摘要 | 第5-8页 |
Abstract | 第8-10页 |
第1章 绪论 | 第17-25页 |
1 节肢动物体内细菌类群的研究现状 | 第17-21页 |
1.1 昆虫纲宿主体内细菌类群的研究现状 | 第17-20页 |
1.1.1 内共生菌在昆虫纲宿主体内的分布 | 第17-18页 |
1.1.2 内共生菌对昆虫纲宿主的影响 | 第18-20页 |
1.1.2.1 沃尔巴克氏体属对昆虫纲宿主的影响 | 第18-19页 |
1.1.2.2 立克次氏体属对昆虫纲宿主的影响 | 第19页 |
1.1.2.3 Cardinium对昆虫纲宿主的影响 | 第19页 |
1.1.2.4 螺原体属对昆虫纲宿主的影响 | 第19页 |
1.1.2.5 立克次氏小体属对昆虫纲宿主的影响 | 第19-20页 |
1.2 蛛形纲宿主体内细菌类群的研究现状 | 第20-21页 |
1.2.1 内共生菌在蛛形纲宿主体内的分布 | 第20-21页 |
1.2.2 内共生菌对蛛形纲宿主的影响 | 第21页 |
1.2.2.1 内共生菌对蜱螨目宿主的影响 | 第21页 |
1.2.2.2 内共生菌对蜘蛛目宿主的影响 | 第21页 |
2 节肢动物肠道菌群的研究现状 | 第21-23页 |
2.1 节肢动物肠道菌群的影响因素 | 第22页 |
2.2 节肢动物肠道菌群对宿主的影响 | 第22-23页 |
2.2.1 提供营养物质 | 第22页 |
2.2.2 提高宿主防御能力 | 第22页 |
2.2.3 影响宿主的寿命、发育及繁殖 | 第22-23页 |
3 细菌多样性研究方法概述 | 第23-24页 |
3.1 传统微生物培养技术 | 第23页 |
3.2 变性梯度凝胶电泳技术 | 第23页 |
3.3 末端限制性片段长度多态性分析技术 | 第23页 |
3.4 高通量测序技术 | 第23-24页 |
4 本课题的研究意义与目的 | 第24-25页 |
第2章 蜘蛛体内细菌多样性研究 | 第25-45页 |
1 材料与方法 | 第25-29页 |
1.1 试验材料 | 第25-26页 |
1.2 实验主要仪器与试剂 | 第26页 |
1.3 试验方法 | 第26-28页 |
1.3.1 蜘蛛样品预处理 | 第26-27页 |
1.3.2 蜘蛛总DNA的提取 | 第27页 |
1.3.3 目标片段的PCR扩增 | 第27-28页 |
1.3.3.1 引物核苷酸序列 | 第27页 |
1.3.3.2 PCR反应体系 | 第27-28页 |
1.3.3.3 PCR反应条件 | 第28页 |
1.3.4 PCR产物检测 | 第28页 |
1.3.5 DNA混合及Illumina测序 | 第28页 |
1.4 数据处理与分析 | 第28-29页 |
1.4.1 原始数据筛选及质量评估 | 第29页 |
1.4.2 OTU分析及物种注释 | 第29页 |
1.4.3 统计学处理 | 第29页 |
2 实验结果 | 第29-43页 |
2.1 蜘蛛体内细菌类群Alpha多样性分析 | 第29-32页 |
2.1.1 蜘蛛体内细菌类群的Shannon-Wiener曲线 | 第29-30页 |
2.1.2 蜘蛛体内细菌类群的多样性指数 | 第30-32页 |
2.2 蜘蛛体内细菌类群组成分析 | 第32-41页 |
2.2.1 各分类学水平上不同种蜘蛛体内细菌类群数分析 | 第32页 |
2.2.2 门分类学水平上不同种蜘蛛体内菌群的组成分析 | 第32-34页 |
2.2.3 科分类学水平上不同种蜘蛛体内菌群的组成分析 | 第34-37页 |
2.2.4 属分类学水平上不同种蜘蛛体内菌群的组成分析 | 第37-41页 |
2.3 蜘蛛体内主要内共生菌OTU的分布 | 第41-42页 |
2.4 不同种蜘蛛体内细菌群落结构的差异分析 | 第42-43页 |
3 讨论 | 第43-45页 |
第3章 蜘蛛肠道细菌多样性研究 | 第45-63页 |
1 材料与方法 | 第45-47页 |
1.1 试验材料 | 第45页 |
1.2 试验方法 | 第45-46页 |
1.2.1 蜘蛛样品预处理 | 第45-46页 |
1.2.2 蜘蛛肠道解剖 | 第46页 |
1.2.3 蜘蛛肠道总DNA的提取 | 第46页 |
1.2.4 PCR扩增及PCR产物检测 | 第46页 |
1.2.5 DNA混合及Illumin测序 | 第46页 |
1.3 数据处理与分析 | 第46-47页 |
1.3.1 原始数据筛选及质量评估 | 第46-47页 |
1.3.2 OTU分析及物种注释 | 第47页 |
1.3.3 统计学处理 | 第47页 |
2 实验结果 | 第47-61页 |
2.1 蜘蛛肠道解剖图 | 第47页 |
2.2 蜘蛛肠道细菌类群Alpha多样性分析 | 第47-51页 |
2.2.1 蜘蛛肠道细菌类群的Shannnon-Wiener曲线 | 第48页 |
2.2.2 蜘蛛肠道细菌类群的等级曲线 | 第48-49页 |
2.2.3 蜘蛛肠道细菌类群的多样性指数 | 第49-50页 |
2.2.4 蜘蛛肠道内鉴定到不同分类学水平的OTU数 | 第50-51页 |
2.3 蜘蛛肠道细菌类群组成分析 | 第51-58页 |
2.3.1 各分类学水平上不同种蜘蛛肠道细菌类群数 | 第51-52页 |
2.3.2 门分类学水平上不同种蜘蛛肠道菌群的组成分析 | 第52-53页 |
2.3.3 科分类学水平上不同种蜘蛛肠道菌群的组成分析 | 第53-54页 |
2.3.4 属分类学水平上不同种蜘蛛肠道菌群的组成分析 | 第54-58页 |
2.4 蜘蛛肠道内主要菌群的OTU分布 | 第58页 |
2.5 蜘蛛肠道菌群基于GraPhlAn的分类学组成信息可视化 | 第58-59页 |
2.6 不同种蜘蛛肠道内菌群群落结构差异分析 | 第59-60页 |
2.7 不同种蜘蛛肠道内菌群代谢功能预测 | 第60-61页 |
3 讨论 | 第61-63页 |
第4章 总结与展望 | 第63-65页 |
参考文献 | 第65-73页 |
硕士期间已发表和待发表的论文 | 第73-74页 |
致谢 | 第74页 |