页 |
| 3.1.7.2 Segment B clone | 第54页 |
| 3.1.8 Genome sequence analysis | 第54-55页 |
| 3.1.9 Animal experiments | 第55-56页 |
| 3.1.10 Statistical analysis | 第56页 |
| 3.2 Results | 第56-69页 |
| 3.2.1 Virus isolation and identification | 第56-57页 |
| 3.2.2 Clone and determination of the complete genome | 第57页 |
| 3.2.3 Virus genome sequence analysis | 第57-66页 |
| 3.2.3.1 Molecular characterization of segment A of Pakistan IBDVs | 第57-58页 |
| 3.2.3.2 Molecular characterization of segment B of Pakistan IBDVs | 第58页 |
| 3.2.3.3 Phylogeny analysis | 第58-66页 |
| 3.2.4 Pathogenicity of Pakistan IBDVs | 第66-69页 |
| 3.2.4.1 Pathogenicity of PK2 strain | 第66-69页 |
| 3.2.4.2 Pathogenicity of other Pakistan IBDVs | 第69页 |
| 3.3 Discussion | 第69-71页 |
| 3.3.1 The full-length genome analysis further confirmed the unique reassortant characteristics of Pakistan IBDVs | 第69页 |
| 3.3.2 Pakistan reassortant IBDVs showed high pathogenicity | 第69-71页 |
| Chapter 4 Evaluation of vaccines against Pakistan IBDVs | 第71-78页 |
| 4.1 Materials and methods | 第71-72页 |
| 4.1.1 Key reagents and instruments | 第71页 |
| 4.1.2 SPF chickens | 第71页 |
| 4.1.3 IBD vaccines | 第71页 |
| 4.1.4 Challenge protection experiment | 第71-72页 |
| 4.1.5 Statistical analysis | 第72页 |
| 4.2 Results | 第72-74页 |
| 4.2.1 Clinical observation | 第72-73页 |
| 4.2.2 Postmortem | 第73页 |
| 4.2.3 Body weight | 第73-74页 |
| 4.3 Discussion | 第74-78页 |
| 4.3.1 Vaccines available can provide clinical protection against Pakistan IBDVs | 第74-75页 |
| 4.3.2 Various factors might be involved in avian disease in immunized chicken flocks | 第75-78页 |
| Chapter 5 Conclusion | 第78-79页 |
| References | 第79-93页 |
| Attachment | 第93-97页 |
| Acknowledgement | 第97-98页 |
| Author Biography | 第98-99页 |
