| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 缩略语表 | 第14-16页 |
| 1. 引言 | 第16-29页 |
| 1.1 山羊产业发展概况 | 第16-17页 |
| 1.2 肉品质的研究 | 第17-19页 |
| 1.2.1 畜肉品质研究现状 | 第17页 |
| 1.2.2 肉品质差异的研究 | 第17-19页 |
| 1.2.3 影响山羊肉质候选基因的研究 | 第19页 |
| 1.3 骨骼肌及肌纤维概述 | 第19-23页 |
| 1.3.1 骨骼肌概述 | 第19-20页 |
| 1.3.2 肌纤维概述 | 第20-23页 |
| 1.4 转录组学研究 | 第23-26页 |
| 1.4.1 转录组学概况 | 第23-24页 |
| 1.4.2 转录组的基本方法 | 第24页 |
| 1.4.3 转录组的原理 | 第24-25页 |
| 1.4.4 生物信息学分析 | 第25页 |
| 1.4.5 RNA-Seq的应用 | 第25-26页 |
| 1.5 蛋白质组学研究 | 第26-29页 |
| 1.5.1 蛋白质组学 | 第26页 |
| 1.5.2 蛋白质组学研究技术 | 第26-29页 |
| 1.6.研究内容 | 第29页 |
| 2 实验一内蒙古绒山羊肌肉理化差异研究 | 第29-36页 |
| 2.1 材料与方法 | 第30页 |
| 2.1.1 材料 | 第30页 |
| 2.1.2 方法 | 第30页 |
| 2.1.3 仪器 | 第30页 |
| 2.2 结果与讨论 | 第30-35页 |
| 2.2.1 初水分、粗脂肪、粗蛋白和灰分的测定结果 | 第30页 |
| 2.2.2 肌内脂肪含量的测定结果 | 第30-31页 |
| 2.2.3 氨基酸测定结果 | 第31-32页 |
| 2.2.4 脂肪酸测定结果 | 第32-34页 |
| 2.2.5 讨论 | 第34-35页 |
| 2.3 小结 | 第35-36页 |
| 3 实验二内蒙古绒山羊不同骨骼肌肌肉组织的转录组分析 | 第36-77页 |
| 3.1 材料 | 第36页 |
| 3.1.1 样本 | 第36页 |
| 3.1.2 试剂 | 第36页 |
| 3.1.3 仪器 | 第36页 |
| 3.2 试验方法 | 第36-40页 |
| 3.2.1 样品RNA的提取及质量检测 | 第36-37页 |
| 3.2.2 cDNA文库的制备 | 第37-38页 |
| 3.2.3 RNA-Seq文库测序 | 第38页 |
| 3.2.4 比对序列以及转录本的构建和定量 | 第38-39页 |
| 3.2.5 基因差异表达分析 | 第39页 |
| 3.2.6 可变剪接分析 | 第39-40页 |
| 3.3 结果与分析 | 第40-72页 |
| 3.3.1 RNA提取与质量检测 | 第40-41页 |
| 3.3.2 生物信息学分析结果 | 第41-53页 |
| 3.3.3 差异表达分析 | 第53-57页 |
| 3.3.4 基因功能注释 | 第57-60页 |
| 3.3.5 差异表达基因GO富集层次分析 | 第60-63页 |
| 3.3.6 差异表达基因COG注释 | 第63-65页 |
| 3.3.7 差异表达基因KEGG注释 | 第65-70页 |
| 3.3.8 差异表达基因KEGG通路富集分析 | 第70-72页 |
| 3.4 差异表达基因蛋白互作网 | 第72-75页 |
| 3.5 讨论 | 第75-76页 |
| 3.6 小结 | 第76-77页 |
| 4 实验三内蒙古绒山羊不同骨骼肌蛋白质组学及质谱鉴定的研究 | 第77-88页 |
| 4.1 材料试剂与仪器 | 第78-79页 |
| 4.1.1 材料 | 第78页 |
| 4.1.2 试剂 | 第78-79页 |
| 4.2 实验仪器 | 第79页 |
| 4.3 方法 | 第79-84页 |
| 4.3.1 骨骼肌蛋白样品的制备（采用常规的液氮研磨法） | 第79-80页 |
| 4.3.2 蛋白样品纯化 | 第80页 |
| 4.3.3 蛋白浓度测定 | 第80-81页 |
| 4.3.4 一向IEF平衡 | 第81-82页 |
| 4.3.5 二向SDS-PAGE凝胶电泳 | 第82页 |
| 4.3.6 染色 | 第82页 |
| 4.3.7 图像扫描及分析 | 第82-84页 |
| 4.4 结果与分析 | 第84-85页 |
| 4.4.1 双向电泳图谱结果 | 第84页 |
| 4.4.2 山羊骨骼肌肌肉组织蛋白质谱分析 | 第84-85页 |
| 4.5 讨论 | 第85-87页 |
| 4.5.1 山羊骨骼肌差异蛋白功能 | 第85-86页 |
| 4.5.2 肌纤维结构相关差异表达蛋白 | 第86-87页 |
| 4.5.3 相同蛋白质不同分子量 | 第87页 |
| 4.6 小结 | 第87-88页 |
| 5 实验四内蒙古绒山羊肌肉差异基因的表达验证 | 第88-94页 |
| 5.1 材料与方法 | 第88-90页 |
| 5.1.1 试验动物及组织 | 第88页 |
| 5.1.2 主要仪器及试剂 | 第88页 |
| 5.1.3 PCR引物和探针的设计与合成 | 第88-89页 |
| 5.1.4 肌肉组织总RNA的提取 | 第89页 |
| 5.1.5 RNA质量检测 | 第89-90页 |
| 5.1.6 绒山羊肉质相关基因及部分关键基因的实时定量检测 | 第90页 |
| 5.1.7 荧光定量PCR | 第90页 |
| 5.2 试验结果 | 第90-94页 |
| 5.2.1 RNA提取凝胶电泳检测 | 第90-92页 |
| 5.2.2 绒山羊不同部位肉质关键基因mRNA的表达变化 | 第92-94页 |
| 5.3 小结 | 第94页 |
| 6 结论 | 第94-96页 |
| 致谢 | 第96-97页 |
| 参考文献 | 第97-105页 |
| 作者简介 | 第105页 |
