摘要 | 第4-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
第1章 绪论 | 第10-18页 |
1.1 无序蛋白质的研究进展 | 第11-15页 |
1.1.1 蛋白质固有无序性的描述 | 第11页 |
1.1.2 无序蛋白质的序列和结构特征 | 第11-12页 |
1.1.3 无序蛋白质的功能 | 第12-13页 |
1.1.4 无序蛋白质的进化特征 | 第13页 |
1.1.5 无序蛋白质的进化产生的生物学效应 | 第13-14页 |
1.1.6 蛋白质无序区域的预测与数据库 | 第14-15页 |
1.2 无序结构域的研究进展 | 第15-16页 |
1.3 本论文的研究内容 | 第16-18页 |
第2章 无序结构域的功能和进化特征分析 | 第18-30页 |
2.1 材料与方法 | 第18-22页 |
2.1.1 数据来源 | 第18页 |
2.1.2 基于IUPred软件预测序列的无序性 | 第18-19页 |
2.1.3 结构域注释 | 第19页 |
2.1.4 结构域无序率(DSDR)的计算 | 第19页 |
2.1.5 DSDR等级 | 第19页 |
2.1.6 结构域无序率的优势类别(DSDR优势类别) | 第19-20页 |
2.1.7 结构域年龄的定义 | 第20-21页 |
2.1.8 结构域功能富集缺失分析 | 第21-22页 |
2.2 结果 | 第22-28页 |
2.2.1 无序结构域的分布特征 | 第22-25页 |
2.2.2 不同DSDR优势类别的结构域进化特征 | 第25-27页 |
2.2.3 不同DSDR优势类别的结构域功能特征 | 第27-28页 |
2.3 小结 | 第28-30页 |
第3章 结构域无序率变异的生物学意义分析 | 第30-44页 |
3.1 材料与方法 | 第30-32页 |
3.1.1 蛋白质结构域重复类别的划分 | 第30页 |
3.1.2 DSDR变异度的计算 | 第30-31页 |
3.1.3 VDSDR优势类别的划分 | 第31-32页 |
3.1.4 序列相似性计算 | 第32页 |
3.2 结果 | 第32-42页 |
3.2.1 各物种结构域的分布 | 第32-33页 |
3.2.2 VDSDR的分布 | 第33-35页 |
3.2.3 蛋白内重复和只在蛋白间重复的DSDR分布 | 第35-37页 |
3.2.4 VDSDR与序列相似性 | 第37-39页 |
3.2.5 VDSDR与氨基酸疏水性 | 第39-40页 |
3.2.6 不同VDSDR优势类别的结构域年龄分布 | 第40-41页 |
3.2.7 不同VDSDR优势类别的结构域功能分析 | 第41页 |
3.2.8 含有不同VDSDR结构域的蛋白质 | 第41-42页 |
3.3 小结 | 第42-44页 |
结论 | 第44-46页 |
参考文献 | 第46-50页 |
攻读硕士期间所发表的学术论文 | 第50-51页 |
致谢 | 第51页 |