| 摘要 | 第3-5页 |
| ABSTRACT | 第5-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-19页 |
| 1.1 谱系地理学研究概述 | 第10-11页 |
| 1.2 植物谱系地理学常用的分子标记 | 第11-12页 |
| 1.3 植物谱系地理学研究进展 | 第12-14页 |
| 1.4 保护遗传学 | 第14-15页 |
| 1.5 淡黄金花茶植物概述 | 第15-17页 |
| 1.5.1 金花茶植物生态地理分布特征 | 第15页 |
| 1.5.2 淡黄金花茶分类问题 | 第15-17页 |
| 1.5.3 淡黄金花茶研究进展 | 第17页 |
| 1.6 研究目的和意义 | 第17-19页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第19-28页 |
| 2.1 采集样品 | 第19-20页 |
| 2.2 主要试剂、仪器及耗材 | 第20-22页 |
| 2.2.1 主要试剂及来源及配方 | 第20-21页 |
| 2.2.2 主要仪器 | 第21-22页 |
| 2.3 实验方法 | 第22-25页 |
| 2.3.1 基因组DNA的提取 | 第22页 |
| 2.3.2 DNA检测 | 第22-23页 |
| 2.3.3 引物设计 | 第23-24页 |
| 2.3.4 群体扩增及测序 | 第24-25页 |
| 2.4 数据分析 | 第25-28页 |
| 2.4.1 DNA序列整理 | 第25页 |
| 2.4.2 替换饱和度检测 | 第25页 |
| 2.4.3 群体遗传及谱系地理学分析 | 第25-28页 |
| 2.4.3.1 遗传多样性检测 | 第25-26页 |
| 2.4.3.2 单倍型网络图及地理分布 | 第26页 |
| 2.4.3.3 构建单倍型系统发育树 | 第26页 |
| 2.4.3.4 SAMOVA分析 | 第26页 |
| 2.4.3.5 谱系结构分析 | 第26-27页 |
| 2.4.3.6 分子变异方差分析(AMOVA) | 第27页 |
| 2.4.3.7 基因流障碍分析(Barrier to gene flow) | 第27-28页 |
| 第三章 结果与分析 | 第28-45页 |
| 3.1 叶绿体片段分析结果 | 第28-32页 |
| 3.1.1 叶绿体序列特征与单倍型分布 | 第28-29页 |
| 3.1.2 基于叶绿体空间分子方差(SAMOVA)分析结果 | 第29-31页 |
| 3.1.3 叶绿体单倍型网状进化关系及系统发育关系 | 第31-32页 |
| 3.2 单拷贝核基因数据分析结果 | 第32-40页 |
| 3.2.1 核基因序列特征与单倍型分布 | 第32-35页 |
| 3.2.2 基于核基因空间分子方差(SAMOVA)分析结果 | 第35-37页 |
| 3.2.3 核基因单倍型网状进化关系及系统发育关系 | 第37-40页 |
| 3.3 群体遗传结构与遗传分化 | 第40-42页 |
| 3.4 基因流障碍 | 第42-43页 |
| 3.5 淡黄金花茶单倍型多样性和核苷酸多样性 | 第43-45页 |
| 第四章 讨论 | 第45-49页 |
| 4.1 所采集的淡黄金花茶由三个分类群组成 | 第45-46页 |
| 4.2 淡黄金花茶遗传多样性和种群遗传结构 | 第46-48页 |
| 4.3 保护生物学含义 | 第48-49页 |
| 第五章 结论与展望 | 第49-50页 |
| 5.1 结论 | 第49页 |
| 5.2 展望 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-57页 |
| 附录 | 第57-61页 |
| 攻读硕学位期间发表的论文 | 第61-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
