| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 目录 | 第9-13页 |
| 第一章 前言 | 第13-27页 |
| 1 植物抗病研究进展 | 第13-19页 |
| 1.1 植物的先天免疫机制 | 第13-15页 |
| 1.2 介导植物抗病反应的信号因子 | 第15-18页 |
| 1.3 次生代谢产物与植物抗病反应 | 第18-19页 |
| 2 油菜菌核病相关研究 | 第19-23页 |
| 2.1 油菜菌核病抗性鉴定方法研究进展 | 第19页 |
| 2.2 菌核病毒性和致病相关因子 | 第19-21页 |
| 2.3 寄主对菌核菌侵染的应答反应 | 第21-23页 |
| 2.4 油菜菌核病抗病育种研究进展 | 第23页 |
| 3 转录组研究技术 | 第23-25页 |
| 3.1 几种转录组研究技术的对比 | 第23-25页 |
| 3.2 RNA-SEQ技术的应用 | 第25页 |
| 4 研究目的、内容和技术路线 | 第25-27页 |
| 4.1 研究目标 | 第25-26页 |
| 4.2 研究内容 | 第26页 |
| 4.3 技术路线 | 第26-27页 |
| 第二章 油菜抗、感菌核病近等基因系转录组测序 | 第27-56页 |
| 1 材料和方法 | 第27-31页 |
| 1.1 材料 | 第27页 |
| 1.2 方法 | 第27-31页 |
| 2 结果与分析 | 第31-54页 |
| 2.1 接种后侵染观察 | 第31-32页 |
| 2.2 RNA质量检测 | 第32-33页 |
| 2.3 测序数据产量和组装结果 | 第33-34页 |
| 2.4 UNIGENE功能注释 | 第34-41页 |
| 2.5 差异表达基因分析 | 第41-54页 |
| 3 讨论 | 第54-56页 |
| 3.1 关于材料的选择和取样时间点的确定 | 第54页 |
| 3.2 关于RNA-SEQ技术 | 第54-55页 |
| 3.3 差异基因分析 | 第55-56页 |
| 第三章 油菜与菌核病互作过程中差异表达基因的筛选和表达分析 | 第56-72页 |
| 1 材料和方法 | 第56-59页 |
| 1.1 材料 | 第56页 |
| 1.2 方法 | 第56-59页 |
| 2 结果与分析 | 第59-68页 |
| 2.1 PTI相关基因 | 第59页 |
| 2.2 茉莉酸信号途径 | 第59-60页 |
| 2.3 乙烯信号途径 | 第60-61页 |
| 2.4 ABA信号转导途径 | 第61页 |
| 2.5 钙信号途径 | 第61-62页 |
| 2.6 苯丙烷类代谢途径 | 第62页 |
| 2.7 生物碱合成与代谢途径 | 第62-63页 |
| 2.8 芥子油苷合成与代谢途径 | 第63-64页 |
| 2.9 荧光定量验证 | 第64-68页 |
| 3 讨论 | 第68-72页 |
| 3.1 PRRS与植物的防卫反应 | 第68-69页 |
| 3.2 参与油菜与菌核菌互作的信号途径 | 第69-71页 |
| 3.3 次生代谢产物参与植物的抗病反应 | 第71-72页 |
| 第四章 油菜钙依赖蛋白激酶的克隆与表达分析 | 第72-86页 |
| 1 材料和方法 | 第72-79页 |
| 1.1 材料 | 第72页 |
| 1.2 方法 | 第72-79页 |
| 2 结果 | 第79-84页 |
| 2.1 BNCDPK1基因的CDNA克隆 | 第79-80页 |
| 2.2 BNCDPK1基因的生物信息学分析 | 第80-82页 |
| 2.3 BNCDPK1基因的同源性分析与进化树构建 | 第82页 |
| 2.4 BNCDPK1基因的组织表达分析 | 第82-83页 |
| 2.5 BNCDPK1基因受菌核菌胁迫表达分析 | 第83-84页 |
| 3 讨论 | 第84-86页 |
| 第五章 总结及后续计划 | 第86-91页 |
| 1 接种方法和取样时间的确定 | 第86页 |
| 2 转录组测序 | 第86-87页 |
| 2.1 测序的产量和质量 | 第86页 |
| 2.2 UNIGENE的功能注释 | 第86-87页 |
| 3 差异表达基因的分析与验证 | 第87-88页 |
| 3.1 病原相关分子模式识别受体蛋白(PRRS) | 第87页 |
| 3.2 参与PTI防卫反应的信号途径 | 第87-88页 |
| 3.3 参与菌核菌应答的次生代谢产物 | 第88页 |
| 4 油菜钙依赖蛋白激酶基因BNCDPK1的克隆和表达分析 | 第88-89页 |
| 5 油菜抗感菌核菌机制分析 | 第89-90页 |
| 6 下一步研究思路 | 第90-91页 |
| 参考文献 | 第91-106页 |
| 附录A 感病品种接种前后差异基因GO富集 | 第106-109页 |
| 附录B 感病品种接种前后差异基因KEGG富集 | 第109-111页 |
| 附录C 抗病品种接种前后差异基因GO富集 | 第111-113页 |
| 附录D 抗病品接种前后差异基因KEGG富集 | 第113-116页 |
| 附录E 抗、感病品种间差异基因GO富集 | 第116-118页 |
| 附录F 抗、感病品种间差异基因KEGG富集 | 第118-120页 |
| 附录G QRT-PCR验证UNIGENE CDS 序列信息 | 第120-124页 |
| 缩写词表 | 第124-125页 |
| 致谢 | 第125-126页 |
| 作者简历及在学成果 | 第126页 |
