| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 1 前言 | 第11-20页 |
| 1.1 叶际微生物 | 第11-16页 |
| 1.1.1 叶际微生物群落组成 | 第11-12页 |
| 1.1.2 叶际微生物的特点 | 第12-14页 |
| 1.1.3 叶际微生物与外界的互作 | 第14-16页 |
| 1.1.4 影响叶际微生物种群多样性的因素 | 第16页 |
| 1.2 柑橘溃疡病 | 第16-17页 |
| 1.3 基于免培养法的微生物多样性研究进展 | 第17-19页 |
| 1.4 本论文的研究目的与意义 | 第19-20页 |
| 2 冰糖橙叶表细菌多样性分析 | 第20-39页 |
| 2.1 试验材料 | 第20-21页 |
| 2.1.1 供试材料 | 第20页 |
| 2.1.2 本研究采用的试剂盒及常用试剂 | 第20-21页 |
| 2.1.3 仪器设备 | 第21页 |
| 2.2 试验方法 | 第21-25页 |
| 2.2.1 叶表微生物宏基因组DNA的提取 | 第22-23页 |
| 2.2.2 叶表微生物宏基因组DNA质量检测 | 第23页 |
| 2.2.3 建立文库与测序 | 第23-25页 |
| 2.3 结果与分析 | 第25-36页 |
| 2.3.1 叶表面微生物宏基因组DNA质量检测 | 第25-27页 |
| 2.3.2 叶表细菌的Miseq测序与分析 | 第27-36页 |
| 2.4 讨论 | 第36-39页 |
| 2.4.1 高通量测序及数据处理 | 第36-37页 |
| 2.4.2 叶表细菌物种及其丰度分析 | 第37-39页 |
| 3 柑橘溃疡病菌种群丰度与发病的关联分析 | 第39-48页 |
| 3.1 试验材料 | 第39页 |
| 3.1.1 样品来源 | 第39页 |
| 3.1.2 仪器设备 | 第39页 |
| 3.2 试验方法 | 第39-42页 |
| 3.2.1 柑橘溃疡病的分离和鉴定 | 第39-41页 |
| 3.2.2 溃疡病发病情指数调查 | 第41页 |
| 3.2.3 柑橘溃疡病菌种群丰度的相对定量分析 | 第41-42页 |
| 3.2.4 一些叶表细菌群落与Xanthomonas种群丰度的关联分析 | 第42页 |
| 3.3 结果与分析 | 第42-46页 |
| 3.3.1 菌种分离和保存 | 第42页 |
| 3.3.2 溃疡病的鉴定 | 第42-43页 |
| 3.3.3 溃疡病发病情况调查结果 | 第43-44页 |
| 3.3.4 柑橘溃疡病菌种群丰度的相对定量分析 | 第44-45页 |
| 3.3.5 一些优势属与Xanthomonas种群丰度的关联分析 | 第45-46页 |
| 3.4 讨论 | 第46-48页 |
| 4 全文总结 | 第48-50页 |
| 4.1 主要结论 | 第48-49页 |
| 4.2 创新点 | 第49页 |
| 4.3 展望 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-61页 |
| 致谢 | 第61-62页 |
| 作者简历 | 第62页 |