宏基因组读段组装融合与基因标注算法研究
| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第11-18页 |
| 1.1 生物信息学概论及现状 | 第11-12页 |
| 1.2 宏基因组学简介 | 第12-15页 |
| 1.3 本文研究意义 | 第15-16页 |
| 1.4 本文构成 | 第16-18页 |
| 第二章 宏基因组分析和基因片段组装 | 第18-26页 |
| 2.1 宏基因组分析流程介绍 | 第18-23页 |
| 2.1.1 环境样品采样和文库构建 | 第18-20页 |
| 2.1.2 读段组装 | 第20-21页 |
| 2.1.3 基因识别 | 第21-22页 |
| 2.1.4 物种多样性分析 | 第22-23页 |
| 2.1.5 功能性注释 | 第23页 |
| 2.2 基因片段组装国内外现状 | 第23-25页 |
| 2.3 本章小结 | 第25-26页 |
| 第三章 宏基因组读段组装融合与网络比对算法 | 第26-42页 |
| 3.1 GTCC算法 | 第26-27页 |
| 3.2 模拟读段的生成及组装软件的调用 | 第27-28页 |
| 3.3 重叠群的融合 | 第28-32页 |
| 3.4 基因序列初步识别 | 第32页 |
| 3.5 网络比对 | 第32-36页 |
| 3.5.1 Smith-Waterman算法简介 | 第32-33页 |
| 3.5.2 网络比对算法 | 第33-36页 |
| 3.6 实验结果分析 | 第36-40页 |
| 3.6.1 实验环境 | 第36页 |
| 3.6.2 实验数据 | 第36-37页 |
| 3.6.3 实验结果评估指标 | 第37-38页 |
| 3.6.4 实验结果分析 | 第38-40页 |
| 3.7 本章小结 | 第40-42页 |
| 第四章 基因序列可视化测试平台 | 第42-52页 |
| 4.1 平台介绍 | 第42-44页 |
| 4.1.1 平台设计背景 | 第42页 |
| 4.1.2 平台总体设计 | 第42-43页 |
| 4.1.3 平台开发环境 | 第43-44页 |
| 4.2 平台相关模块介绍 | 第44-46页 |
| 4.2.1 输入模块 | 第44-45页 |
| 4.2.2 评测模块 | 第45-46页 |
| 4.2.3 结果呈现模块 | 第46页 |
| 4.3 平台展示 | 第46-51页 |
| 4.3.1 平台入.展示 | 第46-47页 |
| 4.3.2 基因片段组装部分展示 | 第47-48页 |
| 4.3.3 基因预测部分展示 | 第48-51页 |
| 4.4 本章小结 | 第51-52页 |
| 第五章 总结和展望 | 第52-54页 |
| 5.1 总结 | 第52-53页 |
| 5.2 展望 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-59页 |
| 致谢 | 第59-60页 |
| 攻读硕士学位期间参与的科研项目 | 第60页 |
