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十字花科植物CYP86MF同源基因的结构、功能及进化关系的研究

缩写词第9-11页
氨基酸简写符号第11-12页
摘要第12-14页
Abstract第14页
前言第17-19页
1 文献综述第19-41页
    1.1 十字花科植物系统分类和雄性不育的研究第19-21页
        1.1.1 十字花科植物进化研究进展第19-20页
        1.1.2 十字花科植物雄性不育研究第20-21页
    1.2 核酸分析技术与植物系统进化分析第21-28页
        1.2.1 PCR技术在生物进化研究中的应用第22-23页
        1.2.2 DNA序列与物种进化关系及其应用研究第23-28页
            1.2.2.1 DNA序列在植物系统研究中的应用第23-24页
            1.2.2.2 核基因组第24-26页
            1.2.2.3 叶绿体基因组第26-28页
            1.2.3.4 线粒体基因组第28页
    1.3 分子系统树的构建第28-30页
        1.3.1 主要方法第28-30页
        1.3.2 基因树与物种树第30页
    1.4 生物信息学在序列分析中的应用第30-32页
    1.5 植物细胞色素P450的研究进展第32-41页
        1.5.1 P450的鉴定、分离和纯化第33页
        1.5.2 植物CYP450的功能第33页
        1.5.3 P450的胞内定位第33-35页
        1.5.4 植物P450基因的克隆和异源表达第35-36页
        1.5.5 植物P450基因的表达和调控第36-37页
        1.5.6 CYP86基因家族成员及功能研究第37-38页
        1.5.7 CYP86MF基因研究进展第38页
        1.5.8 植物细胞色素P450研究展望第38-41页
2 十字花科植物CYP86MF同源基因序列的分离与克隆第41-49页
    2.1 材料与方法第41-43页
        2.1.1 材料第41页
        2.1.2 DNA的提取第41-43页
        2.1.3 引物合成和PCR扩增第43页
        2.1.4 PCR产物的克隆第43页
        2.1.5 重组质粒的提取和酶切第43页
        2.1.6 核苷酸序列测定及分析第43页
    2.2 结果与分析第43-47页
        2.2.1 CYP86MF同源基因片段的扩增与克隆第43-44页
        2.2.2 CYP86MF同源基因片段序列分析第44-47页
    2.3 讨论第47-49页
        2.2.1 CYP6MF同源基因片段的获得第47-48页
        2.2.2 CYP86MF同源基因功能预测及其应用第48-49页
3 大白菜BCCYP86MF5 cDNA全长的克隆及序列特征分析第49-67页
    3.1 材料与方法第49-53页
        3.1.1 植物材料和主要试剂第49-50页
        3.1.2 RNA的分离及检测第50页
        3.1.3 cDNA的合成第50-51页
            3.1.3.1 第一链cDNA的合成第50-51页
            3.1.3.2 cDNA的LD-PCR扩增第51页
        3.1.4 Northern印迹分析第51-53页
            3.1.4.1 转膜第51-52页
            3.1.4.2 探针标记第52-53页
            3.1.4.3 杂交第53页
        3.1.5 RACE技术扩增基因全长第53页
    3.2 结果与分析第53-65页
        3.2.1 总RNA的提取和cDNA的合成第53页
        3.2.2 BCCYP86MF5特异片段的获得第53-56页
        3.2.3 BCCYP86MF5的cDNA的3’末端的获得第56-57页
        3.2.4 BCCYP86MF5的cDNA的5’末端的获得第57-59页
        3.2.5 BCCYP86MF5基因的相似性分析第59页
        3.2.6 BCCYP86MF5基因的基本特征分析第59页
        3.2.7 编码蛋白的二级结构预测及亲疏水性分析第59-63页
        3.2.8 BCCYP86MF5的cDNA和DNA全长PCR扩增第63-65页
        3.2.9 BCCYP86MF5基因在不同部位的表达特征分析第65页
    3.3 讨论第65-67页
        3.3.1 BCCYP86MF5基因全长特征第65-66页
        3.3.2 BCCYP86MF5基因结构特征第66-67页
