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番茄抗叶霉病基因Cf-19的精细定位及抗病应答基因筛选

摘要第1-12页
英文摘要第12-15页
1 前言第15-28页
   ·番茄叶霉病及抗病基因研究进展第15-20页
     ·番茄叶霉病发病特点第15-16页
     ·番茄叶霉病病原菌第16-17页
     ·番茄叶霉病抗病基因研究进展第17-19页
     ·番茄与病原菌互作研究进展第19-20页
   ·基因组重测序技术及其应用第20-21页
     ·高通量测序技术第20-21页
     ·高通量测序技术的应用现状第21页
   ·简化基因组测序技术及其应用第21-23页
   ·c DNA-AFLP技术及其应用第23-24页
     ·c DNA-AFLP技术第23-24页
     ·c DNA-AFLP技术的应用现状第24页
   ·病毒诱导基因沉默技术及其应用第24-26页
     ·病毒诱导基因沉默VIGS技术第24-25页
     ·VIGS技术的应用现状第25-26页
   ·研究的目的与意义第26-27页
   ·研究的内容与技术路线第27-28页
     ·研究内容第27页
     ·技术路线第27-28页
2 材料和方法第28-49页
   ·Cf-19基因的抗性范围鉴定第28-29页
     ·实验材料第28页
     ·实验方法第28-29页
   ·Cf-19基因的抗病性特点研究第29-30页
     ·实验材料第29页
     ·实验方法第29-30页
   ·Cf-19基因的遗传规律分析第30页
     ·实验材料第30页
     ·实验方法第30页
   ·SLAF-seq分析第30-34页
     ·实验材料第30页
     ·实验方法第30-34页
   ·父、母本重测序分析第34-35页
     ·实验材料第34页
     ·实验方法第34-35页
     ·重测序数据与SLAF-Seq结果联合分析第35页
   ·候选基因筛选第35-37页
     ·关联区间内基因功能注释第35页
     ·Cf类型基因表达模式分析第35-37页
   ·候选基因位点精确测序及序列分析第37-39页
     ·候选基因位点精确测序第37-39页
     ·候选基因位点序列分析第39页
   ·标记开发及连锁关系分析第39页
   ·c DNA-AFLP分析第39-45页
     ·实验材料第39-40页
     ·实验方法第40-45页
   ·TDFs表达模式分析第45-46页
     ·实验材料第45页
     ·实验方法第45-46页
   ·候选基因及抗病相关基因功能沉默VIGS载体构建第46-48页
     ·基因片段扩增及纯化第46-47页
     ·TRV2载体制备第47-48页
     ·含有目的基因片段的TRV2载体构建第48页
   ·VIGS农杆菌侵染技术体系的建立第48-49页
3 结果与分析第49-73页
   ·Cf-19基因的抗性范围鉴定第49-50页
   ·Cf-19基因的抗性特点研究第50-52页
     ·Cf-19基因与Cf-4、Cf-9 基因介导的过敏性坏死观察第50-51页
     ·Cf-19基因介导的非亲和互作与亲和互作过程观察第51-52页
   ·Cf-19基因的遗传规律研究第52页
   ·Cf-19基因的精细定位第52-66页
     ·SLAF-seq分析与父、母本材料的基因组重测序第52-61页
     ·候选基因表达模式分析第61-63页
     ·候选基因位点测序及序列分析第63-64页
     ·标记开发及连锁分析第64-66页
   ·抗病应答过程中差异表达基因的筛选第66-72页
     ·c DNA-AFLP分析第66-70页
     ·部分转录衍生片段表达模式验证与深入分析第70-72页
   ·基因沉默载体构建及侵染体系的建立第72-73页
     ·目的基因沉默载体构建第72页
     ·农杆菌侵染体系的建立第72-73页
4 讨论第73-78页
   ·Cf-19基因的遗传规律第73-74页
   ·Cf-19基因介导的过敏性坏死特点第74-75页
     ·Cf-4、Cf-9 和Cf-19基因介导的过敏性坏死特征对比分析第74页
     ·Cf-19基因介导的抗病应答过程中关键时间点的确定第74-75页
   ·Cf-19基因的候选基因特征分析第75-76页
     ·候选基因Solyc01g006550.2.1 为Cf-4/9 基因位点的Hcr9s新成员第75-76页
     ·候选基因与其它Cf基因的进化关系分析第76页
   ·分子标记P7可应用于分子标记辅助选择育种第76页
   ·父、母本重测序与SLAF-seq结合使用可以提高定位效率第76-77页
   ·Cf-19基因介导的抗性应答反应中的重要差异表达基因第77-78页
   ·VIGS侵染体系第78页
5 结论第78-79页
6 创新点第79-80页
致谢第80-81页
参考文献第81-89页
攻读博士学位期间发表的学术论文第89页

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