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拟盘多毛孢属(Pestalotiopsis)真菌系统学研究及条形码基因的评价

摘要第1-8页
Abstract第8-10页
第一部分 综述第10-16页
 1. 类拟盘多毛孢真菌分类学第10-12页
   ·属间分类第10-11页
   ·属内分类第11-12页
 2. DNA条形码技术第12-14页
   ·DNA条形码技术的发展第12-13页
   ·类拟盘多毛孢真菌的条形码标签研究第13-14页
 3. 类拟盘多毛孢真菌分类趋势第14页
 4. 类拟盘多毛孢真菌的经济重要性第14-15页
   ·重要植物病原菌第14页
   ·开发新药物第14-15页
 5. 本课题的研究内容及意义第15-16页
   ·研究内容第15页
   ·研究意义第15-16页
第二部分 研究内容第16-78页
 1. 材料与方法第16页
   ·菌株来源第16页
   ·仪器与试剂第16页
 2.形态学研究方法第16-17页
   ·培养基的制作第16-17页
     ·单孢分离培养基第16页
     ·培养鉴定培养基第16-17页
   ·标本处理和分离纯化第17页
   ·菌种保存第17页
   ·描述鉴定第17页
 3.分子系统学研究方法第17-20页
   ·DNA的提取第17-18页
   ·PCR引物和反应体系第18-19页
     ·ITS (Internal Transcribed Spacer,内转录间隔区)基因片段第18页
     ·β-tubulin(微管蛋白) 基因片段第18页
     ·tef1(translation elongation factor 1)基因片段第18-19页
   ·PCR产物检测和测序第19页
   ·分子数据处理第19-20页
     ·序列检测第19页
     ·序列比对第19页
     ·系统发育树的建立第19-20页
     ·条形码基因的筛选和评价第20页
 4.结果与分析第20-78页
   ·分子系统学分析第20-27页
     ·ITS基因标签分析第20页
     ·β-tubulin基因标签分析第20-21页
     ·tef1基因标签分析第21页
     ·ITS,β-tubulin和tef1基因片段的加合序列分析第21-27页
       ·拟盘多毛孢属(Pestalotiopsis)菌株的加合序列分析第21页
       ·新拟盘多毛孢属 ( Neopestalotiopsis ) 和假拟盘多毛孢属(Pseudopestalotiopsis)菌株的加合序列分析第21-22页
       ·加合分析结果第22-27页
   ·本研究分离的菌株的鉴定和描述第27-78页
     ·新种的鉴定和描述第27-70页
       ·鱼尾葵新拟盘多毛孢(Neopestalotiopsis caryotae)(图 6)第27-29页
       ·香樟新拟盘多毛孢(Neopestaloiopsis cinnamomumae)(图 7)第29-32页
       ·咖啡新拟盘多毛孢(Neopestalotiopsis coffeae-arabicae)(图 8)第32-35页
       ·Neopestalotiopsis. podocarpusis(图 10)第35-37页
       ·罗汉松新拟盘多毛孢(N. podocarpus-macrophyllus)(图 11)第37-39页
       ·N. pseudoaustralis (图 12)第39-42页
       ·N. pseudosaprophyta (图 13)第42-44页
       ·N. strelitziae(图 14)第44-46页
       ·Pestalotiopsis camellia-sinensis(图 15)第46-48页
       ·饭甑青冈拟盘多毛孢(P. cyclobalanopsis)(图 16)第48-50页
       ·巴西木拟盘多毛孢(P. dracaenea)(图 17)第50-52页
       ·P. keteleeria(图 18)第52-56页
       ·荔波拟盘多毛孢(P. libosis)(图 20)第56-57页
       ·李拟盘多毛孢(P. prunui)(图 21)第57-59页
       ·桃金娘拟盘多毛孢(P. rhodomyrtus)(图 22)第59-62页
       ·娑罗树拟盘多毛孢(P. shorea)图 23第62-65页
       ·P. subshorea(图 25)第65-67页
       ·Pseudopestalotiopsis simitheae(图 26)第67-70页
     ·已报道种的鉴定和描述第70-76页
       ·卵圆新拟盘多毛孢(Neopestalotiopsis ellipsospora)(图 27)第70页
       ·N. foedans(图 28)第70-72页
       ·藜芦新拟盘多毛孢(N. leucothoes)(图 29)第72-73页
       ·山龙眼新拟盘多毛孢(N. protearum)(图 30)第73-74页
       ·Pestalotiopsis colombiensis(图 31)第74-76页
       ·Pseudopestalotiopsis theae(图 32)第76页
     ·未定种第76-78页
第三部分 总结与讨论第78-82页
 1.总结第78-79页
   ·类拟盘多毛孢真菌(Pestalotiopsis-like fungi)的多样性第78页
     ·来源多样性第78页
     ·种类多样性第78页
   ·拟盘多毛孢属(Pestalotiopsis)真菌DNA条形码分子标签评价第78-79页
     ·ITS基因标签的评价第78-79页
     ·β-tubulin基因标签的评价第79页
     ·tef1基因标签的评价第79页
     ·ITS,β-tubulin和tef1三个基因的加合序列分析第79页
 2. 讨论第79-82页
   ·本研究对分子系统学的意义第79-80页
   ·类拟盘多毛孢真菌分类研究中存在的问题第80页
     ·菌种失活及诱导产孢困难第80页
     ·序列的大批量处理耗时第80页
   ·类拟盘多毛孢真菌分类研究新思考第80-81页
   ·类拟盘多毛孢真菌分类学发展前景第81-82页
参考文献第82-87页
致谢第87-88页
附录第88-100页

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