缩写词 | 第9-11页 |
氨基酸简写符号 | 第11-12页 |
摘要 | 第12-14页 |
Abstract | 第14页 |
前言 | 第17-19页 |
1 文献综述 | 第19-41页 |
1.1 十字花科植物系统分类和雄性不育的研究 | 第19-21页 |
1.1.1 十字花科植物进化研究进展 | 第19-20页 |
1.1.2 十字花科植物雄性不育研究 | 第20-21页 |
1.2 核酸分析技术与植物系统进化分析 | 第21-28页 |
1.2.1 PCR技术在生物进化研究中的应用 | 第22-23页 |
1.2.2 DNA序列与物种进化关系及其应用研究 | 第23-28页 |
1.2.2.1 DNA序列在植物系统研究中的应用 | 第23-24页 |
1.2.2.2 核基因组 | 第24-26页 |
1.2.2.3 叶绿体基因组 | 第26-28页 |
1.2.3.4 线粒体基因组 | 第28页 |
1.3 分子系统树的构建 | 第28-30页 |
1.3.1 主要方法 | 第28-30页 |
1.3.2 基因树与物种树 | 第30页 |
1.4 生物信息学在序列分析中的应用 | 第30-32页 |
1.5 植物细胞色素P450的研究进展 | 第32-41页 |
1.5.1 P450的鉴定、分离和纯化 | 第33页 |
1.5.2 植物CYP450的功能 | 第33页 |
1.5.3 P450的胞内定位 | 第33-35页 |
1.5.4 植物P450基因的克隆和异源表达 | 第35-36页 |
1.5.5 植物P450基因的表达和调控 | 第36-37页 |
1.5.6 CYP86基因家族成员及功能研究 | 第37-38页 |
1.5.7 CYP86MF基因研究进展 | 第38页 |
1.5.8 植物细胞色素P450研究展望 | 第38-41页 |
2 十字花科植物CYP86MF同源基因序列的分离与克隆 | 第41-49页 |
2.1 材料与方法 | 第41-43页 |
2.1.1 材料 | 第41页 |
2.1.2 DNA的提取 | 第41-43页 |
2.1.3 引物合成和PCR扩增 | 第43页 |
2.1.4 PCR产物的克隆 | 第43页 |
2.1.5 重组质粒的提取和酶切 | 第43页 |
2.1.6 核苷酸序列测定及分析 | 第43页 |
2.2 结果与分析 | 第43-47页 |
2.2.1 CYP86MF同源基因片段的扩增与克隆 | 第43-44页 |
2.2.2 CYP86MF同源基因片段序列分析 | 第44-47页 |
2.3 讨论 | 第47-49页 |
2.2.1 CYP6MF同源基因片段的获得 | 第47-48页 |
2.2.2 CYP86MF同源基因功能预测及其应用 | 第48-49页 |
3 大白菜BCCYP86MF5 cDNA全长的克隆及序列特征分析 | 第49-67页 |
3.1 材料与方法 | 第49-53页 |
3.1.1 植物材料和主要试剂 | 第49-50页 |
3.1.2 RNA的分离及检测 | 第50页 |
3.1.3 cDNA的合成 | 第50-51页 |
3.1.3.1 第一链cDNA的合成 | 第50-51页 |
3.1.3.2 cDNA的LD-PCR扩增 | 第51页 |
3.1.4 Northern印迹分析 | 第51-53页 |
3.1.4.1 转膜 | 第51-52页 |
3.1.4.2 探针标记 | 第52-53页 |
3.1.4.3 杂交 | 第53页 |
3.1.5 RACE技术扩增基因全长 | 第53页 |
3.2 结果与分析 | 第53-65页 |
3.2.1 总RNA的提取和cDNA的合成 | 第53页 |
3.2.2 BCCYP86MF5特异片段的获得 | 第53-56页 |
3.2.3 BCCYP86MF5的cDNA的3’末端的获得 | 第56-57页 |
3.2.4 BCCYP86MF5的cDNA的5’末端的获得 | 第57-59页 |
3.2.5 BCCYP86MF5基因的相似性分析 | 第59页 |
3.2.6 BCCYP86MF5基因的基本特征分析 | 第59页 |
3.2.7 编码蛋白的二级结构预测及亲疏水性分析 | 第59-63页 |
3.2.8 BCCYP86MF5的cDNA和DNA全长PCR扩增 | 第63-65页 |
3.2.9 BCCYP86MF5基因在不同部位的表达特征分析 | 第65页 |
3.3 讨论 | 第65-67页 |
3.3.1 BCCYP86MF5基因全长特征 | 第65-66页 |
3.3.2 BCCYP86MF5基因结构特征 | 第66-67页 |
4 萝卜RSCYP86MF cDNA全长的克隆及序列分析 | 第67-81页 |
