| 中文摘要 | 第3-5页 |
| ABSTRACT | 第5-7页 |
| 第一章 文章综述 | 第12-21页 |
| 1 分子标记 | 第12页 |
| 2 SNP | 第12-15页 |
| 2.1 SNP检测方法 | 第13-14页 |
| 2.2 PCR—SSCP | 第14-15页 |
| 3 实时荧光定量PCR | 第15-16页 |
| 3.1 实时荧光定量PCR技术的基本原理 | 第15-16页 |
| 3.2 实时荧光定量PCR技术的应用 | 第16页 |
| 4 候选基因 | 第16-19页 |
| 4.1 Fbxl5基因的研究进展 | 第16-18页 |
| 4.1.1 Fbxl5基因的发现和定位 | 第16-17页 |
| 4.1.2 Fbxl5基因的生物学功能 | 第17-18页 |
| 4.1.3 Fbxl5基因的研究进展 | 第18页 |
| 4.2 Myf6基因的研究进展 | 第18-19页 |
| 4.2.1 Myf6基因的发现与定位 | 第18页 |
| 4.2.2 Myf6基因的生物学功能 | 第18-19页 |
| 4.2.3 Myf6基因的研究进展 | 第19页 |
| 5 研究目的与意义 | 第19-21页 |
| 第二章 Fbxl5与Myf6基因多态性与京海黄鸡生长性状、繁殖性状的关联分析 | 第21-51页 |
| 第一节 Fbxl5中rs316244767突变位点与京海黄鸡生长、繁殖性状的关联分析 | 第21-31页 |
| 1 材料与方法 | 第21-24页 |
| 1.1 试验材料 | 第21-23页 |
| 1.1.1 实验动物 | 第21页 |
| 1.1.2 主要仪器设备 | 第21页 |
| 1.1.3 主要实验试剂 | 第21-22页 |
| 1.1.4 主要试剂的配制 | 第22-23页 |
| 1.2 试验方法 | 第23-24页 |
| 1.2.1 鸡血液DNA提取 | 第23页 |
| 1.2.2 引物设计 | 第23-24页 |
| 1.2.3 PCR-SSCP分析 | 第24页 |
| 2 数据分析及统计方法 | 第24-25页 |
| 2.1 相关软件 | 第24页 |
| 2.2 数据分析与统计方法 | 第24-25页 |
| 2.2.1 群体基因频率、基因型频率的计算以及卡方检验 | 第24-25页 |
| 2.2.2 遗传多样性参数 | 第25页 |
| 2.2.3 关联分析 | 第25页 |
| 3 结果与分析 | 第25-29页 |
| 3.1 鸡基因组DNA和PCR产物结果 | 第25-26页 |
| 3.1.1 基因组DNA提取结果 | 第25-26页 |
| 3.1.2 引物PCR扩增效果检测 | 第26页 |
| 3.2 所选突变位点的多态性对京海黄鸡生长、繁殖性状的遗传效应分析 | 第26-29页 |
| 3.2.1 PCR-SSCP检测及测序结果 | 第26-27页 |
| 3.2.2 突变位点的等位基因和基因型频率 | 第27-28页 |
| 3.2.3 突变位点与京海黄鸡生长性状的关联分析 | 第28页 |
| 3.2.4 突变位点与京海黄鸡繁殖性状的关联分析 | 第28-29页 |
| 4 讨论 | 第29-31页 |
| 4.1 突变位点的多态性和群体遗传学分析 | 第29页 |
| 4.2 突变位点的多态性与京海黄鸡各性状间的关联性 | 第29-31页 |
| 第二节 Fbxl5基因的多态性与京海黄鸡生长性状、繁殖性状的关联分析 | 第31-44页 |
| 1 材料与方法 | 第31-33页 |
| 1.1 试验材料 | 第31页 |
| 1.2 试验方法 | 第31-33页 |
| 1.2.1 鸡血液DNA提取 | 第31-32页 |
| 1.2.2 引物设计 | 第32-33页 |
| 1.2.3 PCR-SSCP | 第33页 |
| 2 数据分析及统计方法 | 第33-34页 |
| 2.1 相关软件 | 第33页 |
| 2.2 数据分析及统计方法 | 第33-34页 |
| 2.2.1 单倍型分析 | 第33页 |
| 2.2.2 关联分析 | 第33-34页 |
| 3 结果分析 | 第34-42页 |
| 3.1 引物PCR扩增效果检测 | 第34页 |
