| 摘要 | 第12-14页 |
| Abstrct | 第14-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-27页 |
| 1.1 果色的主要决定成分 | 第16-18页 |
| 1.1.1 花青苷 | 第16-17页 |
| 1.1.2 类胡萝卜素 | 第17页 |
| 1.1.3 甜菜素 | 第17-18页 |
| 1.1.4 叶绿素 | 第18页 |
| 1.2 花青苷生物合成途径 | 第18-19页 |
| 1.3 花青苷合成代谢的调控机制 | 第19-23页 |
| 1.3.1 花青苷途径中的结构基因 | 第19-21页 |
| 1.3.2 花青苷途径中的转录调控基因 | 第21-23页 |
| 1.3.2.1 MYB转录因子 | 第21-22页 |
| 1.3.2.2 bHLH转录因子 | 第22-23页 |
| 1.3.2.3 WD40转录因子 | 第23页 |
| 1.4 黄/白浅色表型的研究进展 | 第23-26页 |
| 1.4.1 花卉植物中黄/白表型的研究进展 | 第24页 |
| 1.4.2 果树中黄/白果色性状的研究进展 | 第24页 |
| 1.4.3 草莓中黄/白果色性状的研究进展 | 第24-26页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第26-27页 |
| 第二章 森林草莓F3H基因的表达特性、序列特征和功能分析 | 第27-47页 |
| 2.1 材料与方法 | 第27-36页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第27页 |
| 2.1.2 菌株及载体 | 第27-28页 |
| 2.1.3 花色素苷组分含量测定 | 第28-29页 |
| 2.1.4 草莓果实总RNA提取 | 第29-30页 |
| 2.1.5 RNA的质量及纯度检测 | 第30页 |
| 2.1.6 cDNA合成 | 第30页 |
| 2.1.7 PCR扩增 | 第30页 |
| 2.1.8 PCR特异片段产物回收 | 第30页 |
| 2.1.9 目的片段连接T载体 | 第30-31页 |
| 2.1.10 重组质粒转化大肠杆菌 | 第31页 |
| 2.1.11 重组质粒的PCR鉴定 | 第31页 |
| 2.1.12 重组质粒提取 | 第31-32页 |
| 2.1.13 F3H基因序列分析 | 第32页 |
| 2.1.14 FvF3H过量表达载体构建 | 第32-33页 |
| 2.1.15 农杆菌感受态制备 | 第33-34页 |
| 2.1.16 载体导入农杆菌 | 第34页 |
| 2.1.17 草莓遗传转化 | 第34-35页 |
| 2.1.18 转化株系PCR鉴定 | 第35-36页 |
| 2.1.19 FvF3H基因的qRT-PCR表达检测 | 第36页 |
| 2.2 结果与分析 | 第36-44页 |
| 2.2.1 YW与RG果实花青苷含量比较 | 第36-37页 |
| 2.2.2 YW与RG果实花青苷组分含量比较 | 第37-38页 |
| 2.2.3 草莓果实RNA的质量 | 第38-39页 |
| 2.2.4 FvF3H基因在YW和RG间的表达差异 | 第39-40页 |
| 2.2.5 FvF3H基因全长CDS序列的克隆与特征分析 | 第40页 |
| 2.2.6 FvF3H基因在YW中的过量表达与功能分析 | 第40-44页 |
| 2.3 讨论 | 第44-46页 |
| 2.3.1 森林草莓花青苷组分与含量 | 第44-45页 |
| 2.3.2 F3H基因的功能 | 第45-46页 |
| 2.4 小结 | 第46-47页 |
| 第三章 森林草莓'Yellow Wonder'和'Ruegen'果实转录组测序与基因差异表达分析 | 第47-62页 |
| 3.1 材料与方法 | 第47-49页 |
| 3.1.1 植物材料 | 第47页 |
| 3.1.2 草莓果实总RNA提取 | 第47页 |
| 3.1.3 RNA的质量及纯度检测 | 第47页 |