4.1 材料与方法 | 第67-68页 |
4.1.1 植物材料和主要试剂 | 第67页 |
4.1.2 RSCYP86MF cDNA特异片段和5’/3’RACE的PCR扩增 | 第67-68页 |
4.1.3 PCR产物的克隆与鉴定 | 第68页 |
4.1.4 序列分析 | 第68页 |
4.2 结果与分析 | 第68-79页 |
4.2.1 RSCYP86MF特异片段的扩增 | 第68-70页 |
4.2.2 RSCYP86MF的cDNA的3’末端的获得 | 第70-71页 |
4.2.3 RSCYP86MF的cDNA的5’末端的获得 | 第71-73页 |
4.2.4 RSCYP86MF基因cDNA和DNA全长序列的PCR扩增 | 第73-74页 |
4.2.5 RSCYP86MF基因的基本特征 | 第74-75页 |
4.2.6 推测的氨基酸序列同源性比较 | 第75-78页 |
4.2.7 编码蛋白质的二级结构预测及亲疏水性分析 | 第78页 |
4.2.8 RSCYP86MF基因在植物不同组织中的表达 | 第78-79页 |
4.3 讨论 | 第79-81页 |
4.3.1 RSCYP86MF基因特征 | 第79页 |
4.3.2 RSCYP86MF基因结构和功能预测分析 | 第79-81页 |
5 诸葛菜OVCYP86MF基因cDNA全长的克隆及序列分析 | 第81-97页 |
5.1 材料与方法 | 第81-82页 |
5.2 结果与分析 | 第82-93页 |
5.2.1 OVCYP86MF特异片段的扩增 | 第82-83页 |
5.2.2 OVCYP86MF基因5’RACE扩增 | 第83-84页 |
5.2.3 OVCYP86MF基因3’RACE扩增 | 第84-85页 |
5.2.4 cDNA基因全长特征分析 | 第85-87页 |
5.2.5 OVCYP86MF基因二级结构预测和亲疏性分析 | 第87页 |
5.2.6 OVCYP86MF基因相似性分析 | 第87-91页 |
5.2.7 OVCYP86MF基因编码蛋白与其他CYP86MF基因编码蛋白的比较分析 | 第91页 |
5.2.8 OVCYP86MF基因的cDNA和DNA全长的PCR扩增 | 第91-93页 |
5.2.9 OVCYP86MF基因的表达分析 | 第93页 |
5.3 讨论 | 第93-97页 |
5.3.1 OVCYP86MF基因全长特征 | 第93-94页 |
5.3.2 OVCYP86MF基因的结构特征比较 | 第94页 |
5.3.3 三个基因功能预测及应用 | 第94-97页 |
6 BCCYP86MF1和RSCYP86MF基因的原核表达 | 第97-103页 |
6.1 材料与方法 | 第97-99页 |
6.1.1 菌株与质粒 | 第97页 |
6.1.2 生化试剂 | 第97页 |
6.1.3 大肠杆菌融合表达载体的构建 | 第97-98页 |
6.1.4 BCCYP86MF1和RSCYP86MF基因在大肠杆菌中的诱导表达 | 第98页 |
6.1.5 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)检测 | 第98-99页 |
6.2 结果与分析 | 第99-100页 |
6.2.1 重组表达载体的构建和酶切验证 | 第99-100页 |
6.2.2 BCCYP86MF1和RSCYP86MF基因表达产物的SDS-PAGE分析 | 第100页 |
6.3 讨论 | 第100-103页 |
7 十字花科植物CYP86MF同源基因系统进化分析 | 第103-117页 |
7.1 分析方法 | 第103-104页 |
7.1.1 序列差异分析 | 第103-104页 |
7.1.2 系统树的构建 | 第104页 |
7.2 结果与分析 | 第104-113页 |
7.2.1 十字花科植物CYP86MF同源基因序列的差异分析 | 第104-105页 |
7.2.2 十字花科植物CYP86MF同源基因序列的遗传距离分析 | 第105-106页 |
7.2.3 十字花科植物CYP86MF同源基因序列的演化关系分析 | 第106-108页 |
7.2.4 CYP86MF全长基因与已知基因的氨基酸序列同源性比较 | 第108-109页 |
7.2.5 CYP86MF全长基因的系统演化关系 | 第109-113页 |
7.3 讨论 | 第113-117页 |
7.3.1 CYP6MF同源基因序列的差异比较 | 第113页 |
7.3.2 十字花科植物的系统发育关系 | 第113-117页 |
结论 | 第117-119页 |
参考文献 | 第119-129页 |
博士期间发表的论文及论著 | 第129页 |