| 摘要 | 第3-6页 |
| ABSTRACT | 第6-9页 |
| 中英对照缩略词 | 第16-18页 |
| 第一部分 文献综述 | 第18-90页 |
| 综述一 传染性支气管炎病毒研究进展 | 第18-44页 |
| 1 病原学 | 第18-31页 |
| 1.1 发现、命名与分类 | 第18-19页 |
| 1.2 生物学特性 | 第19-20页 |
| 1.3 基因组结构与主要功能蛋白 | 第20-23页 |
| 1.4 生活周期 | 第23-27页 |
| 1.5 致病机理 | 第27-28页 |
| 1.6 毒株分型 | 第28-31页 |
| 2 流行病学 | 第31-33页 |
| 2.1 自然宿主 | 第31-32页 |
| 2.2 实验室宿主 | 第32-33页 |
| 2.3 传播方式 | 第33页 |
| 3 临床症状及病理变化 | 第33-36页 |
| 3.1 呼吸道 | 第33-34页 |
| 3.2 肾脏 | 第34-35页 |
| 3.3 生殖道 | 第35-36页 |
| 3.4 消化道 | 第36页 |
| 3.5 其它 | 第36页 |
| 4 诊断 | 第36-40页 |
| 4.1 病原的分离鉴定 | 第36-37页 |
| 4.2 血清学诊断技术 | 第37-38页 |
| 4.3 分子生物学检测技术 | 第38-40页 |
| 5 防治 | 第40-44页 |
| 5.1 免疫预防 | 第40-43页 |
| 5.2 治疗 | 第43-44页 |
| 综述二 传染性支管炎病毒在世界范围内流行现状 | 第44-54页 |
| 1 亚洲国家IBV流行现状 | 第44-48页 |
| 2 欧洲国家IBV流行现状 | 第48-50页 |
| 3 非洲国家IBV流行现状 | 第50-51页 |
| 4 北美洲国家IBV流行现状 | 第51-52页 |
| 5 南美洲国家IBV流行现状 | 第52-53页 |
| 6 大洋洲国家IBV流行现状 | 第53-54页 |
| 综述三 禽冠状病毒纤突蛋白研究进展 | 第54-65页 |
| 1 禽冠状病毒S蛋白概述 | 第54-56页 |
| 1.1 结构特点 | 第54-55页 |
| 1.2 序列多样性 | 第55-56页 |
| 1.3 其它禽类冠状病毒S蛋白 | 第56页 |
| 2 禽冠状病毒S蛋白功能 | 第56-59页 |
| 2.1 组织吸附中的作用 | 第56-58页 |
| 2.2 细胞亲和性中的作用 | 第58页 |
| 2.3 体内组织嗜性与致病性中的作用 | 第58-59页 |
| 3 病毒吸附中宿主影响因素 | 第59-62页 |
| 3.1 唾液酸 | 第59-60页 |
| 3.2 蛋白受体 | 第60-61页 |
| 3.3 凝集素 | 第61页 |
| 3.4 硫酸肝素 | 第61-62页 |
| 3.5 宿主蛋白酶 | 第62页 |
| 4 禽冠状病毒S蛋白引起宿主天然免疫反应 | 第62-65页 |
| 参考文献 | 第65-90页 |
| 第二部分 研究内容 | 第90-176页 |
| 第一章 2001～2016年间华东地区传染性支气管炎病毒分子流行病学分析 | 第90-120页 |
| 1 材料 | 第91-93页 |
| 1.1 生物材料 | 第91页 |
| 1.2 试剂与载体 | 第91-92页 |
| 1.3 主要试剂溶液配制 | 第92-93页 |
| 1.4 主要仪器 | 第93页 |
| 2 方法 | 第93-106页 |
| 2.1 引物设计 | 第93页 |
| 2.2 病毒增殖 | 第93-94页 |
| 2.3 病毒总RNA提取 | 第94页 |
| 2.4 S1基因扩增与序列测定 | 第94-96页 |
| 2.5 S1基因序列分析 | 第96-106页 |
| 3 结果 | 第106-116页 |
| 3.1 病毒分离结果 | 第106-107页 |
| 3.2 分离株S1蛋白长度与裂解位点的多样性 | 第107-109页 |
| 3.3 分离株S1基因分型的多样性 | 第109-112页 |
