基于单体型覆盖的标签SNP选择方法研究
| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第12-18页 |
| 1.1 研究背景 | 第12-13页 |
| 1.2 标签SNP与复杂疾病 | 第13-14页 |
| 1.3 国内外研究现状 | 第14-16页 |
| 1.4 本文的技术路线及研究内容 | 第16-17页 |
| 1.5 本文结构安排 | 第17-18页 |
| 第2章 标签SNP选择的主要研究方法 | 第18-35页 |
| 2.1 单体型研究计划(HAPMAP) | 第18-19页 |
| 2.2 SNP特点及应用 | 第19-20页 |
| 2.3 连锁不平衡的概念 | 第20-22页 |
| 2.4 基于单体型识别的方法 | 第22-27页 |
| 2.4.1 智能方法 | 第22-25页 |
| 2.4.2 聚类方法 | 第25-26页 |
| 2.4.3 动态规划算法 | 第26-27页 |
| 2.5 基于单体型重构的方法 | 第27-34页 |
| 2.5.1 信息SNP子集构造 | 第28页 |
| 2.5.2 单体型重构方法 | 第28-34页 |
| 2.6 小结 | 第34-35页 |
| 第3章 基于单体型识别的标签SNP选择方法 | 第35-43页 |
| 3.1 SNP数据预处理 | 第35-37页 |
| 3.1.1 缺失数据估计 | 第36-37页 |
| 3.1.2 完全连锁SNP位点剔除 | 第37页 |
| 3.2 单体型识别及关联研究 | 第37-39页 |
| 3.3 基于蚁群算法的标签SNP子集构造 | 第39-41页 |
| 3.3.1 蚁群算法基本原理 | 第39-40页 |
| 3.3.2 路径选择及信息素更新机制 | 第40-41页 |
| 3.3.3 启发式函数 | 第41页 |
| 3.4 本文方法流程图 | 第41-42页 |
| 3.5 小结 | 第42-43页 |
| 第4章 仿真实验及结果分析 | 第43-50页 |
| 4.1 模块设计 | 第43页 |
| 4.2 实验数据 | 第43-44页 |
| 4.3 实验结果及评价 | 第44-49页 |
| 4.3.1 标签SNP数目比较 | 第44-47页 |
| 4.3.2 SNP子集紧凑度 | 第47-48页 |
| 4.3.3 运算时间 | 第48-49页 |
| 4.4 小结 | 第49-50页 |
| 结论 | 第50-52页 |
| 参考文献 | 第52-57页 |
| 致谢 | 第57-58页 |
| 附录A 攻读学位期间参与的项目 | 第58页 |
