| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 符号对照表 | 第11-12页 |
| 缩略语对照表 | 第12-15页 |
| 第一章 绪论 | 第15-21页 |
| 1.1 研究背景 | 第15-16页 |
| 1.2 研究现状 | 第16-18页 |
| 1.3 研究内容及意义 | 第18-19页 |
| 1.4 章节安排 | 第19-21页 |
| 第二章 基于DC的DNA甲基化与基因表达关系分析方法 | 第21-31页 |
| 2.1 差异DNA甲基化位点和差异表达基因筛选 | 第21-24页 |
| 2.1.1 差异分析方法 | 第21-23页 |
| 2.1.2 SAM法筛选差异表达基因和差异DNA甲基化位点 | 第23-24页 |
| 2.2 DNA甲基化与基因表达关系聚类 | 第24-28页 |
| 2.2.1 AP聚类 | 第24-27页 |
| 2.2.2 基于AP聚类的DNA甲基化与基因表达关系簇 | 第27-28页 |
| 2.3 基于DC的DNA甲基化与基因表达关系分析方法 | 第28-30页 |
| 2.4 本章小结 | 第30-31页 |
| 第三章 全基因组上乳腺癌的DNA甲基化与基因表达关联模式分析 | 第31-47页 |
| 3.1 乳腺癌数据集预处理 | 第31-32页 |
| 3.2 基于DC方法的乳腺癌全基因组数据分析 | 第32-38页 |
| 3.3 乳腺癌的DNA甲基化与基因表达关联模式分析 | 第38-45页 |
| 3.3.1 主要关联模式分析 | 第38-41页 |
| 3.3.2 详细关联模式分析 | 第41-45页 |
| 3.4 本章小结 | 第45-47页 |
| 第四章 关联模式的生物意义解释 | 第47-59页 |
| 4.1 乳腺癌致病基因分析 | 第47-52页 |
| 4.1.1 致病基因分布 | 第47-49页 |
| 4.1.2 致病基因关联模式分析 | 第49-52页 |
| 4.2 pathway富集分析 | 第52-58页 |
| 4.2.1 pathway富集结果 | 第53-55页 |
| 4.2.2 pathway富集分析 | 第55-58页 |
| 4.3 本章小结 | 第58-59页 |
| 第五章 总结和展望 | 第59-61页 |
| 5.1 研究总结 | 第59页 |
| 5.2 研究展望 | 第59-61页 |
| 参考文献 | 第61-67页 |
| 致谢 | 第67-69页 |
| 作者简介 | 第69-70页 |