| 3.4 新分支New-Ⅰ与New-Ⅱ基因型IBV S1基因的来源 | 第112-116页 |
| 4 讨论 | 第116-120页 |
| 第二章 2001～2016年间我国传染性支气管炎病毒基因组序列重组分析 | 第120-142页 |
| 1 材料 | 第121-122页 |
| 1.1 生物材料 | 第121页 |
| 1.2 试剂与载体 | 第121页 |
| 1.3 主要试剂溶液配制 | 第121-122页 |
| 1.4 主要仪器 | 第122页 |
| 2 方法 | 第122-129页 |
| 2.1 分离株全序列扩增引物设计 | 第122页 |
| 2.2 分离株全基因组序列RT-PCR | 第122页 |
| 2.3 病毒基因组5'与3'端序列扩增 | 第122-127页 |
| 2.4 分离株基因组序列测定与分析 | 第127-129页 |
| 3 结果 | 第129-136页 |
| 3.1 分离株基因组结构 | 第129页 |
| 3.2 分离株CK/CH/2010/JT-1基因组的重组来源 | 第129-133页 |
| 3.3 分离株CK/CH/2014/QL1403基因组的重组来源 | 第133-135页 |
| 3.4 我国2001～2016年间IBV基因组重组现象普遍 | 第135-136页 |
| 4 讨论 | 第136-142页 |
| 第三章 我国鸡传染性支气管炎病毒分离株致病性分析及交叉保护研究 | 第142-154页 |
| 1 材料 | 第143-144页 |
| 1.1 生物材料 | 第143页 |
| 1.2 主要试剂 | 第143页 |
| 1.3 主要仪器 | 第143-144页 |
| 2 方法 | 第144-146页 |
| 2.1 病毒扩增 | 第144页 |
| 2.2 SPF鸡致病性实验 | 第144页 |
| 2.3 病毒中和实验 | 第144-145页 |
| 2.4 交叉保护实验 | 第145页 |
| 2.5 鸡IBV血清抗体ELISA | 第145-146页 |
| 3 结果 | 第146-150页 |
| 3.1 IBV分离株致病性 | 第146-148页 |
| 3.2 交叉中和实验结果 | 第148-149页 |
| 3.3 天然弱毒CK/CH/2014/QL1403对QX型IBV交叉保护实验 | 第149-150页 |
| 4 讨论 | 第150-154页 |
| 第四章 传染性支气管炎病毒S1蛋白的天然免疫应答研究 | 第154-170页 |
| 1 材料 | 第156-157页 |
| 1.1 生物材料 | 第156页 |
| 1.2 试剂与载体 | 第156页 |
| 1.3 主要试剂溶液配制 | 第156-157页 |
| 1.4 主要仪器 | 第157页 |
| 2 方法 | 第157-162页 |
| 2.1 引物设计 | 第157-158页 |
| 2.2 真核表达载体的构建 | 第158-159页 |
| 2.3 CEKC的制备 | 第159-160页 |
| 2.4 CEKC的质粒转染 | 第160页 |
| 2.5 共聚焦显微镜荧光分析 | 第160-161页 |
| 2.6 Western-blot | 第161页 |
| 2.7 荧光定量PCR方法检测相关因子 | 第161-162页 |
| 2.8 统计学分析 | 第162页 |
| 3 结果 | 第162-167页 |
| 3.1 S1基因RT-PCR扩增结果 | 第162-163页 |
| 3.2 重组质粒酶切鉴定 | 第163页 |
| 3.3 重组质粒转染CEKC后S1蛋白的表达 | 第163-164页 |
| 3.4 IBV S1蛋白引起CEKC天然免疫相关因子表达差异 | 第164-165页 |
| 3.5 配体刺激后IBV S1蛋白引起CEKC天然免疫相关因子表达差异 | 第165-167页 |
| 4 讨论 | 第167-170页 |
| 参考文献 | 第170-176页 |
| 全文总结 | 第176-177页 |
| 致谢 | 第177-178页 |
| 攻读博士期间所获成果 | 第178-179页 |
