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多种蜘蛛体内细菌多样性研究

摘要第5-8页
Abstract第8-10页
第1章 绪论第17-25页
    1 节肢动物体内细菌类群的研究现状第17-21页
        1.1 昆虫纲宿主体内细菌类群的研究现状第17-20页
            1.1.1 内共生菌在昆虫纲宿主体内的分布第17-18页
            1.1.2 内共生菌对昆虫纲宿主的影响第18-20页
                1.1.2.1 沃尔巴克氏体属对昆虫纲宿主的影响第18-19页
                1.1.2.2 立克次氏体属对昆虫纲宿主的影响第19页
                1.1.2.3 Cardinium对昆虫纲宿主的影响第19页
                1.1.2.4 螺原体属对昆虫纲宿主的影响第19页
                1.1.2.5 立克次氏小体属对昆虫纲宿主的影响第19-20页
        1.2 蛛形纲宿主体内细菌类群的研究现状第20-21页
            1.2.1 内共生菌在蛛形纲宿主体内的分布第20-21页
            1.2.2 内共生菌对蛛形纲宿主的影响第21页
                1.2.2.1 内共生菌对蜱螨目宿主的影响第21页
                1.2.2.2 内共生菌对蜘蛛目宿主的影响第21页
    2 节肢动物肠道菌群的研究现状第21-23页
        2.1 节肢动物肠道菌群的影响因素第22页
        2.2 节肢动物肠道菌群对宿主的影响第22-23页
            2.2.1 提供营养物质第22页
            2.2.2 提高宿主防御能力第22页
            2.2.3 影响宿主的寿命、发育及繁殖第22-23页
    3 细菌多样性研究方法概述第23-24页
        3.1 传统微生物培养技术第23页
        3.2 变性梯度凝胶电泳技术第23页
        3.3 末端限制性片段长度多态性分析技术第23页
        3.4 高通量测序技术第23-24页
    4 本课题的研究意义与目的第24-25页
第2章 蜘蛛体内细菌多样性研究第25-45页
    1 材料与方法第25-29页
        1.1 试验材料第25-26页
        1.2 实验主要仪器与试剂第26页
        1.3 试验方法第26-28页
            1.3.1 蜘蛛样品预处理第26-27页
            1.3.2 蜘蛛总DNA的提取第27页
            1.3.3 目标片段的PCR扩增第27-28页
                1.3.3.1 引物核苷酸序列第27页
                1.3.3.2 PCR反应体系第27-28页
                1.3.3.3 PCR反应条件第28页
            1.3.4 PCR产物检测第28页
            1.3.5 DNA混合及Illumina测序第28页
        1.4 数据处理与分析第28-29页
            1.4.1 原始数据筛选及质量评估第29页
            1.4.2 OTU分析及物种注释第29页
            1.4.3 统计学处理第29页
    2 实验结果第29-43页
        2.1 蜘蛛体内细菌类群Alpha多样性分析第29-32页
            2.1.1 蜘蛛体内细菌类群的Shannon-Wiener曲线第29-30页
            2.1.2 蜘蛛体内细菌类群的多样性指数第30-32页
        2.2 蜘蛛体内细菌类群组成分析第32-41页
            2.2.1 各分类学水平上不同种蜘蛛体内细菌类群数分析第32页
            2.2.2 门分类学水平上不同种蜘蛛体内菌群的组成分析第32-34页
            2.2.3 科分类学水平上不同种蜘蛛体内菌群的组成分析第34-37页
            2.2.4 属分类学水平上不同种蜘蛛体内菌群的组成分析第37-41页
        2.3 蜘蛛体内主要内共生菌OTU的分布第41-42页
        2.4 不同种蜘蛛体内细菌群落结构的差异分析第42-43页
    3 讨论第43-45页
第3章 蜘蛛肠道细菌多样性研究第45-63页
    1 材料与方法第45-47页
        1.1 试验材料第45页
        1.2 试验方法第45-46页
            1.2.1 蜘蛛样品预处理第45-46页
            1.2.2 蜘蛛肠道解剖第46页
            1.2.3 蜘蛛肠道总DNA的提取第46页
            1.2.4 PCR扩增及PCR产物检测第46页
            1.2.5 DNA混合及Illumin测序第46页
        1.3 数据处理与分析第46-47页
            1.3.1 原始数据筛选及质量评估第46-47页
            1.3.2 OTU分析及物种注释第47页
            1.3.3 统计学处理第47页
    2 实验结果第47-61页
        2.1 蜘蛛肠道解剖图第47页
        2.2 蜘蛛肠道细菌类群Alpha多样性分析第47-51页
            2.2.1 蜘蛛肠道细菌类群的Shannnon-Wiener曲线第48页
            2.2.2 蜘蛛肠道细菌类群的等级曲线第48-49页
            2.2.3 蜘蛛肠道细菌类群的多样性指数第49-50页
            2.2.4 蜘蛛肠道内鉴定到不同分类学水平的OTU数第50-51页
        2.3 蜘蛛肠道细菌类群组成分析第51-58页
            2.3.1 各分类学水平上不同种蜘蛛肠道细菌类群数第51-52页
            2.3.2 门分类学水平上不同种蜘蛛肠道菌群的组成分析第52-53页
            2.3.3 科分类学水平上不同种蜘蛛肠道菌群的组成分析第53-54页
            2.3.4 属分类学水平上不同种蜘蛛肠道菌群的组成分析第54-58页
        2.4 蜘蛛肠道内主要菌群的OTU分布第58页
        2.5 蜘蛛肠道菌群基于GraPhlAn的分类学组成信息可视化第58-59页
        2.6 不同种蜘蛛肠道内菌群群落结构差异分析第59-60页
        2.7 不同种蜘蛛肠道内菌群代谢功能预测第60-61页
    3 讨论第61-63页
第4章 总结与展望第63-65页
参考文献第65-73页
硕士期间已发表和待发表的论文第73-74页
致谢第74页

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