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草酸青霉纤维素降解酶系主要转录调控因子研究及菌株改良

摘要第8-13页
ABSTRACT第13-19页
符号说明及缩略词第20-22页
第一章 绪论第22-46页
    1.1 木质纤维素的真菌降解转化第22-27页
        1.1.1 降解木质纤维素的真菌第22-24页
        1.1.2 真菌木质纤维素降解酶的酶系组成及降解机制第24-26页
        1.1.3 木质纤维素酶系改良优化第26-27页
    1.2 真菌木质纤维素降解酶的合成对碳源及其它因素的响应第27-32页
        1.2.1 碳降解物阻遏第28-29页
        1.2.2 木质纤维素降解酶的诱导第29-31页
        1.2.3 其它因素的影响第31-32页
    1.3 真菌木质纤维素降解酶的转录调控机制第32-41页
        1.3.1 真菌转录复合物第32-33页
        1.3.2 转录调控因子第33-41页
    1.4 草酸青霉在木质纤维素降解中的应用及研究进展第41-44页
        1.4.1 草酸青霉菌株的筛选及进化第41-42页
        1.4.2 草酸青霉的研究进展第42-44页
    1.5 本文的立题依据和研究目的第44-46页
第二章 草酸青霉突变子胞外水解酶系进化和转录因子的差异表达第46-70页
    2.1 实验材料与方法第46-55页
        2.1.1 菌株及培养条件第46-47页
        2.1.2 PCR引物第47-48页
        2.1.3 主要分子试剂及试剂盒第48页
        2.1.4 实验常用试剂第48-49页
        2.1.5 实验主要仪器第49-50页
        2.1.6 主要分子生物学操作方法第50-53页
        2.1.7 胞外水解酶活力及胞外蛋白浓度测定第53-54页
        2.1.8 主要水解酶基因表达水平的测定第54页
        2.1.9 草酸青霉CreA、XlnR和AceA的鉴定及序列比对第54-55页
        2.1.10 转录因子编码基因表达水平的测定第55页
    2.2 结果与讨论第55-67页
        2.2.1 草酸青霉野生株114-2与突变株JU-A10、JU-A10-T的酶系组成差异第55-58页
        2.2.2 草酸青霉转录因子CreA、XlnR及AceA的鉴定与分析第58-63页
        2.2.3 转录因子creA、xlnR及aceA碳源差异表达分析第63-66页
        2.2.4 转录因子creA、xlnR及aceA在野生株114-2和高产突变子JU-A10、JU-A10-T中的差异表达第66-67页
    2.3 本章小结第67-70页
第三章 草酸青霉碳降解物阻遏因子CreA的功能研究第70-108页
    3.1 实验材料与方法第70-82页
        3.1.1 菌株及质粒第70-71页
        3.1.2 PCR引物第71-72页
        3.1.3 培养基和培养条件第72-73页
        3.1.4 主要分子实验试剂和常用试剂第73-75页
        3.1.5 分子生物学操作方法第75-77页
        3.1.6 突变菌株的构建第77-78页
        3.1.7 生长及碳源利用分析第78-79页
        3.1.8 胞外水解酶活力测定第79页
        3.1.9 主要水解酶及转录因子编码基因表达水平的测定第79-80页
        3.1.10 表达谱测序数据分析第80-81页
        3.1.11 CreA蛋白DNA结合结构域的异源表达及纯化第81页
        3.1.12 EMSA分析调控蛋白与启动子的体外结合第81-82页
    3.2 结果与讨论第82-106页
        3.2.1 草酸青霉114-2中CreA调控木质纤维素酶的合成第82-89页
        3.2.2 草酸青霉JU-A10中CreA-1对其木质纤维素酶高产的影响第89-94页
        3.2.3 表达谱测序技术揭示CreA在草酸青霉木质纤维素降解和生长发育过程中的作用第94-102页
        3.2.4 草酸青霉CreA与纤维素酶启动子的体外结合第102-106页
    3.3 本章小结第106-108页
第四章 草酸青霉转录激活因子XlnR在纤维素酶及半纤维素酶合成调控中的作用研究第108-126页
    4.1 实验材料与方法第108-112页
        4.1.1 菌株及质粒第108-109页
        4.1.2 培养基和培养条件第109页
        4.1.3 PCR引物第109-110页
        4.1.4 主要分子试剂和常用试剂第110页
        4.1.5 分子生物学操作方法第110页
        4.1.6 突变菌株的构建第110-111页
        4.1.7 生长及碳源利用分析第111页
        4.1.8 木质纤维素酶活力、表达水平测定及转录因子表达量测定第111-112页
        4.1.9 EMSA检测XlnR蛋白DNA结合结构域与启动子序列的结合第112页
    4.2 结果与讨论第112-124页
        4.2.1 草酸青霉114-2中XlnR缺失及过表达菌株的构建第112-114页
        4.2.2 XlnR明显参与了草酸青霉对木聚糖的利用第114-117页
        4.2.3 XlnR调控草酸青霉木质纤维素降解酶的表达第117-120页
        4.2.4 草酸青霉XlnR与木质纤维素降解酶基因启动子的体外结合第120-124页
    4.3 本章小结第124-126页
第五章 转录因子AceA在草酸青霉生长发育和胞外多聚糖水解酶系合成调控中的作用研究第126-150页
    5.1 实验材料与方法第126-131页
        5.1.1 菌株、质粒及 培养条件第126-127页
        5.1.2 PCR引物第127-128页
        5.1.3 主要实验仪器、常用试剂和分子生物学操作方法第128页
        5.1.4 AceA相关突变菌株的构建第128-130页
        5.1.5 生长及碳源利用分析第130-131页
        5.1.6 木质纤维素酶活力、表达水平测定及转录因子表达量测定第131页
    5.2 结果与讨论第131-147页
        5.2.1 草酸青霉114-2中AceA缺失与回补菌株的构建第131-133页
        5.2.2 AceA调控草酸青霉的生长发育过程第133-136页
        5.2.3 AceA在草酸青霉碳源利用中的功能第136-137页
        5.2.4 AceA影响草酸青霉纤维素酶的合成第137-138页
        5.2.5 AceA调控木质纤维素酶基因的表达第138-140页
        5.2.6 草酸青霉AceA与里氏木霉ACE1存在调控功能差异第140-146页
        5.2.7 AceA通过调控AmyR的合成量来调控淀粉酶基因的表达第146-147页
    5.3 本章小结第147-150页
第六章 草酸青霉未知蛋白PDE_01461对木质纤维素降解酶系的调控及在菌株改良中的应用第150-162页
    6.1 实验材料与方法第151-154页
        6.1.1 菌株、质粒及培养条件第151页
        6.1.2 PCR引物第151-152页
        6.1.3 常用试剂和分子生物学操作方法第152页
        6.1.4 突变菌株的构建第152-153页
        6.1.5 木质纤维素酶活力、表达水平测定第153-154页
    6.2 结果与讨论第154-159页
        6.2.1 PDE_01641的鉴定与序列分析第154-155页
        6.2.2 草酸青霉114-2中PDE_01641的敲除及回补第155-156页
        6.2.3 PDE_01641对草酸青霉木质纤维素降解酶活力的影响第156-157页
        6.2.4 PDE_01641对草酸青霉木质纤维素降解酶基因表达的影响第157-158页
        6.2.5 草酸青霉JU-A10-T中PDE_01641的敲除第158-159页
    6.3 本章小结第159-162页
全文总结第162-166页
参考文献第166-186页
在读期间发表和撰写的学术论文第186-188页
致谢第188-189页
附件第189-194页
学位论文评阅及答辩情况表第194页

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