| 摘要 | 第3-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 缩略词 | 第9-16页 |
| 第1章 前言 | 第16-31页 |
| 1.1 研究背景 | 第16-29页 |
| 1.1.1 沙门菌概述 | 第16-17页 |
| 1.1.2 沙门菌的耐药机制 | 第17-26页 |
| 1.1.2.1 沙门菌对头孢菌素类药物的耐药机制 | 第17-19页 |
| 1.1.2.2 沙门菌对喹诺酮类药物的耐药机制 | 第19-26页 |
| 1.1.3 PMQR的流行 | 第26-28页 |
| 1.1.3.1 qnr的流行 | 第26页 |
| 1.1.3.2 aac(6’)-Ib-cr的流行 | 第26-27页 |
| 1.1.3.3 oqx AB和qep A的流行 | 第27-28页 |
| 1.1.4 PMQR基因之间及与其他机制间的相互作用 | 第28-29页 |
| 1.1.4.1 PMQR基因之间及与其他喹诺酮耐药机制的相互作用 | 第28-29页 |
| 1.1.4.2 PMQR基因与ESBLs之间的关系 | 第29页 |
| 1.2 研究目的及意义 | 第29-30页 |
| 1.3 研究技术路线 | 第30-31页 |
| 第2章 畜禽源沙门菌PMQR基因的流行分布及其与喹诺酮类药物耐药性的关系 | 第31-54页 |
| 2.1 引言 | 第31-32页 |
| 2.2 材料与方法 | 第32-40页 |
| 2.2.1 材料 | 第32-33页 |
| 2.2.1.1 样品来源 | 第32页 |
| 2.2.1.2 质控菌 | 第32页 |
| 2.2.1.3 药物 | 第32页 |
| 2.2.1.4 主要培养基及试剂 | 第32-33页 |
| 2.2.1.5 主要仪器设备 | 第33页 |
| 2.2.2 方法 | 第33-40页 |
| 2.2.2.1 菌株的复苏 | 第33页 |
| 2.2.2.2 细菌的鉴定与保存 | 第33-35页 |
| 2.2.2.3 血清型鉴定 | 第35页 |
| 2.2.2.4 琼脂稀释法测药物敏感性 | 第35-36页 |
| 2.2.2.5 PMQR基因的检测及鉴定 | 第36-39页 |
| 2.2.2.6 PCR扩增DNA促旋酶和拓扑异构酶IV基因 | 第39-40页 |
| 2.2.2.7 PMQR基因，靶位突变与环丙沙星耐药的相关性分析 | 第40页 |
| 2.3 结果与分析 | 第40-47页 |
| 2.3.1 细菌的复苏及鉴定结果 | 第40-41页 |
| 2.3.2 血清型鉴定结果 | 第41页 |
| 2.3.3 沙门菌的敏感性检测结果 | 第41-43页 |
| 2.3.4 PMQR基因的检测结果及与环丙沙星MIC之间的关系 | 第43-44页 |
| 2.3.5 靶位基因突变及其与环丙沙星耐药性的关系 | 第44-47页 |
| 2.4 讨论 | 第47-53页 |
| 2.4.1 动物源沙门菌耐药性和血清型分析 | 第47-48页 |
| 2.4.2 畜禽源沙门菌的血清型分析 | 第48-49页 |
| 2.4.3 aac(6')-Ib-cr基因的流行情况 | 第49-50页 |
| 2.4.4 aac(6’)-Ib-cr基因及靶位突变与环丙沙星MIC之间的关系 | 第50-53页 |
| 2.5 小结 | 第53-54页 |
| 第3章 aac(6’)-Ib-cr和/或oqx AB阳性沙门菌中ESBLs基因的流行及传播机制研究 | 第54-85页 |
| 3.1 引言 | 第54页 |
| 3.2 材料与方法 | 第54-72页 |
| 3.2.1 材料 | 第54-58页 |
| 3.2.1.1 受试菌株 | 第54-55页 |
| 3.2.1.2 药物 | 第55页 |
| 3.2.1.3 培养基 | 第55页 |
| 3.2.1.4 主要试剂 | 第55页 |
| 3.2.1.5 主要溶液的配制 | 第55-57页 |
| 3.2.1.6 主要仪器与设备 | 第57-58页 |
| 3.2.2 方法 | 第58-72页 |
| 3.2.2.1 aac(6’)-Ib-cr和/或oqx AB阳性菌株中ESBLs基因的流行情况 | 第58-60页 |
| 3.2.2.2 脉冲场凝胶电泳（PFGE） | 第60-62页 |
| 3.2.2.3 aac(6’)-Ib-cr和/或oqx AB和ESBLs基因的转移与转化 | 第62-65页 |
| 3.2.2.4 接合子/转化子质粒复制子分型 | 第65-68页 |
| 3.2.2.5 S1-PFGE | 第68-69页 |
| 3.2.2.6 Southern杂交 | 第69-72页 |
| 3.3 结果与分析 | 第72-80页 |
| 3.3.1 aac(6’)-Ib-cr和/或oqx AB阳性菌株中ESBLs基因检测结果 | 第72-73页 |
| 3.3.2 aac(6’)-Ib-cr和/或oqx AB和ESBLs基因阳性菌株的PFGE分型结果 | 第73-76页 |
| 3.3.3 接合转移/电击转化 | 第76-80页 |
| 3.3.3.1 筛选接合子和转化子的药物浓度 | 第76页 |
| 3.3.3.2 接合子/电转子筛选结果 | 第76页 |
