| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 第一章 绪论 | 第7-16页 |
| 1.1 引言 | 第7页 |
| 1.2 蛋白质的折叠 | 第7-11页 |
| 1.3 分子动力学模拟 | 第11-14页 |
| 1.4 蛋白质折叠的几个最近进展 | 第14-15页 |
| 1.5 本研究的内容、目的和意义 | 第15-16页 |
| 第二章 方法 | 第16-22页 |
| 2.1 Gomodel和修正后的Gomodel | 第16-17页 |
| 2.2 Φ-value的定义 | 第17-18页 |
| 2.3 变温模拟抽样 | 第18-22页 |
| 第三章 过渡态系综结果分析 | 第22-40页 |
| 3.1 Im9家族结构同源蛋白 | 第22-32页 |
| 3.1.1 Im9家族同源蛋白过渡态系综Φ-value结果分析 | 第24-32页 |
| 3.1.1.1 Im9过渡态系综结果分析 | 第26-27页 |
| 3.1.1.2 Im9(H3A)过渡态系综结果分析 | 第27-29页 |
| 3.1.1.3 Im9(E41A)过渡态系综结果分析 | 第29-30页 |
| 3.1.1.4 Im9(D49A)过渡态系综结果分析 | 第30-31页 |
| 3.1.1.5 Im9(R75A)过渡态系综结果分析 | 第31-32页 |
| 3.2 Im7序列同源蛋白 | 第32-40页 |
| 3.2.1 Im7家族同源蛋白过渡态系综Φ-value结果分析 | 第33-40页 |
| 3.2.1.1 Im7(pdb：1ayi)过渡态系综结果分析 | 第35-36页 |
| 3.2.1.2 Im7(pdb：1cei)过渡态系综结果分析 | 第36-37页 |
| 3.2.1.3 Im7(pdb：1ujz)过渡态系综结果分析 | 第37-39页 |
| 3.2.1.4 Im7(pdb：1unk)过渡态系综结果分析 | 第39-40页 |
| 第四章 过渡态系综结果讨论 | 第40-47页 |
| 4.1 Im9家族同源蛋白结果讨论 | 第40-43页 |
| 4.2 Im7家族同源蛋白结果讨论 | 第43-47页 |
| 第五章 总结 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-51页 |
| 致谢 | 第51-52页 |
