基于蒙特卡洛理论的基因序列分析与仿真
| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 第一章 绪论 | 第11-17页 |
| 1.1 研究背景 | 第11-12页 |
| 1.2 国内外发展与研究现状 | 第12-14页 |
| 1.2.1 国内外研究现状 | 第12-13页 |
| 1.2.2 生物信息学的研究内容 | 第13-14页 |
| 1.3 本文的研究内容 | 第14-15页 |
| 1.4 论文组织结构 | 第15-17页 |
| 第二章 预备知识 | 第17-26页 |
| 2.1 数学基础 | 第17-19页 |
| 2.2 随机模型 | 第19-20页 |
| 2.3 系统发育 | 第20页 |
| 2.4 蒙特卡洛理论 | 第20-22页 |
| 2.5 n-gram模型与HDLM算法 | 第22-25页 |
| 2.6 小结 | 第25-26页 |
| 第三章 序列分析与实验 | 第26-39页 |
| 3.1 基于保守序列理论的序列分析模型建模 | 第26-29页 |
| 3.2 HDLM算法改进 | 第29-31页 |
| 3.3 实验 | 第31-37页 |
| 3.2.1 全序列片段模式分析 | 第31-33页 |
| 3.2.2 独立片段模式分析 | 第33-36页 |
| 3.2.3 HDLM分析 | 第36-37页 |
| 3.4 小结 | 第37-39页 |
| 第四章 蒙特卡洛模拟建模与实验 | 第39-51页 |
| 4.1 蒙特卡洛模型的构建 | 第39-41页 |
| 4.2 蒙特卡洛聚类算法 | 第41-44页 |
| 4.3 随机模型的性能优化与实验 | 第44-50页 |
| 4.3.1 聚类实验的计算优化与耗时情况 | 第44-47页 |
| 4.3.2 聚类结果比较 | 第47-50页 |
| 4.3.3 实验总结 | 第50页 |
| 4.4 结论 | 第50-51页 |
| 第五章 总结与展望 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-56页 |
| 攻读学位期间发表的论文 | 第56-58页 |
| 致谢 | 第58页 |