4 萝卜RSCYP86MF cDNA全长的克隆及序列分析第67-81页
    4.1 材料与方法第67-68页
        4.1.1 植物材料和主要试剂第67页
        4.1.2 RSCYP86MF cDNA特异片段和5’/3’RACE的PCR扩增第67-68页
        4.1.3 PCR产物的克隆与鉴定第68页
        4.1.4 序列分析第68页
    4.2 结果与分析第68-79页
        4.2.1 RSCYP86MF特异片段的扩增第68-70页
        4.2.2 RSCYP86MF的cDNA的3’末端的获得第70-71页
        4.2.3 RSCYP86MF的cDNA的5’末端的获得第71-73页
        4.2.4 RSCYP86MF基因cDNA和DNA全长序列的PCR扩增第73-74页
        4.2.5 RSCYP86MF基因的基本特征第74-75页
        4.2.6 推测的氨基酸序列同源性比较第75-78页
        4.2.7 编码蛋白质的二级结构预测及亲疏水性分析第78页
        4.2.8 RSCYP86MF基因在植物不同组织中的表达第78-79页
    4.3 讨论第79-81页
        4.3.1 RSCYP86MF基因特征第79页
        4.3.2 RSCYP86MF基因结构和功能预测分析第79-81页
5 诸葛菜OVCYP86MF基因cDNA全长的克隆及序列分析第81-97页
    5.1 材料与方法第81-82页
    5.2 结果与分析第82-93页
        5.2.1 OVCYP86MF特异片段的扩增第82-83页
        5.2.2 OVCYP86MF基因5’RACE扩增第83-84页
        5.2.3 OVCYP86MF基因3’RACE扩增第84-85页
        5.2.4 cDNA基因全长特征分析第85-87页
        5.2.5 OVCYP86MF基因二级结构预测和亲疏性分析第87页
        5.2.6 OVCYP86MF基因相似性分析第87-91页
        5.2.7 OVCYP86MF基因编码蛋白与其他CYP86MF基因编码蛋白的比较分析第91页
        5.2.8 OVCYP86MF基因的cDNA和DNA全长的PCR扩增第91-93页
        5.2.9 OVCYP86MF基因的表达分析第93页
    5.3 讨论第93-97页
        5.3.1 OVCYP86MF基因全长特征第93-94页
        5.3.2 OVCYP86MF基因的结构特征比较第94页
        5.3.3 三个基因功能预测及应用第94-97页
6 BCCYP86MF1和RSCYP86MF基因的原核表达第97-103页
    6.1 材料与方法第97-99页
        6.1.1 菌株与质粒第97页
        6.1.2 生化试剂第97页
        6.1.3 大肠杆菌融合表达载体的构建第97-98页
        6.1.4 BCCYP86MF1和RSCYP86MF基因在大肠杆菌中的诱导表达第98页
        6.1.5 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)检测第98-99页
    6.2 结果与分析第99-100页
        6.2.1 重组表达载体的构建和酶切验证第99-100页
        6.2.2 BCCYP86MF1和RSCYP86MF基因表达产物的SDS-PAGE分析第100页
    6.3 讨论第100-103页
7 十字花科植物CYP86MF同源基因系统进化分析第103-117页
    7.1 分析方法第103-104页
        7.1.1 序列差异分析第103-104页
        7.1.2 系统树的构建第104页
    7.2 结果与分析第104-113页
        7.2.1 十字花科植物CYP86MF同源基因序列的差异分析第104-105页
        7.2.2 十字花科植物CYP86MF同源基因序列的遗传距离分析第105-106页
        7.2.3 十字花科植物CYP86MF同源基因序列的演化关系分析第106-108页
        7.2.4 CYP86MF全长基因与已知基因的氨基酸序列同源性比较第108-109页
        7.2.5 CYP86MF全长基因的系统演化关系第109-113页
    7.3 讨论第113-117页
        7.3.1 CYP6MF同源基因序列的差异比较第113页
        7.3.2 十字花科植物的系统发育关系第113-117页
结论第117-119页
参考文献第119-129页
博士期间发表的论文及论著第129页

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