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暗纹东方鲀耐受盐度能力的环境因子效应及其在转录组学水平上的差异

摘要第3-6页
Abstract第6-9页
第1章 绪论第15-25页
    1.1 鱼类的渗透压调节第15-17页
        1.1.1 渗透压调节的种类第15页
        1.1.2 淡水、海水鱼的渗透压调节方式第15-16页
        1.1.3 不同器官的渗透压调节机制第16-17页
            1.1.3.1 鳃第16-17页
            1.1.3.2 肠第17页
            1.1.3.3 肾第17页
    1.2 渗透压调节分子机制的研究进展第17-20页
        1.2.1 相关基因的调控第17-18页
        1.2.2 相关激素的调控第18-20页
    1.3 环境因子对鱼类渗透压调节的影响第20-21页
        1.3.1 温度第20页
        1.3.2 重金属第20-21页
        1.3.3 亚硝酸盐第21页
    1.4 暗纹东方鲀生物学特征第21-23页
        1.4.1 分类地位第22页
        1.4.2 形态学特征第22页
        1.4.3 生活习性和生活史第22-23页
        1.4.4 人工繁殖第23页
    1.5 研究目的、意义和内容第23-25页
        1.5.1 研究目的和意义第23页
        1.5.2 研究的主要内容第23-24页
        1.5.3 研究技术路线第24-25页
第2章 温度对暗纹东方鲀胚胎耐受盐度及其发育的影响第25-34页
    2.1 引言第25页
    2.2 材料与方法第25-26页
        2.2.1 实验材料第25-26页
        2.2.2 孵化条件第26页
        2.2.3 相关参数的测定第26页
        2.2.4 统计分析第26页
    2.3 结果第26-32页
        2.3.1 胚胎孵化速率第26-28页
        2.3.2 胚胎出膜率第28-29页
        2.3.3 初孵仔鱼24小时存活能力第29-30页
        2.3.4 初孵仔鱼24小时畸形率第30-32页
    2.4 讨论第32-33页
    2.5 本章小结第33-34页
第3章 温度和盐度对暗纹东方鲀仔鱼渗透调节和氧化应激的影响第34-44页
    3.1 引言第34-35页
    3.2 材料方法第35页
        3.2.1 实验材料第35页
        3.2.2 实验设计第35页
        3.2.3 参数测定第35页
        3.2.4 统计分析第35页
    3.3 结果第35-42页
        3.3.1 仔鱼的存活率第35-36页
        3.3.2 生化指标第36-42页
    3.4 讨论第42-43页
    3.5 本章小结第43-44页
第4章 重金属镉对暗纹东方鲀幼鱼盐度耐受及其氧化应激的影响第44-60页
    4.1 引言第44-45页
    4.2 材料方法第45-47页
        4.2.1 实验材料第45页
        4.2.2 实验设计第45页
        4.2.3 参数测定第45-46页
        4.2.4 统计分析第46-47页
    4.3 结果第47-56页
        4.3.1 幼鱼的存活率第47-48页
        4.3.2 ROS和MDA水平第48-51页
        4.3.3 氧化应激生物指标第51-55页
        4.3.4 Na~+/K~+-ATPase第55-56页
    4.4 讨论第56-59页
    4.5 本章小结第59-60页
第5章 亚硝酸盐对暗纹东方鲀幼鱼盐度耐受关键指标的影响第60-78页
    5.1 引言第60-61页
    5.2 材料方法第61-66页
        5.2.1 实验材料第61页
        5.2.2 实验设计第61页
        5.2.3 生理检测第61-62页
        5.2.4 生化检测第62-65页
            5.2.4.1 RNA提取第62-63页
            5.2.4.2 RNA质量的确定第63页
            5.2.4.3 RNA浓度的确定第63页
            5.2.4.4 cDNA反转录合成第63-64页
            5.2.4.5 基因表达第64-65页
        5.2.5 统计分析第65-66页
    5.3 结果第66-75页
        5.3.1 幼鱼存活率第66-69页
        5.3.2 血液参数第69页
        5.3.3 MDA含量第69-72页
        5.3.4 Na~+/K~+-ATPase,抗氧化剂和相关基因表达第72页
        5.3.5 HSP70水平第72-73页
        5.3.6 综合生物标志物响应指数第73-75页
    5.4 讨论第75-77页
        5.4.1 血液生理第75-76页
        5.4.2 抗氧化系统和HSP70第76页
        5.4.3 Na~+/K~+-ATPase第76页
        5.4.4 综合生物标志物响应指数(IBR)第76-77页
    5.5 本章小结第77-78页
第6章 暗纹东方鲀成鱼在不同盐度下渗透压调节组织的显微与超微结构观察第78-91页
    6.1 引言第78页
    6.2 材料方法第78-80页
        6.2.1 实验材料第78-79页
        6.2.2 实验设计第79页
        6.2.3 组织切片制作第79页
        6.2.4 透射电镜样品制备第79-80页
    6.3 结果第80-89页
        6.3.1 鳃组织的观察第80-82页
        6.3.2 肠组织的观察第82-85页
        6.3.3 肾组织的观察第85-89页
    6.4 讨论第89-90页
    6.5 本章小结第90-91页
第7章 基于转录组水平的暗纹东方鲀耐受盐度机制的研究第91-117页
    7.1 引言第91-93页
    7.2 材料方法第93-96页
        7.2.1 实验生物第93页
        7.2.2 测序前处理第93页
        7.2.3 组织总RNA的提取和转录组的测序第93页
        7.2.4 转录组测序原始数据的统计、质控、去杂处理和序列的拼接第93-94页
        7.2.5 拼接结果的注释第94页
        7.2.6 基因表达量分析第94页
        7.2.7 COG分类第94页
        7.2.8 差异表达基因筛选第94-95页
        7.2.9 Gene Ontology功能显著性富集分析第95页
        7.2.10 Pathway显著性富集分析第95页
        7.2.11 差异表达基因的实时荧光定量PCR (qPCR)验证第95-96页
    7.3 结果第96-114页
        7.3.1 暗纹东方鲀转录组测序数据质量评估第96-97页
        7.3.2 转录本测序的组装与拼接,以及基因功能注释第97-101页
        7.3.3 差异基因表达分析第101-107页
            7.3.3.1 鳃中差异表达基因分析第102-105页
            7.3.3.2 肾中差异表达基因分析第105-107页
            7.3.3.3 肠中差异表达基因分析第107页
        7.3.4 差异表达基因GO注释分析第107-108页
        7.3.5 差异表达基因KEGG pathway通路分析第108-113页
            7.3.5.1 鳃中差异表达基因KEGG pathway通路分析第108-110页
            7.3.5.2 肾中差异表达基因KEGG pathway通路分析第110-112页
            7.3.5.3 肠中差异表达基因KEGG pathway通路分析第112-113页
        7.3.6 实时定量检测RNA-seq数据第113-114页
    7.4 讨论第114-116页
        7.4.1 物质转运第114-115页
        7.4.2 神经内分泌激素调节第115页
        7.4.3 能量代谢和物质代谢第115-116页
    7.5 本章小结第116-117页
第8章 总结与展望第117-120页
参考文献第120-147页
发表论文、资助与获奖情况第147-150页
致谢第150-151页

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