| 3.3.3.3 接合子/电转子的MIC结果 | 第76-79页 |
| 3.3.3.4 接合子/转化子的质粒分析 | 第79-80页 |
| 3.4 讨论 | 第80-83页 |
| 3.4.1 aac(6’)-Ib-cr和/或oqx AB阳性菌株中ESBLs流行情况分析 | 第80-81页 |
| 3.4.2 aac(6’)-Ib-cr和/或oqx AB和ESBLs基因阳性菌株的PFGE分型结果分析 | 第81页 |
| 3.4.3 aac(6’)-Ib-cr和/或oqx AB和blaCTX-M接合子/电转子质粒特征 | 第81-83页 |
| 3.5 小结 | 第83-85页 |
| 第4章 aac(6’)-Ib-cr基因在氟喹诺酮类药物耐药发展中的作用 | 第85-110页 |
| 4.1 引言 | 第85页 |
| 4.2 材料与方法 | 第85-94页 |
| 4.2.1 材料 | 第85-86页 |
| 4.2.1.1 菌株 | 第85-86页 |
| 4.2.1.2 药物 | 第86页 |
| 4.2.1.3 培养基 | 第86页 |
| 4.2.1.4 主要试剂 | 第86页 |
| 4.2.1.5 主要仪器 | 第86页 |
| 4.2.2 方法 | 第86-94页 |
| 4.2.2.1 aac(6’)-Ib-cr基因的克隆 | 第86-90页 |
| 4.2.2.2 aac(6’)-Ib-cr重组质粒的电击转化 | 第90-91页 |
| 4.2.2.3 测定转化子的MIC及MPC | 第91页 |
| 4.2.2.4 生长曲线和竞争曲线的测定 | 第91-92页 |
| 4.2.2.5 生物膜形成实验 | 第92-93页 |
| 4.2.2.6 体外筛选耐药菌株 | 第93页 |
| 4.2.2.7 获得aac(6’)-Ib-cr对外排泵缺失株的影响初探 | 第93-94页 |
| 4.3 结果与分析 | 第94-104页 |
| 4.3.1 aac(6’)-Ib-cr基因的克隆 | 第94-95页 |
| 4.3.2 MIC及MPC结果 | 第95-96页 |
| 4.3.3 生长曲线和竞争曲线结果 | 第96-104页 |
| 4.3.3.4. 生物被膜形成能力分析 | 第98页 |
| 4.3.3.5 诱导耐药结果 | 第98-100页 |
| 4.3.3.6. aac(6’)-Ib-cr对外排泵的影响 | 第100-104页 |
| 4.4 讨论 | 第104-108页 |
| 4.4.1 aac(6’)-Ib-cr对MIC，MPC的影响 | 第104-105页 |
| 4.4.2 aac(6’)-Ib-cr对菌株适应性的影响 | 第105页 |
| 4.4.3 aac(6’)-Ib-cr对菌株生物被膜的影响 | 第105-106页 |
| 4.4.4 aac(6’)-Ib-cr基因对菌株耐药发展过程中的靶位突变和外排泵表达的影响 | 第106-108页 |
| 4.5 小结 | 第108-110页 |
| 第5章 blaCTX-M-27质粒的测序以及aac(6’)-Ib-cr对质粒的影响初探 | 第110-127页 |
| 5.1 引言 | 第110页 |
| 5.2 材料与方法 | 第110-112页 |
| 5.2.1 材料 | 第110页 |
| 5.2.2 方法 | 第110-112页 |
| 5.2.2.1 质粒DNA的提取 | 第110页 |
| 5.2.2.2 质粒全基因组测序 | 第110-111页 |
| 5.2.2.3 aac(6’)-Ib-cr对CTX-M质粒的影响 | 第111-112页 |
| 5.3 结果与分析 | 第112-124页 |
| 5.3.1 质粒测序结果 | 第112页 |
| 5.3.2 p SC15序列特征分析 | 第112-119页 |
| 5.3.2.1 p SC15全序列blast结果 | 第112-114页 |
| 5.3.2.2 p SC15的ORFs查找 | 第114页 |
| 5.3.2.3 序列的注释 | 第114-119页 |
| 5.3.3 质粒特征分析 | 第119-121页 |
| 5.3.3.1 p SC15质粒全图 | 第119-120页 |
| 5.3.3.2 p SC15与相似质粒全序列的比较 | 第120-121页 |
| 5.3.4 aac(6’)-Ib-cr对p SC15质粒的影响 | 第121-124页 |
| 5.3.4.1 MIC结果 | 第121-122页 |
| 5.3.4.2 生长曲线 | 第122-123页 |
| 5.3.4.3 竞争曲线 | 第123-124页 |
| 5.4 讨论 | 第124-125页 |
| 5.4.1 p SC15质粒特性 | 第124-125页 |
| 5.4.2 aac(6’)-Ib-cr对CTX-M质粒的影响 | 第125页 |
| 5.5 小结 | 第125-127页 |
| 第6章 全文讨论与结论 | 第127-130页 |
| 6.1 全文讨论与结论 | 第127-128页 |
| 6.2 本研究创新点 | 第128-130页 |
| 致谢 | 第130-131页 |
| 参考文献 | 第131-145页 |
| 附录 | 第145-146页 |
