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斜纹夜蛾SlAtg1的克隆表达与功能初步分析

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
第一部分 前言第14-25页
    1.1 细胞自噬概念第14-16页
        1.1.1 细胞自噬的分类和特征第14-16页
    1.2 细胞自噬的发生过程及其分子机制第16-22页
        1.2.1 自噬的诱导及其调控第16-18页
        1.2.2 自噬溶酶体形成及其调控第18-21页
        1.2.3 自噬体的降解及重复利用第21-22页
    1.3 自噬相关基因第22-24页
        1.3.1 ATG1的功能第22-23页
        1.3.2 其他自噬相关基因第23-24页
    1.4 本课题研究目的与意义第24-25页
第二部分 实验材料第25-33页
    2.1 细胞系和细胞培养基第25页
    2.2 质粒和菌株第25页
    2.3 实验动物第25页
        2.3.1 斜纹夜蛾第25页
        2.3.2 小鼠第25页
        2.3.3 兔子第25页
    2.4 主要实验药品与试剂第25-26页
    2.5 常用溶液及其配制第26-30页
        2.5.1 PBS(磷酸盐缓冲液)第26-27页
        2.5.2 PUCKS'液第27页
        2.5.3 昆虫生理盐水IBSS第27页
        2.5.4 1O×TBE第27页
        2.5.5 卡那霉素(Kanamycin)与氨苄青霉素(Ampicillin)第27页
        2.5.6 碱裂解法提取质粒DNA所用溶液第27页
        2.5.7 SDS-PAGE凝胶电泳所用溶液第27-28页
        2.5.8 蛋白免疫印迹(Western Blot)相关的溶液第28-29页
        2.5.9 SDS-PAGE凝胶及Tricine-PAGE 凝胶的配制第29页
        2.5.10 转染用无血清Grace's第29-30页
    2.6 常用培养基的配制第30-31页
        2.6.1 昆虫Grace's Insect Cell Culture Medium(1L)第30页
        2.6.2 液体LB培养基第30-31页
        2.6.3 固体LB培养基第31页
        2.6.4 斜纹夜蛾幼虫人工饲料的配制第31页
    2.7 主要实验仪器与型号第31-33页
第三部分 实验方法第33-46页
    3.1 细胞总RNA的提取第33页
    3.2 SlAtg1保守区的扩增第33-34页
        3.2.1 基因组DNA的去除第33-34页
        3.2.2 cDNA的合成第34页
        3.2.3 SlAtg1的克隆第34页
    3.3 SlAtg1的基因序列分析第34-35页
    3.4 SlAtg1表达质粒的构建第35-36页
        3.4.1 pET28a-Atg1-上600bp和pET28a-Atg1-下500bp的构建第35页
        3.4.2 SlAtg1的真核表达质粒的构建第35-36页
    3.5 SlAtg1的表达、蛋白纯化及抗体制备第36-37页
        3.5.1 Atg1上半段600bp以及下半段500bp的原核表达和纯化第36-37页
        3.5.2 SlAtg1小鼠及兔多克隆抗体的制备第37页
    3.6 脂质体转染细胞第37页
    3.7 免疫荧光检测SlAtg1在Sl-HP细胞中的定位第37-38页
    3.8 免疫荧光检测SlAtg1与Atg5、Atg6和Atg8在Sl-HP细胞中的共定位第38页
    3.9 SlAtg1干扰片段的克隆第38-41页
        3.9.1 SlAtg1基因RNA干扰片段选取第38-40页
        3.9.2 SlAtg1干扰片段的扩增第40-41页
        3.9.3 dsRNA的合成第41页
    3.10 氯化锂法提取质粒第41页
    3.11 实时荧光定量PCR反应第41-43页
    3.13 Western blot第43-44页
    3.14 免疫共沉淀法第44-45页
    3.15 细胞自噬的诱导和抑制第45-46页
第四部分 实验结果第46-68页
    4.1 SlAtg1基因分段保守区域扩增第46页
    4.2 SlAtg1基因保守区域扩增第46-47页
    4.3 SlAtg1生物信息学分析第47-50页
        4.3.1 SlAtg1系统进化树第47-48页
        4.3.2 SlAtg1保守区分析第48-49页
        4.3.3 SlAtg1蛋白的三级结构第49-50页
    4.4 目的基因SlAtg1蛋白的原核表达和多克隆鼠抗和兔抗的制备第50-52页
    4.5 SlAtg1蛋白在Sl-HP细胞中的定位第52-53页
    4.6 Atg1与Atg8、Atg6、Atg5在Sl-HP细胞中的共定位第53-55页
    4.7 Atg1-GFP与Atg1-Flag融合蛋白在Sl-HP中的表达第55-56页
    4.8 细胞自噬抑制剂处理对Sl-HP细胞外源Atg1含量的影响第56页
    4.9 饥饿处理对S1-HP细胞外源Atg1含量的影响第56-57页
    4.10 SlAtg1丰度的变化对细胞自噬的影响第57-63页
        4.10.1 SlAtg1超表达对细胞自噬的影响第57-58页
        4.10.2 斜纹夜蛾细胞SlAtg1干扰片段的扩增和dsRNA的合成第58-59页
        4.10.3 合成的SlAtg1-dsRNA干扰效果的检测第59-60页
        4.10.4 SlAtg1干扰48h后Atg1转录子的相对定量第60-61页
        4.10.5 SlATG1干扰对细胞自噬的影响第61-63页
    4.11 SlAtg1与Atg5相互作用的研究第63-68页
        4.11.1 SlAtg1与Atg5在TnH5细胞中的共定位第63-65页
        4.11.2 Co-IP技术探究Atg1与其他自噬相关蛋白的相互作用第65-66页
        4.11.3 Atg1与Atg5共表达对细胞自噬的影响第66-68页
第五部分 讨论第68-71页
    5.1 SlAtg1在不同物种中具有不同的特性第68页
    5.2 自噬相关基因SlAtg1的功能研究第68-70页
        5.2.1 自噬诱导因子对SlAtg1基因表达的影响第68-69页
        5.2.2 SlAtg1在自噬体成熟过程中的作用第69页
        5.2.3 SlAtg1相互作用蛋白的鉴定第69-70页
    5.3 全文总结第70-71页
本论文的创新之处第71-72页
参考文献第72-76页
硕士期间合作发表论文第76-77页
致谢第77页

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