| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 引言 | 第9-10页 |
| 1 文献综述 | 第10-20页 |
| 1.1 核小体及核小体定位 | 第10-11页 |
| 1.2 核小体影响基因调控 | 第11页 |
| 1.3 核小体研究方法 | 第11-15页 |
| 1.3.1 核小体研究的实验方法 | 第11-13页 |
| 1.3.2 核小体研究的理论方法 | 第13-15页 |
| 1.4 染色体基因组功能区 | 第15-16页 |
| 1.4.1 隔离子 | 第15-16页 |
| 1.4.2 启动子 | 第16页 |
| 1.5 核小体研究相关的生物信息学资源 | 第16-18页 |
| 1.5.1 CTCFBSDB 数据库 | 第16-17页 |
| 1.5.2 SGD 数据库 | 第17-18页 |
| 1.5.3 核小体定位数据 | 第18页 |
| 1.6 论文的研究内容与安排 | 第18-20页 |
| 2 理论预测方法及统计分析方法 | 第20-24页 |
| 2.1 IDQD 算法描述 | 第20-21页 |
| 2.1.1 多样性与多样性增量 | 第20-21页 |
| 2.1.2 二次判别分析 | 第21页 |
| 2.2 预测性能评估指标 | 第21-22页 |
| 2.3 统计分析方法 | 第22-24页 |
| 2.3.1 kmer 算法 | 第22-23页 |
| 2.3.2 GC 含量计算 | 第23-24页 |
| 3 人类隔离子区核小体占据统计分析 | 第24-28页 |
| 3.1 数据的获得与处理 | 第24页 |
| 3.2 人类染色体隔离子区统计分析 | 第24-28页 |
| 3.2.1 按照隔离子位置对GC 含量的统计分析 | 第24-25页 |
| 3.2.2 按照隔离子功能的不同对GC 含量的统计分析 | 第25-26页 |
| 3.2.3 隔离子起始位点上游和终止位点下游核小体占据的统计分析 | 第26-28页 |
| 4 酵母启动子区核小体预测 | 第28-30页 |
| 4.1 数据集 | 第28页 |
| 4.2 模型的应用 | 第28页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第28-30页 |
| 5 大肠杆菌序列形成核小体能力的预测 | 第30-35页 |
| 5.1 材料和方法 | 第30-31页 |
| 5.1.1 数据 | 第30页 |
| 5.1.2 数据集的构建 | 第30-31页 |
| 5.2 结果与讨论 | 第31-35页 |
| 5.2.1 IDQD 算法分类预测大肠杆菌基因组中核小体核心DNA 和连接 DNA | 第31-32页 |
| 5.2.2 核心DNA 和连接 DNA 中偏好的 k-mers 统计 | 第32-35页 |
| 结论 | 第35-36页 |
| 参考文献 | 第36-41页 |
| 在学研究成果 | 第41-42页 |
| 致谢 | 第42页 |