| 3.1.4 转录组高通量测序 | 第47-49页 |
| 3.1.4.1 cDNA文库构建与Illumina测序 | 第47-48页 |
| 3.1.4.2 转录组测序数据组装 | 第48页 |
| 3.1.4.3 Unigene功能注释 | 第48-49页 |
| 3.1.4.4 差异表达分析 | 第49页 |
| 3.1.4.5 生物学重复相关性评估 | 第49页 |
| 3.1.5 差异表达基因的qRT-PCR表达检测 | 第49页 |
| 3.2 结果与分析 | 第49-59页 |
| 3.2.1 转录组测序数据组装 | 第49-51页 |
| 3.2.2 基因功能注释 | 第51-52页 |
| 3.2.3 差异表达分析 | 第52-55页 |
| 3.2.4 生物学重复相关性评价 | 第55页 |
| 3.2.5 qRT-PCR验证差异表达基因 | 第55-57页 |
| 3.2.6 花青苷合成相关基因序列分析 | 第57-59页 |
| 3.3 讨论 | 第59-61页 |
| 3.3.1 YW与RG间差异表达的花青苷合成基因 | 第59页 |
| 3.3.2 YW与RG间差异表达的转录调控因子 | 第59-61页 |
| 3.4 小结 | 第61-62页 |
| 第四章 森林草莓FvMYB10基因SNP位点与黄果表型的关联研究 | 第62-76页 |
| 4.1 材料与方法 | 第62-65页 |
| 4.1.1 植物材料 | 第62页 |
| 4.1.2 森林草莓基因组DNA的提取及DNA混合样本的制备 | 第62页 |
| 4.1.3 InDel分子标记开发与扩增 | 第62页 |
| 4.1.4 连锁分析与图谱构建 | 第62-63页 |
| 4.1.5 比较基因组分析和序列分析 | 第63页 |
| 4.1.6 多序列比对与进化分析 | 第63页 |
| 4.1.7 草莓果实总RNA提取 | 第63页 |
| 4.1.8 RNA的质量及纯度检测 | 第63页 |
| 4.1.9 cDNA合成 | 第63页 |
| 4.1.10 PCR扩增MYB10基因CDS全长序列 | 第63-64页 |
| 4.1.11 PCR特异片段产物回收 | 第64页 |
| 4.1.12 目的片段连接T载体 | 第64页 |
| 4.1.13 重组质粒转化大肠杆菌 | 第64页 |
| 4.1.14 重组质粒的PCR鉴定 | 第64页 |
| 4.1.15 重组质粒提取 | 第64页 |
| 4.1.16 MYB10基因序列分析 | 第64页 |
| 4.1.17 dCAPs引物设计 | 第64-65页 |
| 4.1.18 PCR扩增 | 第65页 |
| 4.1.19 PCR产物的酶切反应 | 第65页 |
| 4.1.20 扩增产物的检测 | 第65页 |
| 4.1.21 FvMYB10的基因表达检测 | 第65页 |
| 4.2 结果与分析 | 第65-73页 |
| 4.2.1 c位点基因的基因图谱构建 | 第65-66页 |
| 4.2.1.1 F_2果色性状分离群体的构建 | 第65页 |
| 4.2.1.2 基因图谱构建 | 第65-66页 |
| 4.2.2 候选基因的确定 | 第66-67页 |
| 4.2.3 MYB10基因全长CDS序列的克隆与特征分析 | 第67-68页 |
| 4.2.4 FvMYB10的SNP变异与果色相关性分析 | 第68-70页 |
| 4.2.5 MYB10的结构分析 | 第70-73页 |
| 4.2.6 FvMYB10的基因表达 | 第73页 |
| 4.3 讨论 | 第73-75页 |
| 4.3.1 MYB10在花青苷合成代谢中的调控作用 | 第73-74页 |
| 4.3.2 MYB基因变异与色泽形成 | 第74-75页 |
| 4.4 小结 | 第75-76页 |
| 第五章 结论及创新点 | 第76-77页 |
| 5.1 结论 | 第76页 |
| 5.2 创新点 | 第76-77页 |
| 参考文献 | 第77-93页 |
| 附录 | 第93-116页 |
| 致谢 | 第116-117页 |
| 攻读学位期间发表文章 | 第117页 |
