| 摘要 | 第5-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 第一章 绪论 | 第17-27页 |
| 1.1 引言 | 第17-24页 |
| 1.1.1 油桐概述 | 第17-18页 |
| 1.1.2 植物枯萎病研究进展 | 第18-21页 |
| 1.1.3 油桐枯萎病的研究进展 | 第21-23页 |
| 1.1.4 转录组测序技术的发展及应用 | 第23-24页 |
| 1.2 研究的目的意义与主要内容 | 第24-26页 |
| 1.2.1 研究的目的意义 | 第24-25页 |
| 1.2.2 研究的主要内容 | 第25-26页 |
| 1.3 研究的技术路线 | 第26-27页 |
| 第二章 三年桐尖孢镰刀菌侵染不同时期的转录组分析 | 第27-48页 |
| 2.1 材料与方法 | 第27-30页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第27页 |
| 2.1.2 主要试剂及仪器 | 第27-28页 |
| 2.1.3 实验方法 | 第28-30页 |
| 2.2 结果与分析 | 第30-45页 |
| 2.2.1 测序数据的拼接 | 第30页 |
| 2.2.2 基于全部转录本及基因的GC含量分析 | 第30-31页 |
| 2.2.3 三年桐转录组数据的分析 | 第31-45页 |
| 2.3 讨论 | 第45-46页 |
| 2.4 小结 | 第46-48页 |
| 第三章 千年桐尖孢镰刀菌侵染不同时期的转录组分析 | 第48-66页 |
| 3.1 材料与方法 | 第48-49页 |
| 3.1.1 植物材料 | 第48页 |
| 3.1.2 主要试剂及仪器 | 第48页 |
| 3.1.3 实验方法 | 第48-49页 |
| 3.2 结果与分析 | 第49-64页 |
| 3.2.1 测序数据的拼接 | 第49页 |
| 3.2.2 基于全部转录本及基因的GC含量分析 | 第49页 |
| 3.2.3 千年桐转录组数据的分析 | 第49-64页 |
| 3.3 讨论 | 第64-65页 |
| 3.4 小结 | 第65-66页 |
| 第四章 尖孢镰刀菌侵染后三年桐、千年桐根部不同时期比较转录组分析 | 第66-83页 |
| 4.1 材料与方法 | 第66-70页 |
| 4.1.1 数据材料 | 第66页 |
| 4.1.2 分析方法 | 第66-70页 |
| 4.2 结果与分析 | 第70-79页 |
| 4.2.1 三年桐、千年桐中直系同源基因的查找 | 第70-71页 |
| 4.2.2 尖孢镰刀菌侵染前后三年桐、千年桐转录组差异表达基因概要分析 | 第71-73页 |
| 4.2.3 尖孢镰刀菌侵染前后三年桐、千年桐表达谱比较分析 | 第73页 |
| 4.2.4 三年桐、千年桐中直系同源基因Ka/Ks分析 | 第73-74页 |
| 4.2.5 尖孢镰刀菌侵染前后三年桐、千年桐差异表达基因相关性及功能富集分析 | 第74-76页 |
| 4.2.6 抗病种千年桐中的基因共表达网络和通路分析 | 第76-78页 |
| 4.2.7 qRT-PCR验证尖孢镰刀菌侵染前后三年桐、千年桐直系同源基因表达谱 | 第78-79页 |
| 4.3 讨论 | 第79-81页 |
| 4.4 小结 | 第81-83页 |
| 第五章 Vf/VmLRR-RLKs基因家族的比较分析 | 第83-101页 |
| 5.1 材料与方法 | 第83-86页 |
| 5.1.1 实验材料： | 第83页 |
| 5.1.2 主要实验试剂及仪器 | 第83页 |
| 5.1.3 分析方法 | 第83-86页 |
| 5.2 结果与分析 | 第86-98页 |
| 5.2.1 Vf/VmLRR-RLKs基因家族成员的鉴别 | 第86-87页 |
| 5.2.2 Vf/VmLRR-RLKs基因家族成员的多序列比对分析、进化树构建 | 第87-91页 |
| 5.2.3 Vf/VmLRR-RLKs基因家族成员的保守基序分析 | 第91页 |
| 5.2.4 Vf/VmLRR-RLKs基因家族成员响应油桐枯萎病的数字化基因表达谱 | 第91-96页 |
| 5.2.5 Vf/VmLRR-RLKs基因家族成员对油桐枯萎病响应的qRT-PCR验证 | 第96-97页 |
| 5.2.6 Vf/VmLRR-RLKs基因家族成员的组织表达特异性 | 第97-98页 |
| 5.3 讨论 | 第98-99页 |
| 5.4 小结 | 第99-101页 |
| 第六章 VfLRR-RLK1对拟南芥的遗传转化 | 第101-118页 |
| 6.1 材料与方法 | 第101-111页 |
| 6.1.1 实验材料 | 第101页 |
| 6.1.2 主要试剂及仪器 | 第101-103页 |
| 6.1.3 实验方法 | 第103-111页 |
| 6.2 结果与分析 | 第111-117页 |
| 6.2.1 VfLRR-RLK1基因克隆 | 第111-112页 |
| 6.2.2 植物表达载体pBI121-VfLRR-RLK1的构建 | 第112-114页 |
| 6.2.3 拟南芥突变体的纯杂合鉴定 | 第114-115页 |
| 6.2.4 VfLRR-RLK1-pBI121对拟南芥纯合突变体的遗传转化 | 第115-117页 |
| 6.3 讨论 | 第117页 |
| 6.4 小结 | 第117-118页 |
| 第七章 结论与展望 | 第118-122页 |
| 7.1 结论 | 第118-121页 |
| 7.2 展望 | 第121-122页 |
| 参考文献 | 第122-127页 |
| 在读期间的学术研究 | 第127-128页 |
| 致谢 | 第128-129页 |