| 3.2 Fbxl5基因多态性与京海黄鸡生长、繁殖性状的遗传效应分析 | 第34-42页 |
| 3.2.1 引物P2、P3、P4分析结果 | 第34-42页 |
| 4 讨论 | 第42-44页 |
| 4.1 Fbxl5基因的连锁不平衡分析及单倍型分析 | 第42-44页 |
| 4.1.1 连锁不平衡分析 | 第42页 |
| 4.1.2 单倍型分析 | 第42-44页 |
| 第三节 Myf6基因的多态性与京海黄鸡生长性状、繁殖性状的关联分析 | 第44-51页 |
| 1 材料与方法 | 第44-45页 |
| 1.1 试验材料 | 第44页 |
| 1.2 试验方法 | 第44-45页 |
| 1.2.1 鸡血液DNA提取 | 第44页 |
| 1.2.2 引物设计 | 第44-45页 |
| 2 数据分析及统计方法 | 第45页 |
| 2.1 相关软件 | 第45页 |
| 2.2 数据分析及统计方法 | 第45页 |
| 2.2.1 群体基因频率、基因型频率的计算以及卡方检验 | 第45页 |
| 2.2.2 遗传多样性参数 | 第45页 |
| 2.2.3 关联分析 | 第45页 |
| 3 结果与分析 | 第45-48页 |
| 3.1 引物PCR扩增效果检测 | 第45-46页 |
| 3.2 Myf6基因多态性与京海黄鸡生长、繁殖性状的遗传效应分析 | 第46-48页 |
| 3.2.1 引物P1的PCR-SSCP检测及测序结果 | 第46-47页 |
| 3.2.2 外显子1突变位点的等位基因及基因频率 | 第47页 |
| 3.2.3 外显子1各基因型与京海黄鸡生长性状的关联分析 | 第47-48页 |
| 3.2.4 外显子1各基因型与京海黄鸡繁殖性状的关联分析 | 第48页 |
| 4 讨论 | 第48-51页 |
| 4.1 Myf6基因的多态性和群体遗传学分析 | 第48-49页 |
| 4.2 Myf6基因的多态性与京海黄鸡各性状间的关联性 | 第49-51页 |
| 第三章 Fbxl5基因和Myf6基因不同生长阶段表达规律的研究 | 第51-63页 |
| 1 材料与方法 | 第51-54页 |
| 1.1 试验材料 | 第51-52页 |
| 1.1.1 试验动物 | 第51页 |
| 1.1.2 主要实验试剂 | 第51页 |
| 1.1.3 主要仪器设备 | 第51-52页 |
| 1.1.4 主要试剂的配制 | 第52页 |
| 1.2 实验方法 | 第52-54页 |
| 1.2.1 鸡组织样总RNA的提取和检测(Trizol法) | 第52-53页 |
| 1.2.2 引物设计 | 第53页 |
| 1.2.3 反转录 | 第53页 |
| 1.2.4 内参基因及目的基因的标准曲线和溶解曲线 | 第53页 |
| 1.2.5 实时荧光定量PCR | 第53-54页 |
| 1.3 统计分析 | 第54页 |
| 2 结果与分析 | 第54-60页 |
| 2.1 总RNA提取结果检测 | 第54页 |
| 2.2 PCR扩增目的基因和内参基因结果 | 第54-55页 |
| 2.3 目的基因的标准曲线和溶解曲线结果 | 第55-56页 |
| 2.4 Fbxl5基因的表达规律 | 第56-58页 |
| 2.4.1 Fbxl5基因在京海黄鸡、金茅黄鸡不同组织中的表达差异 | 第56-57页 |
| 2.4.2 Fbxl5基因在京海黄鸡、金茅黄鸡高表达组织的不同生长阶段的表达差异 | 第57-58页 |
| 2.5 Myf6基因的表达规律 | 第58-60页 |
| 2.5.1 Myf6基因在京海黄鸡、金茅黄鸡不同组织中的表达差异 | 第58-59页 |
| 2.5.2 Myf6基因在京海黄鸡、金茅黄鸡高表达组织的不同生长阶段的表达差异 | 第59-60页 |
| 3 讨论 | 第60-63页 |
| 3.1 Fbxl5基因的表达情况 | 第60-61页 |
| 3.2 Myf6基因的表达情况 | 第61-63页 |
| 全文结论 | 第63-64页 |
| 主要创新点 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-74页 |
| 致谢 | 第74-75页 |
| 攻读学位期间发表学术论文 | 第75-76页 |
